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水稻种子磷酸化蛋白质组学研究与OsbZIP72的功能分析

博士学位论文评阅人、答辩委员会签名表第3-5页
摘要第5-6页
abstract第6页
英文缩略表第10-11页
第一章 引言第11-32页
    1.1 蛋白质翻译后修饰第11-12页
    1.2 蛋白质磷酸化修饰第12-14页
    1.3 蛋白质磷酸化功能第14-18页
        1.3.1 蛋白质磷酸化与信号传导第14-16页
        1.3.2 蛋白质磷酸化与蛋白细胞定位第16-17页
        1.3.3 蛋白质磷酸化与细胞分裂第17-18页
    1.4 磷酸化蛋白组研究进展第18-27页
        1.4.1 磷酸化蛋白组研究主要内容及方法第18-20页
        1.4.2 植物磷酸化蛋白质组研究进展第20-27页
    1.5 水稻生殖发育有关的磷酸化蛋白研究进展第27-29页
    1.6 植物bZIP转录因子第29-30页
        1.6.1 植物bZIP转录因子结构特点第29页
        1.6.2 植物bZIP转录因子调控机制第29页
        1.6.3 水稻中的bZIP转录因子第29-30页
    1.7 本课题研究思路第30-32页
第二章 水稻种子磷酸化蛋白质组学研究第32-48页
    2.1 材料与方法第32-35页
        2.1.1 实验材料与样品的收集第32页
        2.1.2 总蛋白的提取第32-33页
        2.1.3 蛋白免疫印迹(Western Blot)第33-34页
        2.1.4 蛋白消化(Protein Digestion)第34-35页
        2.1.5 磷酸化肽段的富集第35页
        2.1.6 LC-MS/MS分析和数据分析第35页
    2.2 结果与分析第35-44页
        2.2.1 磷酸化位点、肽段、蛋白的鉴定第35-37页
        2.2.2 磷酸化蛋白的亚细胞定位第37页
        2.2.3 磷酸化位点Motif分析第37-38页
        2.2.4 差异性磷酸化的肽段和蛋白第38-40页
        2.2.5 差异磷酸化蛋白的GO分析第40-41页
        2.2.6 差异磷酸化蛋白磷酸化修饰丰度与蛋白表达量的关系第41-44页
    2.3 讨论第44-48页
        2.3.1 蛋白的磷酸化修饰与花分生组织发育第44页
        2.3.2 磷酸化激活细胞的增殖和增长第44-45页
        2.3.3 磷酸化修饰与植物激素调节第45-46页
        2.3.4 磷酸化修饰与水稻灌浆和品质形成第46-48页
第三章 差异磷酸化转录因子OsbZIP72的研究第48-75页
    3.1 材料与方法第48-63页
        3.1.1 水稻组织总RNA的提取第48-49页
        3.1.2 大肠杆菌感受态的制备及转化第49-50页
        3.1.3 载体的构建第50-51页
        3.1.4 农杆菌感受态的制备及转化第51-52页
        3.1.5 水稻转基因的方法第52-56页
        3.1.6 RNA反转录第56-57页
        3.1.7 荧光实时定量PCR第57-58页
        3.1.8 RNA-seq第58页
        3.1.9 酵母双杂交第58-59页
        3.1.10 融合蛋白的原核表达以及纯化第59-60页
        3.1.11 体外pull down实验第60页
        3.1.12 激酶实验第60-61页
        3.1.13 EMSA第61-63页
    3.2 结果与分析第63-72页
        3.2.1 OsbZIP72差异磷酸化情况以及其表达模式第63-65页
        3.2.2 OsbZIP72受植物激素诱导表达模式第65-66页
        3.2.3 过表达OsbZIP72的RNA-seq分析第66-69页
        3.2.4 OsbZIP72与SAPK10存在互作第69-71页
        3.2.5 OsbZIP72被SAPK10磷酸化第71页
        3.2.6 磷酸化状态下OsbZIP72可以直接结合OsAOC第71-72页
    3.3 讨论第72-75页
第四章 全文结论与创新之处第75-77页
    4.1 全文结论第75-76页
    4.2 本研究的创新之处第76-77页
参考文献第77-90页
附录第90-97页
致谢第97-98页
作者简历第98页

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