| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一章 绪论 | 第11-36页 |
| 1.1 金属镍生物材料的生物相容性研究 | 第11-15页 |
| 1.1.1 生物材料的生物相容性研究 | 第11-13页 |
| 1.1.2 镍钛合金生物材料及镍的生物相容性研究现状 | 第13-15页 |
| 1.2 蛋白质组学技术在生物材料生物相容性研究中的应用 | 第15-20页 |
| 1.2.1 蛋白质组学技术简介 | 第15-18页 |
| 1.2.2 蛋白质组学数据的生物信息学分析 | 第18-19页 |
| 1.2.3 蛋白质组学技术在生物材料生物相容性研究中的应用 | 第19-20页 |
| 1.3 代谢组学技术在生物材料生物相容性研究中的应用 | 第20-26页 |
| 1.3.1 代谢组学技术简介 | 第20-22页 |
| 1.3.2 代谢组学数据处理方法 | 第22-25页 |
| 1.3.3 代谢组学数据的生物信息学分析 | 第25-26页 |
| 1.3.4 代谢组学技术在生物材料生物相容性研究中的应用 | 第26页 |
| 1.4 系统生物学 | 第26-28页 |
| 1.4.1 系统生物学简介 | 第26-27页 |
| 1.4.2 多组学技术联合分析在生物材料生物相容性研究中的应用 | 第27-28页 |
| 1.5 本论文的主要内容 | 第28-29页 |
| 1.6 参考文献 | 第29-36页 |
| 第二章 镍离子与L929细胞作用的蛋白质组学实验及数据分析 | 第36-75页 |
| 2.1 基于iTRAQ技术的蛋白质组学实验 | 第36-44页 |
| 2.1.1 实验过程 | 第36-37页 |
| 2.1.2 实验原理 | 第37-39页 |
| 2.1.3 实验材料与实验仪器 | 第39-40页 |
| 2.1.4 主要溶液的配制 | 第40-41页 |
| 2.1.5 实验方法及步骤 | 第41-43页 |
| 2.1.6 实验结果及讨论 | 第43-44页 |
| 2.2 蛋白质组学实验数据的生物信息学分析 | 第44-66页 |
| 2.2.1 Cluster & Treeview聚类分析 | 第44-46页 |
| 2.2.2 GO功能分析 | 第46-48页 |
| 2.2.3 生物学通路分析 | 第48-66页 |
| 2.3 蛋白质组学实验的验证实验 | 第66-71页 |
| 2.3.1 蛋白质组学结果的Western blot验证实验 | 第66-68页 |
| 2.3.2 ATP能量代谢检测实验 | 第68-71页 |
| 2.4 本章小结 | 第71-72页 |
| 2.5 参考文献 | 第72-75页 |
| 第三章 镍离子与L929细胞作用的代谢组学实验及数据分析 | 第75-96页 |
| 3.1 基于液相色谱-质谱(LC-MS)实验的代谢组学实验 | 第75-80页 |
| 3.1.1 实验材料与仪器 | 第75-76页 |
| 3.1.2 主要溶液的配制 | 第76页 |
| 3.1.3 实验方法及步骤 | 第76-77页 |
| 3.1.4 实验结果 | 第77-80页 |
| 3.2 代谢组学数据的统计学分析结果及讨论 | 第80-84页 |
| 3.2.1 代谢组学原始数据的多元统计学分析结果 | 第80-83页 |
| 3.2.2 差异表达代谢物的统计学分析结果 | 第83-84页 |
| 3.3 代谢组学数据的生物信息学分析及讨论 | 第84-94页 |
| 3.3.1 差异表达代谢物匹配结果 | 第84-85页 |
| 3.3.2 差异表达代谢物的聚类分析 | 第85-89页 |
| 3.3.3 差异表达代谢物的代谢通路分析 | 第89-94页 |
| 3.4 本章小结 | 第94页 |
| 3.5 参考文献 | 第94-96页 |
| 第四章 镍离子作用于L929细胞的生物组学结果联合分析 | 第96-123页 |
| 4.1 镍离子与L929细胞作用的基因组学结果概述 | 第96-97页 |
| 4.2 镍离子与L929细胞作用后的三种组学结果联合分析 | 第97-106页 |
| 4.2.1 基因组学、蛋白质组学和代谢组学通路分析结果对比 | 第97-101页 |
| 4.2.2 三种组学层次共有通路重点分析 | 第101-106页 |
| 4.3 镍离子与L929细胞作用后的蛋白质组学和代谢组学结果联合分析 | 第106-115页 |
| 4.3.1 蛋白质组学和代谢组学联合分析 | 第106-108页 |
| 4.3.2 重点通路分析 | 第108-115页 |
| 4.4 基于多种组学技术的镍离子细胞毒性机理分析 | 第115-117页 |
| 4.5 镍离子细胞毒性机理的单一组学层次分析结果和系统生物学分析结果对比 | 第117-120页 |
| 4.6 本章小结 | 第120-121页 |
| 4.7 参考文献 | 第121-123页 |
| 第五章 总结与展望 | 第123-126页 |
| 5.1 全文总结 | 第123-124页 |
| 5.2 展望 | 第124-126页 |
| 攻读硕士期间发表论文情况 | 第126-127页 |
| 致谢 | 第127页 |
