| 本论文的创新点 | 第1-9页 |
| 摘要 | 第9-11页 |
| Abstract | 第11-14页 |
| 第一章 绪论 | 第14-36页 |
| 1 表观修饰的结构与功能 | 第14-24页 |
| ·表观遗传学的概念 | 第14-15页 |
| ·染色质的基本结构 | 第15-18页 |
| ·组蛋白修饰的种类 | 第18-19页 |
| ·组蛋白乙酰化的结构与功能 | 第19-21页 |
| ·组蛋白乙酰化的结构 | 第19-20页 |
| ·组蛋白乙酰化在植物中的生物学功能 | 第20-21页 |
| ·组蛋白甲基化结构与功能 | 第21-23页 |
| ·H3K4甲基化修饰 | 第21-22页 |
| ·H3K9甲基化修饰 | 第22页 |
| ·H3K27甲基化修饰 | 第22-23页 |
| ·H3K36甲基化修饰 | 第23页 |
| ·表观遗传研究方法 | 第23-24页 |
| 2 组蛋白修饰的遗传 | 第24-27页 |
| 3 表观遗传变异 | 第27-30页 |
| ·自发性表观遗传变异 | 第27页 |
| ·环境诱导表观遗传变异 | 第27-28页 |
| ·表观遗传变异导致植物发育异常 | 第28-30页 |
| 4 杂合子中的表观修饰研究 | 第30-34页 |
| ·杂种一代中的杂种优势研究 | 第30-32页 |
| ·杂合状态的等位基因特异性表观修饰研究 | 第32-34页 |
| 5 动植物发育过程中的表观修饰研究 | 第34-36页 |
| 第二章 籼稻品种间组蛋白修饰多态性研究 | 第36-59页 |
| 1 前言 | 第36页 |
| 2 实验材料与方法 | 第36-38页 |
| ·植物材料与表型考察 | 第36页 |
| ·染色质免疫共沉淀 | 第36-37页 |
| ·ChIP-Seq文库构建流程 | 第37页 |
| ·唯一比对reads筛选 | 第37页 |
| ·表观修饰峰分析 | 第37页 |
| ·基因区域的组蛋白修饰分布分析 | 第37页 |
| ·基因的组蛋白修饰水平分析 | 第37-38页 |
| ·基因功能聚类分析 | 第38页 |
| 3 实验结果与讨论 | 第38-58页 |
| ·籼籼品种表型及F1杂种的杂种优势分析 | 第38-39页 |
| ·表观基因组测序基本技术指标 | 第39-40页 |
| ·水稻品种间的组蛋白修饰峰差异分析 | 第40-44页 |
| ·不同品种间基因编码区内组蛋白修饰的量化分析 | 第44-52页 |
| ·H3K27me3和H3K36me3的量化 | 第44-46页 |
| ·品种间H3K27me3及H3K36me3差异修饰基因分析 | 第46-47页 |
| ·组蛋白差异修饰基因在三个品种间的分布 | 第47-52页 |
| ·品种间基因组蛋白修饰差异同遗传差异之间的关系 | 第52-55页 |
| ·品种间基因组蛋白修饰差异程度同SNP密度呈正比 | 第52-53页 |
| ·品种问部分差异修饰基因无SNP检出 | 第53-55页 |
| ·品种间基因修饰差异同基因表达之间的关系 | 第55-58页 |
| 4 小结 | 第58-59页 |
| 第三章 水稻F1杂种中等位基因特异性组蛋白修饰研究 | 第59-84页 |
| 1 前言 | 第59页 |
| 2 实验材料与方法 | 第59-60页 |
| ·ChIP-seq建库及基因组蛋白修饰水平分析 | 第59页 |
| ·等位基因特异性组蛋白修饰分析 | 第59-60页 |
| 3 实验结果与讨论 | 第60-83页 |
| ·杂种一代中等位基因特异性组蛋白修饰分析 | 第60-63页 |
| ·ChIP-seq及含SNP-reads的检出 | 第60-61页 |
| ·等位基因间组蛋白修饰差异的比例分析 | 第61-63页 |
| ·等位基因修饰在亲本间与F1中的遗传关系分析 | 第63-69页 |
| ·F1中等位基因修饰与亲本间修饰相关性分析 | 第63-64页 |
| ·杂种一代中等位基因特异性修饰的遗传关系分析 | 第64-69页 |
| ·杂种一代中等位基因间组蛋白修饰重组对修饰水平的影响 | 第69-77页 |
| ·杂种一代中组蛋白修饰的重组影响修饰水平 | 第69-75页 |
| ·水稻杂种一代中非加性遗传基因的组蛋白修饰水平分析 | 第75-77页 |
| ·F1代与亲本间的差异修饰基因由等位基因特异性修饰基因组成 | 第77-80页 |
| ·在不同F1代中F1代与亲本间测的差异修饰基因分析 | 第77-78页 |
| ·差异修饰基因呈现等位基因特异性修饰状态 | 第78-79页 |
| ·F1与亲本间差异修饰基因对基因表达差异的贡献 | 第79-80页 |
| ·杂种一代中等位基因组蛋白修饰影响等位基因表达 | 第80-83页 |
| 4 小结 | 第83-84页 |
| 第四章 水稻幼穗发育中的组蛋白修饰研究 | 第84-101页 |
| 1 前言 | 第84页 |
| 2 实验材料与方法 | 第84-86页 |
| ·实验材料 | 第84页 |
| ·植物材料固定,渗蜡与包埋 | 第84-85页 |
| ·抗体 | 第85页 |
| ·蛋白质免疫印迹 | 第85-86页 |
| ·免疫荧光杂交 | 第86页 |
| ·结果观察与图片处理 | 第86页 |
| 3 实验结果与讨论 | 第86-100页 |
| ·H3ac与H4ac在水稻茎尖及幼穗原基中的分布研究 | 第86-90页 |
| ·H3K4me3与H3K27me3在水稻茎尖及幼穗原基中的分布 | 第90-93页 |
| ·H3K9me1在水稻茎尖及幼穗原基中的分布研究 | 第93-94页 |
| ·水稻颖花发育过程中的组蛋白修饰变化 | 第94-97页 |
| ·组蛋白修饰在花药壁中的免疫荧光学研究 | 第97-100页 |
| 4 小结 | 第100-101页 |
| 参考文献 | 第101-117页 |
| 在读期间发表及待发表论文 | 第117-118页 |
| 致谢 | 第118页 |
