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鸡PGCs生成过程中C1EIP基因调控机制的研究

中文摘要第3-8页
ABSTRACT第8-13页
缩略词表第20-21页
主要仪器第21-22页
第一章 文献综述第22-44页
    1 原始生殖细胞第22-35页
        1.1 原始生殖细胞的起源与迁移第22-24页
        1.2 原始生殖细胞的生物学特性第24-25页
        1.3 原始生殖细胞的研究进展第25-26页
        1.4 原始生殖细胞的应用第26-27页
        1.5 原始生殖细胞形成的调控因素第27-35页
            1.5.1 关键基因对PGCs形成的调控第27-29页
            1.5.2 信号通路对PGCs形成的调控第29-31页
            1.5.3 生长因子对PGCs形成的调控第31-33页
            1.5.4 表观遗传对PGCs形成的调控第33-35页
    2 本研究的目的和意义第35页
    参考文献第35-44页
第二章 鸡C1EIP生物信息学分析及亚细胞定位研究第44-64页
    1. 实验材料与方法第45-52页
        1.1 实验材料第45-46页
            1.1.1 实验材料第45页
            1.1.2 实验试剂第45-46页
        1.2 实验方法第46-52页
            1.2.1 候选特异基因的生物信息学分析第46-47页
            1.2.2 如皋黄鸡生殖嵴组织cDNA文库的建立第47页
                1.2.2.1 如皋黄鸡生殖嵴组织总RNA提取第47页
                1.2.2.2 如皋黄鸡生殖嵴组织cDNA文库的建立第47页
            1.2.3 C1EIP真核表达载体构建第47-48页
                1.2.3.1 pEGFP-C1EIP融合表达载体的构建第48页
                1.2.3.2 pcDNA3.0-C1EIP真核表达载体的构建第48页
            1.2.4 鸡DF1细胞培养、传代、冻存、复苏及转染第48-50页
                1.2.4.1 DF细胞的培养及传代第48-49页
                1.2.4.2 DF1细胞的冻存及复苏第49-50页
                1.2.4.3 DF1细胞的转染第50页
            1.2.5 C1EIP真核表达载体表达产物中C1EIP mRNA检测第50页
            1.2.6 基因免疫法制备抗鸡C1EIP血清第50-52页
                1.2.6.1 免疫程序第50页
                1.2.6.2 抗C1EIP血清效价的检测第50-51页
                1.2.6.3 抗C1EIP血清特异性的检测第51-52页
    2 实验结果第52-60页
        2.1 C1EIP生物信息学分析结果第52-54页
            2.1.1 C1EIP蛋白质结构及功能的生物信息学分析第52页
            2.1.2 蛋白质的二级结构分析第52-53页
            2.1.3 蛋白质的三级结构分析第53页
            2.1.4 亚细胞定位和蛋白质信号肽预测第53页
            2.1.5 蛋白质功能结构域预测第53页
            2.1.6 磷酸化位点预测第53页
            2.1.7 糖基化位点预测第53-54页
            2.1.8 基因及蛋白质的同源分析第54页
        2.2 鸡C1EIP真核表达载体构建与鉴定第54-56页
        2.3 鸡C1EIP异位表达及亚细胞定位第56-57页
        2.4 转染细胞基因转录水平表达检测第57-58页
        2.5 转染细胞C1EIP-EGFP融合蛋白表达检测第58页
        2.6. 基因免疫法制备抗鸡C1EIP血清第58-60页
            2.6.1 IFA检测抗血清效价第58-59页
            2.6.2 抗体特异性检测第59-60页
    3 讨论第60-61页
    4 本章小结第61-62页
    参考文献第62-64页
第三章 C1EIP调控鸡PGCs生成的功能研究第64-93页
    1 材料与方法第64-72页
        1.1 实验材料和试剂第64-65页
            1.1.1 实验材料第64页
            1.1.2 实验试剂第64-65页
        1.2 实验方法第65-72页
            1.2.1 C1EIP慢病毒干扰载体构建及慢病毒包裹第65页
            1.2.2 慢病毒干扰载体干扰活性检测第65-66页
