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计算预测六倍体小麦、乌拉尔图小麦和粗山羊草基因组中Helitron转座元件

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
第一章 文献综述第11-24页
    1.1 转座子家族的简介第11-15页
        1.1.1 转座子的分类第11页
        1.1.2 Class I型转座子第11-14页
        1.1.3 Class II型转座子第14-15页
    1.2 Helitron转座元件第15-21页
        1.2.1 Helitron转座子的研究现状第15-18页
        1.2.2 Helitron转座子的基因捕获与转座机制第18-20页
        1.2.3 Helitron元件的预测方法第20-21页
            1.2.3.1 传统生物学方法鉴定Helitron元件第20页
            1.2.3.2 基于计算的方法鉴定基因组中Helitron元件第20-21页
    1.3 六倍体小麦的研究现状第21-23页
        1.3.1 六倍体小麦的简介第21-22页
        1.3.2 六倍体小麦的转座元件第22-23页
    1.4 本研究的目的与意义第23-24页
第二章 六倍体小麦与其祖先基因组中Helitron元件的预测第24-28页
    2.1 实验数据第24页
    2.2 实验方法第24-25页
        2.2.1 搜索六倍体小麦、乌拉尔图小麦以及粗山羊草基因组中Helitron元件第24页
        2.2.2 估计基因组中Helitron的含量第24-25页
    2.3 实验结果第25-27页
        2.3.1 Helitron预测结果第25-27页
        2.3.2 估计 Helitron 在基因组中的含量第27页
    2.4 讨论第27-28页
第三章 Helitron家族分类以及插入时间的估计第28-31页
    3.1 实验数据第28页
    3.2 实验方法第28页
    3.3 实验结果第28-30页
    3.4 讨论第30-31页
第四章 自主Helitron元件的鉴定与基因捕获第31-36页
    4.1 实验数据第31页
    4.2 实验方法第31页
        4.2.1 自主元件的鉴定第31页
        4.2.2 Helitron捕获基因的鉴定第31页
    4.3 实验结果第31-35页
        4.3.1 小麦族Helitron自主元件第31-33页
        4.3.2 Helitron基因捕获第33-35页
    4.4 讨论第35-36页
第五章 In silico以及实验验证小麦Helitron转座元件第36-40页
    5.1 实验数据第36页
    5.2 实验方法第36-37页
        5.2.1 In silico验证小麦基因组中的Helitron元件第36页
        5.2.2 实验验证Helitron元件的多样性第36-37页
    5.3 实验结果第37-39页
        5.3.1 In silico验证结果第37-38页
        5.3.2 实验验证结果第38-39页
    5.4 讨论第39-40页
第六章 讨论和结论第40-42页
    6.1 讨论第40-41页
    6.2 结论第41-42页
参考文献第42-47页
附录第47-55页
致谢第55-56页
作者简介第56页

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