| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 主要符号缩略表 | 第10-11页 |
| 引言 | 第11-13页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-21页 |
| 1.1 真菌多样性方法研究 | 第14-16页 |
| 1.2 高通量测序技术概述 | 第16-18页 |
| 1.2.1 Illumina Solexa测序法 | 第16页 |
| 1.2.2 Roche 454测序技术 | 第16-17页 |
| 1.2.3 SOLiD测序法 | 第17页 |
| 1.2.4 高通量测序在土壤微生多样性的研究中的应用 | 第17-18页 |
| 1.3 基因组生物信息学流程概述 | 第18-20页 |
| 1.4 本研究的目的和意义 | 第20页 |
| 1.4.1 研究目的 | 第20页 |
| 1.4.2 研究意义 | 第20页 |
| 1.5 主要研究内容 | 第20-21页 |
| 第二章 基于克隆文库法对真菌群落结构多样性及其系统发育分析 | 第21-34页 |
| 2.1 材料和方法 | 第21-23页 |
| 2.1.1 样品采集与处理 | 第21-22页 |
| 2.1.2 测序及数据处理 | 第22-23页 |
| 2.1.3 系统发育树的构建 | 第23页 |
| 2.2 天山一号冰川样品理化性质 | 第23页 |
| 2.3 真菌的多样性及群落结构 | 第23-30页 |
| 2.3.1 Fz文库和Dz文库的群落结构多样性分析 | 第23-26页 |
| 2.3.2 Fz&Dz文库群落结构多样性的研究 | 第26-27页 |
| 2.3.3 Fz和Dz样品真菌OTU系统发育及其最相近生态位 | 第27-30页 |
| 2.4 讨论 | 第30-32页 |
| 2.5 本章小结 | 第32-34页 |
| 第三章 基于高通量测序对一号冰川底部沉积层真菌群落结构的研究 | 第34-54页 |
| 3.1 材料与方法 | 第34-35页 |
| 3.1.1 样品采集及处理 | 第34页 |
| 3.1.2 DNA的提取与检测 | 第34页 |
| 3.1.3 PCR扩增的试剂及程序 | 第34-35页 |
| 3.2 数据处理分析 | 第35-36页 |
| 3.3 结果与分析 | 第36-50页 |
| 3.3.1 数据的质控处理与结果分析 | 第36-40页 |
| 3.3.2 数据的多样性指数分析 | 第40-43页 |
| 3.3.3 样品的相关性分析 | 第43-48页 |
| 3.3.4 样品在门、属水平上的群落结构分析 | 第48-50页 |
| 3.4 讨论 | 第50-53页 |
| 3.5 本章小结 | 第53-54页 |
| 第四章 结论与展望 | 第54-56页 |
| 4.1 结论 | 第54页 |
| 4.2 展望 | 第54-55页 |
| 4.3 创新点 | 第55-56页 |
| 参考文献 | 第56-61页 |
| 致谢 | 第61-62页 |
| 作者简介 | 第62-63页 |
| 导师评阅表 | 第63页 |
