| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 第1章 绪论 | 第13-25页 |
| 1.1 深海热液区分布概况 | 第13页 |
| 1.2 深海热液喷口的形成及分类 | 第13-14页 |
| 1.3 深海热液的化学特征 | 第14-15页 |
| 1.4 深海热液生态系统与生命起源 | 第15-19页 |
| 1.4.1 深海热液生态系统食物链的基石——化能自养微生物 | 第15-16页 |
| 1.4.2 化能自养微生物的CO_2固定途径 | 第16-19页 |
| 1.5 冲绳海槽的热液区 | 第19-20页 |
| 1.6 马努斯海盆的热液区 | 第20-22页 |
| 1.6.1 Pacmanus热液区 | 第20-21页 |
| 1.6.2 Desmos热液区 | 第21-22页 |
| 1.7 高通量测序技术应用于深海热液系统研究 | 第22-23页 |
| 1.7.1 16S rRNA扩增子测序 | 第22页 |
| 1.7.2 宏基因组测序 | 第22-23页 |
| 1.8 本研究的目的和意义 | 第23-25页 |
| 第2章 冲绳海槽沉积物微生物群落的结构与代谢分析 | 第25-55页 |
| 2.1 材料与方法 | 第26-30页 |
| 2.1.1 采样位点及沉积物样品信息 | 第26-28页 |
| 2.1.2 总有机碳和总氮的测定 | 第28页 |
| 2.1.3 DNA提取 | 第28页 |
| 2.1.4 宏基因组测序、组装和注释 | 第28-29页 |
| 2.1.5 进化分析 | 第29-30页 |
| 2.1.6 数据提交 | 第30页 |
| 2.2 结果与讨论 | 第30-54页 |
| 2.2.1 宏基因组序列的物种分布 | 第30-35页 |
| 2.2.2 微生物的功能基因 | 第35-50页 |
| 2.2.3 沉积物微生物群落运行机制 | 第50-54页 |
| 2.3 小结 | 第54-55页 |
| 第3章 伊平屋热液区微生物深海环境适应机制的宏基因组学分析 | 第55-78页 |
| 3.1 材料与方法 | 第56页 |
| 3.1.1 样品采集 | 第56页 |
| 3.1.2 沉积物组分的化学分析 | 第56页 |
| 3.1.3 DNA提取 | 第56页 |
| 3.1.4 文库构建、宏基因组测序、组装和注释 | 第56页 |
| 3.1.5 进化分析 | 第56页 |
| 3.1.6 数据提交 | 第56页 |
| 3.2 结果与讨论 | 第56-77页 |
| 3.2.1 细胞膜磷脂与多聚-γ-谷氨酸的合成 | 第58-63页 |
| 3.2.2 多胺代谢及其稳态 | 第63-65页 |
| 3.2.3 渗透压稳态 | 第65-71页 |
| 3.2.4 pH稳态 | 第71-73页 |
| 3.2.5 Na~+稳态 | 第73-75页 |
| 3.2.6 重金属泵 | 第75-77页 |
| 3.3 小结 | 第77-78页 |
| 第4章 马努斯海盆热液沉积物微生物群落结构与代谢分析 | 第78-108页 |
| 4.1 材料与方法 | 第79-82页 |
| 4.1.1 样品采集 | 第79-80页 |
| 4.1.2 沉积物化学成分分析 | 第80页 |
| 4.1.3 DNA提取 | 第80页 |
| 4.1.4 16S rRNA扩增子测序与分析 | 第80-81页 |
| 4.1.5 宏基因组测序与分析 | 第81-82页 |
| 4.1.6 进化分析 | 第82页 |
| 4.2 结果与讨论 | 第82-107页 |
| 4.2.1 沉积物的化学组成特征 | 第82-83页 |
| 4.2.2 微生物群落结构 | 第83-88页 |
| 4.2.3 基于宏基因组学的微生物群落代谢特征 | 第88-107页 |
| 4.3 小结 | 第107-108页 |
| 结论 | 第108-110页 |
| 参考文献 | 第110-133页 |
| 致谢 | 第133-134页 |
| 作者简历及攻读学位期间发表的学术论文与研究成果 | 第134-135页 |
