| Abstract | 第11-13页 |
| 摘要 | 第14-16页 |
| List of abbreviations | 第16-17页 |
| Chapter Ⅰ:Literature Review | 第17-43页 |
| 1.1. The origin and History of Soybean | 第17-18页 |
| 1.2. Association Mapping (AM) | 第18-24页 |
| 1.2.1. Association Mapping studies in plants | 第20-22页 |
| 1.2.2. Association mapping as an alternative approach | 第22-24页 |
| 1.3. Quantitative trait loci (QTL) | 第24-25页 |
| 1.4. Single nucleotide polymorphisms(SNPs) | 第25-27页 |
| 1.5. Linkage Disequilibrium(LD) | 第27-33页 |
| 1.5.1. Visualization and statistical significance of LD | 第29-32页 |
| 1.5.2. Factors that affect LD | 第32-33页 |
| 1.6. Population Structure | 第33-36页 |
| 1.7. Soybean biomass and its Genetic Research Progress | 第36-38页 |
| 1.8. Soybean yield components and its Genetic Research Progress | 第38-40页 |
| 1.9. Problem statement | 第40页 |
| 1.10. Research justification | 第40-41页 |
| 1.11. Objectives | 第41-43页 |
| 1.11.1. General objective | 第41页 |
| 1.11.2. Specific objectives | 第41-43页 |
| Chapter Ⅱ: Materials and Methods | 第43-47页 |
| 2.1. Plant materials and phenotypic data collection | 第43-44页 |
| 2.2. SNP genotyping | 第44页 |
| 2.3. Phenotypic data analyses | 第44-45页 |
| 2.4. Genome-wide association analysis | 第45-47页 |
| Chapter Ⅲ: Results | 第47-59页 |
| 3.1. Effects of phenotypic variations, heritability and population structure on phenotype | 第47-50页 |
| 3.2. Correlation analysis of soybean biomass and yield component traits | 第50-51页 |
| 3.3. Association mapping | 第51-55页 |
| 3.4. Mining elite alleles | 第55-59页 |
| Chapter Ⅳ: Discussion | 第59-63页 |
| 4.1. Effects of phenotypic variations, heritability and population structure on phenotype | 第59-60页 |
| 4.2. Correlation analysis of soybean biomass and yield components traits | 第60-61页 |
| 4.3. Association mapping | 第61-62页 |
| 4.4. Mining elite alleles | 第62页 |
| 4.5. Limitations | 第62-63页 |
| Chapter Ⅴ: Conclusions | 第63-65页 |
| Bibliography | 第65-83页 |
| Appendix A | 第83-89页 |
| Appendix B | 第89-91页 |
| Appendix C | 第91-99页 |
| Acknowledgements | 第99-101页 |
| Publications | 第101页 |