            1.2.3 ESCs的分离培养与鉴定第66页
            1.2.4 体外诱导检测第66-68页
                1.2.4.1 鸡ESCs体外诱导分化试验第66-67页
                1.2.4.2 实时荧光定量PCR检测相关基因表达第67-68页
                1.2.4.3 细胞免疫化学检测相关抗原第68页
                1.2.4.4 流式细胞分析检测PGCs比例第68页
            1.2.5 体内鸡胚慢病毒注射第68-72页
                1.2.5.1 慢病毒对鸡孵化率影响的摸索第68-69页
                1.2.5.2 慢病毒整合鸡胚基因组检测第69-70页
                1.2.5.3 实时荧光定量PCR检测相关基因表达第70-71页
                1.2.5.4 PAS染色法检测PGCs第71页
                1.2.5.5 免疫组织化学检测第71页
                1.2.5.6 流式细胞分析检测各组PGCs比例第71-72页
            1.2.7 统计分析第72页
    2 实验结果第72-88页
        2.1 慢病毒RNA干扰质粒C1EIP-shRNA和阴性对照质粒的构建第72-74页
        2.2 慢病毒干扰载体干扰活性检测第74-75页
        2.3 体外诱导检测第75-81页
            2.3.1 ESCs形态变化观察第75-77页
            2.3.2 体外PGCs生成效率检测第77-81页
        2.4 体内鸡胚慢病毒注射第81-88页
            2.4.1 慢病毒注射剂量对鸡孵化率影响的摸索第81-82页
            2.4.2 慢病毒整合鸡胚基因组检测第82-84页
            2.4.3 PGCs生成效率检测第84-88页
    3 讨论第88-90页
    4 本章小结第90-91页
    参考文献第91-93页
第四章 影响鸡C1EIP转录调控因素的探究第93-116页
    1 材料与方法第93-101页
        1.1 实验材料和试剂第93-94页
            1.1.1 实验材料和载体第93页
            1.1.2 实验试剂第93-94页
        1.2 实验方法第94-101页
            1.2.1 如皋黄鸡C1EIP启动子区域的生物学信息学分析第94页
            1.2.2 鸡胚全基因组的提取第94页
            1.2.3 真核表达载体pC1EIP-EGFP的构建第94-96页
                1.2.3.1 C1EIP启动子区域克隆第94页
                1.2.3.2 PCR产物和载体的酶切、连接反应第94-95页
                1.2.3.3 连接产物转化感受态第95页
                1.2.3.4 阳性菌落鉴定第95-96页
            1.2.4 鸡C1EIP启动子活性定性分析第96页
                1.2.4.1 DF1细胞的冻存与复苏第96页
                1.2.4.2 pC1EIP-EGFP质粒去内毒提取第96页
                1.2.4.3 pC1EIP-EGFP质粒转染第96页
            1.2.5 鸡C1EIP核心启动子区域的鉴定第96-99页
                1.2.5.1 鸡C1EIP启动子各缺失片段的克隆及亚克隆第96-98页
                1.2.5.2 PGL3-basic重组载体的构建与鉴定第98-99页
                1.2.5.3 鸡C1EIP启动子核心区域鉴定第99页
            1.2.6 鸡C1EIP核心启动子区域调控元件的分析第99-100页
                1.2.6.1 C1EIP启动子区域生物信息学分析第99-100页
                1.2.6.2 转录因子结合位点缺失的启动子报告基因载体的构建第100页
                1.2.6.3 转录因子结合位点缺失质粒的荧光素酶活性检测分析第100页
            1.2.7 鸡C1EIP基因核心启动子DNA甲基化和组蛋白乙酰化分析第100-101页
                1.2.7.1 5-Azadc、TSA和VPA对C1EIP启动子活性的诱导第101页
                1.2.7.2 5-Azadc、TSA和VAP对C1EIP在ESCs、SSCs和PGCs的表达分析第101页
    2 实验结果第101-110页
        2.1 鸡胚全基因组的提取第101-102页
