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西洋参叶绿体基因组的生物信息学研究

Abstract第1-9页
第一章 绪论第9-21页
   ·生物信息学概述第9-10页
   ·测序技术的发展第10-12页
     ·第一代测序第10-11页
     ·第二代测序第11页
     ·第三代测序第11-12页
   ·叶绿体的起源第12-13页
   ·叶绿体基因组的结构第13-15页
   ·叶绿体基因组的应用第15-18页
     ·叶绿体基因组在系统发育研究中的应用第15-17页
     ·叶绿体条形码物种鉴定第17-18页
     ·叶绿体基因工程第18页
   ·西洋参的研究第18-20页
   ·研究的目的和意义第20-21页
第二章 材料与方法第21-31页
   ·材料,试剂和仪器第21页
   ·方法第21-31页
     ·提取DNA的方法第21-22页
     ·BLAST软件的介绍及算法第22-23页
     ·Perl语言筛选数据的过程第23-28页
     ·用数字信号处理的方法进行序列比对第28-29页
     ·序列拼接和分析第29-31页
第三章 西洋参叶绿体基因组的数据挖掘和分析第31-41页
   ·西洋参叶绿体基因组的基本特征第31-35页
   ·简单重复序列的分析第35-41页
     ·重复序列的介绍第35-36页
     ·SSR分析第36-41页
第四章 西洋参叶绿体比较基因组学的分析第41-49页
   ·叶绿体基因组区域边界的比较第41页
   ·叶绿体基因组基因相似度的比较第41-49页
第五章 五加科植物系统进化分析第49-53页
   ·系统发育介绍第49-50页
   ·遗传距离的计算以及结果分析第50-53页
第六章 总结与展望第53-55页
   ·总结第53页
   ·展望第53-55页
致谢第55-57页
参考文献第57-63页
附录A 学术成果第63-65页
附录B 图表第65-67页

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