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稻瘟菌侵染过程中水稻细胞质膜蛋白组研究

摘要第1-7页
Abstract第7-12页
第1章 前言第12-38页
   ·稻瘟菌及致病机制介绍第12-14页
   ·植物先天免疫系统第14-17页
     ·PAMP触发的免疫(PTI)第14-15页
     ·效应蛋白触发的免疫(ETI)第15-16页
     ·“zigzag”模型与防卫理论(The guard hypothesis)第16-17页
   ·激素与植物免疫第17-25页
     ·激素转导途径的进化历程第17-18页
     ·SAR与ISR第18-20页
     ·脱落酸与植物免疫第20-22页
     ·细胞分裂素与植物免疫第22-25页
   ·蛋白质谱技术的发展第25-27页
     ·质谱检测原理及仪器类型第25-26页
     ·高通量分析的实现第26-27页
   ·蛋白质组学分析和分离技术第27-30页
     ·蛋白标记技术第27-29页
     ·蛋白质组数据库第29页
     ·一维凝胶电泳(one-dimensional gel electrophoresis,1-DE)第29-30页
     ·二维凝胶电泳(two-dimensional gel electrophoresis,2-DE)第30页
   ·蛋白组在植物先天免疫中的应用第30-36页
     ·植物先天免疫机制中蛋白质组变化的研究第30-32页
     ·磷酸化修饰第32-34页
     ·糖基化修饰第34-35页
     ·蛋白组技术在植物先天免疫研究中应用的展望第35-36页
   ·本课题的研究背景及意义第36-38页
第2章 实验材料与方法第38-56页
   ·实验材料第38-42页
     ·植物和菌株材料第38页
     ·主要仪器设备第38页
     ·实验所用抗体及引物第38-41页
     ·主要试剂和试剂盒第41页
     ·数据库及软件第41-42页
   ·实验方法第42-56页
     ·水稻和稻瘟菌培养第42页
     ·孢子获得及水稻接菌实验第42-43页
     ·DAB染色及观察第43页
     ·蛋白电泳和免疫杂交第43-45页
     ·RNA提取及cDNA合成第45-46页
     ·实时荧光定量PCR(qRT-PCR)第46-47页
     ·水稻细胞质膜的提取及定量第47-48页
     ·质膜蛋白酶解及iTRAQ标记第48-49页
     ·强阳离子交换及LC-MS/MS分析第49-50页
     ·蛋白鉴定及定量分析第50页
     ·总蛋白跨膜结构域及类受体激酶预测第50-51页
     ·差异蛋白同源注释及GO功能富集第51页
     ·激素提取及测定第51-52页
     ·水稻质外体溶液的提取及污染度检测第52-53页
     ·水稻质外体溶液衍生化及GC-MS测定第53页
     ·水稻质外体糖含量测定第53-54页
     ·水稻转录组测序第54页
     ·稻瘟菌分泌蛋白组预测及富集分析第54-56页
第3章 结果和分析第56-83页
   ·叶鞘接菌表型分析第56-57页
   ·水稻细胞质膜纯度验证第57-58页
   ·质膜蛋白鉴定及相关分析第58-60页
     ·类受体激酶预测分析第58页
     ·跨膜结构域分析第58-59页
     ·分子功能预测分析第59-60页
   ·差异蛋白获得及相关分析第60-63页
     ·差异蛋白的获得和GO功能富集分析第60-62页
     ·差异蛋白与非生物胁迫途径的关系第62-63页
   ·生物学途径显著性分析第63-66页
     ·生物学途径显著性分析(24 hpi)第63-64页
     ·生物学途径显著性分析(48 hpi)第64-65页
     ·响应ABA、CKs激素途径在不同时间点被显著富集第65-66页
   ·脱落酸增加水稻对稻瘟菌的敏感性第66-70页
     ·响应ABA激素途径的实验验证第66-67页
     ·24 hpi样品中ABA含量增多的原因分析第67-68页
     ·突变体Osabi3及外源施加ABA水稻接菌表型分析第68-70页
     ·外源施加ABA抑制病程相关基因的表达第70页
   ·稻瘟菌侵染水稻早期的RNASEQ数据分析第70-72页
   ·稻瘟菌侵染导致水稻CKs含量增多第72-73页
   ·水稻质外体代谢谱图测定第73-75页
   ·CKs影响胞外糖分积累机制分析第75-78页
     ·CKs促进了水稻质外体单糖的积累第75-77页
     ·CKs影响糖转运蛋白等基因的表达第77-78页
     ·稻瘟菌侵染和CKs处理可诱导水稻反转酶的表达第78页
   ·稻瘟菌分泌蛋白参与糖代谢途径分析第78-83页
     ·稻瘟菌全基因组分泌蛋白预测第78-80页
     ·稻瘟菌分泌蛋白KEGG通路分析第80-81页
     ·部分稻瘟菌经典分泌蛋白具有降解植物成分的功能第81-83页
第4章 结论和讨论第83-88页
   ·主要结论第83页
   ·讨论第83-87页
     ·水稻质膜蛋白组第83-84页
     ·稻瘟菌侵染过程中的植物免疫反应第84-85页
     ·ABA在抗稻瘟病中的作用第85页
     ·CKs在植物免疫中的作用第85-86页
     ·稻瘟菌效应蛋白的预测第86-87页
   ·模型建立第87-88页
参考文献第88-96页
作者简介及在学期间发表论文第96-97页
致谢第97页

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