        2.2 真核表达载体pC1EIP-EGFP的构建第102页
        2.3 C1EIP启动子活性定性分析第102-103页
        2.4 C1EIP启动子各缺失克隆载体和亚克隆载体的构建第103-104页
        2.5 C1EIP启动子活性分析第104-105页
        2.6 转录因子结合位点对C1EIP启动子活性的影响第105-108页
        2.7 C1EIP启动子DNA甲基化和组蛋白乙酰化分析第108-109页
        2.8 DNA甲基化和组蛋白乙酰化对C1EIP在ESCs、PGCs和SSCs中表达变化的影响第109-110页
    3 讨论第110-112页
    4 本章小结第112页
    参考文献第112-116页
第五章 C1EIP互作蛋白ENO1的筛查与鉴定第116-132页
    1 材料与方法第116-122页
        1.1 实验材料和试剂第116-117页
            1.1.1 实验材料和载体第116页
            1.1.2 实验试剂第116-117页
        1.2 实验方法第117-122页
            1.2.1 鸡C1EIP基因原核表达载体pET-49b-C1EIP的构建与鉴定第117页
            1.2.2 GST pull-down筛查C1EIP互作蛋白第117-120页
            1.2.3 融合表达载体pcDNA3.0-ENO1-HA的构建与鉴定第120页
            1.2.4 融合表达载体pcDNA3.0-ENO1-HA转染效果鉴定第120-121页
            1.2.5 转染细胞ENO1-HA融合基因RNA水平表达检测第121页
            1.2.6 转染细胞ENO1-HA融合蛋白水平表达检测第121页
            1.2.7 免疫共沉淀第121-122页
    2 实验结果第122-128页
        2.1 鸡C1EIP原核表达载体pET-49b-C1EIP的构建与鉴定第122-123页
        2.2 GST pull-down筛查C1EIP互作蛋白第123页
        2.3 融合表达载体pcDNA3.0-ENO1-HA的构建与鉴定第123-125页
        2.4 融合表达载体pcDNA3.0-ENO1-HA转染效果鉴定第125-126页
        2.5 转染细胞ENO1-HA融合基因转录水平表达检测第126-127页
        2.6 转染细胞ENO1-HA融合蛋白表达检测第127-128页
        2.7 免疫共沉淀第128页
    3 讨论第128-130页
    4 本章小结第130页
    参考文献第130-132页
第六章 C1EIP与ENO1/MBP-1互作调控PGCs生成机制的初步探究第132-149页
    1 材料与方法第132-136页
        1.1 实验材料和试剂第132-133页
            1.1.1 实验材料和载体第132页
            1.1.2 实验试剂第132-133页
        1.2 实验方法第133-136页
            1.2.1 ENO1生物信息学分析第133页
            1.2.2 实时荧光定量PCR检测相关基因表达第133页
            1.2.3 重组表达载体PGL3-Myc-pro的构建与鉴定第133-134页
            1.2.4 重组表达载体pcDNA3.0-MBP-1与pcDNA3.0-ENO2载体的构建与鉴定第134-135页
            1.2.5 Myc启动子活性分析第135-136页
            1.2.6 绘制C1EIP与ENO1/MBP-1互作调控PGCs生成的作用模式图第136页
    2 实验结果第136-144页
        2.1 ENO1生物信息学分析第136-137页
        2.2 实时荧光定量PCR检测相关基因表达第137-140页
        2.3 重组表达载体PGL3-Myc-pro的构建与鉴定第140页
        2.4 重组表达载体pcDNA3.0-MBP-1与pcDNA3.0-ENO2载体的构建与鉴定第140-142页
        2.5 Myc启动子活性分析第142-143页
        2.6 绘制C1EIP与ENO1/MBP-1互作调控PGCs生成的作用模式图第143-144页
    3 讨论第144-146页
    4 本章小结第146页
    参考文献第146-149页
第七章 全文结论和创新点第149-151页
    全本结论第149-150页
    全文创新点第150-151页
附录第151-154页
致谢第154-156页
攻读学位期间发表的论文第156-158页

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