| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4页 |
| 第1章 绪论 | 第7-15页 |
| 1.1 研究背景 | 第7-12页 |
| 1.1.1 贲门癌概述 | 第7-8页 |
| 1.1.2 生物信息学在肿瘤中的应用 | 第8-11页 |
| 1.1.3 长链非编码RNA | 第11-12页 |
| 1.2 研究目的 | 第12-13页 |
| 1.3 研究意义 | 第13-15页 |
| 第2章 材料与方法 | 第15-25页 |
| 2.1 样本的选择 | 第15-16页 |
| 2.2 RNA的提取 | 第16页 |
| 2.3 DNA芯片技术 | 第16-17页 |
| 2.4 RNA的标记和杂化矩阵 | 第17页 |
| 2.5 GO和pathway分析 | 第17-18页 |
| 2.6 CNC网络图构建 | 第18页 |
| 2.7 qRT-PCR验证 | 第18-21页 |
| 2.7.1 cDNA第一链合成 | 第18-19页 |
| 2.7.2 引物设计 | 第19-20页 |
| 2.7.3 qRT-PCR | 第20-21页 |
| 2.8 LncRNA慢病毒过表达质粒构建及靶细胞转染 | 第21-22页 |
| 2.8.1 病毒滴度检测 | 第21页 |
| 2.8.2 MOI值筛选 | 第21页 |
| 2.8.3 病毒转染 | 第21-22页 |
| 2.9 流式细胞仪检测细胞凋亡 | 第22-23页 |
| 2.10 统计分析方法 | 第23-25页 |
| 第3章 结果 | 第25-45页 |
| 3.1 差异表达的lncRNAs | 第25-28页 |
| 3.2 差异表达的mRNAs | 第28-31页 |
| 3.3 基因功能富集分析 | 第31-36页 |
| 3.3.1 GO分析 | 第32-35页 |
| 3.3.2 Pathway分析 | 第35-36页 |
| 3.4 基因共表达网络 | 第36-39页 |
| 3.4.1 Cytoscape | 第36-37页 |
| 3.4.2 基因共表达网络构建的意义 | 第37页 |
| 3.4.3 构建基因共表达网络的方法 | 第37页 |
| 3.4.4 基因共表达网络的描述 | 第37-39页 |
| 3.5 qRT-PCR及相关性分析 | 第39-41页 |
| 3.6 lncRNA慢病毒过表达质粒构建及靶细胞转染 | 第41-43页 |
| 3.6.1 慢病毒表达载体的构建 | 第41-42页 |
| 3.6.2 慢病毒包装及病毒滴度检测 | 第42页 |
| 3.6.3 病毒转染靶细胞及细胞筛选 | 第42-43页 |
| 3.7 流式细胞仪检测细胞凋亡 | 第43-45页 |
| 第4章 讨论 | 第45-51页 |
| 结论 | 第51-53页 |
| 参考文献 | 第53-59页 |
| 缩略语词汇表 | 第59-61页 |
| 致谢 | 第61-63页 |
| 攻读学位期间的学术成果 | 第63页 |