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稻瘟病菌异柠檬酸裂解酶基因(ICL1)在致病过程中的作用

1. 文献综述与前言第14-36页
    1.1 稻瘟病菌与稻瘟病第14-15页
    1.2 稻瘟病菌的生活史、病害循环与防治第15-16页
    1.3 稻瘟病菌的侵入过程第16-24页
        1.3.1 稻瘟病菌的侵染前期第16-19页
            1.3.1.1 稻瘟病菌分生孢子的吸附、萌发和附着胞形成第16-18页
            1.3.1.2 稻瘟病菌附着胞形成的诱导因子和表面识别第18-19页
        1.3.2 稻瘟病菌的侵入第19-23页
        1.3.3 稻瘟病菌在寄主中的定殖第23-24页
    1.4 稻瘟病菌附着胞形成过程的信号传导与调控第24-29页
    1.5 稻瘟病菌致病相关基因第29-31页
    1.6 附着胞内甘油合成的前体物质第31-32页
    1.7 附着胞形成过程的脂肪代谢第32-34页
    1.8 异柠檬酸裂解酶第34-35页
    1.9 本研究的目的与意义第35-36页
2 材料与方法第36-50页
    2.1 实验菌株、保存与培养条件第36页
    2.2 ICL1基因片段的PCR扩增第36-37页
    2.3 GUY11的基因组文库和分生孢子的cDNA文库筛选第37-40页
        2.3.1 GUY11的λ基因组文库筛选第37-38页
        2.3.2 GUY11的cosmid基因组文库筛选第38页
        2.3.3 GUY11的分生孢子cDNA文库筛选第38页
        2.3.4 λ噬菌体DNA的提取第38-39页
        2.3.5 含ICL1 cDNA的Bluescript质粒拯救第39-40页
    2.4 DNA操作与分析第40-45页
        2.4.1 CTAB法大量提取基因组DNA第40-41页
        2.4.2 DNA操作方法第41页
        2.4.3 基因组DNA的限制性酶切第41页
        2.4.4 DNA琼脂糖凝胶电泳第41页
        2.4.5 DNA片段的胶回收第41-42页
        2.4.6 Southern转移第42页
        2.4.7 DNA探针制备第42页
        2.4.8 Southern杂交第42-43页
        2.4.9 DNA克隆程序第43-45页
            2.4.9.1 质粒的少量快速提取第43页
            2.4.9.2 高纯度质粒DNA的少量或大量提取第43页
            2.4.9.3 DNA连接第43-44页
            2.4.9.4 感受态细胞的制备第44-45页
            2.4.9.5 细菌转化第45页
    2.5 ICL1 cDNA和基因组DNA序列分析第45页
    2.6 稻瘟病菌的转化与转化子DNA提取第45-47页
        2.6.1 稻瘟病菌原生质体制备第45-46页
        2.6.2 DNA转化第46页
        2.6.3 CTAB法提取转化子DNA第46-47页
    2.7 突变体的表型分析第47-49页
        2.7.1 野生菌株、ectopic转化子及ICL1突变体生长速度比较第47页
        2.7.2 M.grisea分生孢子萌发及附着胞形成第47-48页
        2.7.3 附着胞膨压测定第48页
        2.7.4 脂肪微滴的移动第48页
        2.7.5 ICL1突变体在不同培养基上的生长表型第48-49页
    2.8 ICL1突变体的互补转化第49页
    2.9 致病性测定第49页
    2.10 GFP与ICL1启动子的融合表达第49-50页
3 结果与分析第50-90页
    3.1 ICL1基因片段的PCR扩增第50-51页
        3.1.1 引物设计与PCR反应第50页
        3.1.2 PCR产物的克隆与序列分析第50-51页
    3.2 ICL1基因在GUY11基因组DNA中的拷贝数第51页
    3.3 GUY11的基因组文库和分生孢子的cDNA文库筛选第51-53页
        3.3.1 GUY11的λ基因组文库筛选第51-52页
        3.3.2 GUY11的cosmid基因组文库筛选第52-53页
        3.3.3 GUY11的分生孢子λcDNA文库筛选第53页
    3.4 ICL1基因位点片段的亚克隆和ICL1 cDNA的鉴定与序列分析第53-63页
        3.4.1 ICL1基因位点片段的亚克隆第53-55页
        3.4.2 含ICL1 cDNA的Bluescript质粒拯救与序列分析第55-57页
        3.4.3 ICL1基因位点的基因组DNA序列、cDNA序列和推测的蛋白序列第57-63页
    3.5 ICL1基因位点的限制性酶切图谱与ICL1基因置换载体的构建第63-67页
        3.5.1 ICL1基因位点的限制性酶切图谱第63页
        3.5.2 ICL1基因置换载体的构建第63-67页
            3.5.2.1 潮霉素抗性基因(HPH)的PCR扩增、克隆与鉴定第63-64页
            3.5.2.2 ICL1基因置换载体构建的策略第64-66页
            3.5.2.3 ICL1基因置换载体的鉴定第66-67页
    3.6 真菌转化与△ICL1突变体的获得第67-70页
        3.6.1 ICL1基因敲除(Knock out)转化第67页
        3.6.2 M.grisea ICL1基因的目标置换过程第67-69页
        3.6.3 ΔICL1突变体的PCR和Southern杂交鉴定第69-70页
    3.7 ΔICL1突变体的表型(Phenotypes)分析第70-85页
        3.7.1 ΔICL1突变体在CM培养基上的菌落形态、生长速度与产孢第70-73页
        3.7.2 ΔICL1突变体对不同碳源的利用第73页
        3.7.3 ΔICL1突变体的分生孢子萌发、附着胞形成第73-77页
        3.7.4 ΔICL1突变体的附着胞膨压第77-79页
        3.7.5 ΔICL1突变体萌发过程中的脂肪微滴移动第79页
        3.7.6 ΔICL1突变体对洋葱内表皮的穿透作用第79-82页
        3.7.7 ΔICL1突变体对水稻和大麦的致病性第82-85页
    3.8 ICL1基因的时空表达分析第85-88页
        3.8.1 ICL1基因启动子与绿色荧光蛋白基因(GFP)的融合第85-87页
        3.8.2 ICL1基因的时空表达第87-88页
    3.9 ΔICL1突变体的互补第88-90页
4 讨论第90-96页
5 参考文献第96-106页

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