| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 第1章 绪论 | 第9-13页 |
| ·本文研究背景及意义 | 第9-10页 |
| ·蛋白质亚细胞定位的研究现状 | 第10-12页 |
| ·本文的主要内容和安排 | 第12-13页 |
| 第2章 蛋白质数据与模型 | 第13-29页 |
| ·蛋白质的组成与功能 | 第13-14页 |
| ·常用生物信息学数据库以及工具介绍 | 第14-20页 |
| ·SWISS-PROT蛋白质数据库 | 第14-17页 |
| ·同源性序列搜索 | 第17-20页 |
| ·蛋白质序列的同源性、相似性及序列比对 | 第17-18页 |
| ·同源性序列搜索工具BLAST | 第18-20页 |
| ·基因本体(Gene Ontology)模型概述 | 第20-24页 |
| ·GO的组成 | 第21页 |
| ·GO的组织结构 | 第21-22页 |
| ·GO标注概述 | 第22-24页 |
| ·伪氨基酸组成成分模型(Pse-AAC)概述 | 第24-29页 |
| ·氨基酸组成和双残基组成 | 第24页 |
| ·氨基酸的物化性质组成、转换与分布法 | 第24-25页 |
| ·伪氨基酸组成成分模型 | 第25-29页 |
| 第3章 蛋白质序列特征提取方法 | 第29-38页 |
| ·蛋白质序列原始数据集及处理 | 第29-32页 |
| ·Pse-AAC模型的建立 | 第32-33页 |
| ·Gene Ontology模型的建立 | 第33-36页 |
| ·GO的检索 | 第33-36页 |
| ·在线检索 | 第33-34页 |
| ·本地检索 | 第34-36页 |
| ·GO向量的构建 | 第36页 |
| ·蛋白质序列特征数据集的构建 | 第36-38页 |
| 第4章 多标签设置下的蛋白质亚细胞定位方法 | 第38-43页 |
| ·多标签分类算法的介绍 | 第38-41页 |
| ·OVR-kNN与ML-kNN算法 | 第38-39页 |
| ·Rank-SVM算法 | 第39页 |
| ·SVM-ML算法 | 第39-41页 |
| ·基于多标签分类算法蛋白质亚细胞定位的预测方法 | 第41页 |
| ·多标签分类算法性能评价指标 | 第41-43页 |
| 第5章 多标签设置下的蛋白质亚细胞定位方法的实验研究 | 第43-50页 |
| ·实验数据集介绍 | 第43页 |
| ·实验结果及对比分析 | 第43-50页 |
| ·参数调节 | 第43-46页 |
| ·实验结果比较与分析 | 第46-49页 |
| ·与现存算法的比较 | 第49-50页 |
| 第6章 总结与展望 | 第50-52页 |
| 参考文献 | 第52-57页 |
| 致谢 | 第57-58页 |
| 附录 攻读硕士学位期间参加科研项目情况 | 第58页 |