| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第9-13页 |
| 1 微卫星标记简介 | 第9-11页 |
| ·微卫星的发现 | 第9页 |
| ·微卫星的分类 | 第9页 |
| ·微卫星的产生机理 | 第9页 |
| ·微卫星的功能 | 第9-10页 |
| ·微卫星标记的特点 | 第10页 |
| ·微卫星标记技术的基本原理与主要步骤 | 第10-11页 |
| ·微卫星序列的获得 | 第10-11页 |
| ·微卫星扩增产物的检测 | 第11页 |
| 2 微卫星标记在鱼类遗传多样性分析中的应用 | 第11页 |
| 3 黄颡鱼遗传多样性的研究进展 | 第11-12页 |
| 4 本研究的目的和意义 | 第12-13页 |
| 第二章 黄颡鱼微卫星标记的筛选鉴定 | 第13-28页 |
| 1 材料与方法 | 第13-18页 |
| ·实验材料 | 第13-14页 |
| ·研究对象 | 第13页 |
| ·实验试剂 | 第13-14页 |
| ·实验仪器 | 第14页 |
| ·生物软件 | 第14页 |
| ·实验方法 | 第14-18页 |
| ·黄颡鱼基因组DNA的提取 | 第14页 |
| ·黄颡鱼微卫星文库的构建 | 第14-16页 |
| ·富集文库的PCR法筛选 | 第16-17页 |
| ·阳性克隆的序列测定 | 第17页 |
| ·测序结果分析 | 第17页 |
| ·引物的设计与合成 | 第17页 |
| ·引物的初步筛选和PCR反应条件优化 | 第17页 |
| ·微卫星引物的鉴定 | 第17-18页 |
| ·微卫星标记的筛选及数据分析 | 第18页 |
| 2 结果与分析 | 第18-27页 |
| ·黄颡鱼基因组DNA的提取结果 | 第18-19页 |
| ·黄颡鱼基因组DNA的酶切检测 | 第19-20页 |
| ·连接片段的PCR扩增结果 | 第20页 |
| ·双链DNA目的片段的检测 | 第20-21页 |
| ·PCR法筛选含微卫星片段的阳性克隆结果 | 第21-22页 |
| ·阳性克隆的测序结果 | 第22页 |
| ·引物设计 | 第22-24页 |
| ·微卫星标记的初步筛选结果 | 第24-25页 |
| ·多态性微卫星引物的筛选结果 | 第25-26页 |
| ·数据的统计与分析 | 第26-27页 |
| 3 讨论 | 第27页 |
| 4 小结 | 第27-28页 |
| 第三章 长江中下游四个湖泊黄颡鱼群体遗传多样性分析 | 第28-42页 |
| 1 材料与方法 | 第28-33页 |
| ·实验材料 | 第28-29页 |
| ·研究对象 | 第28页 |
| ·实验试剂 | 第28页 |
| ·实验仪器 | 第28-29页 |
| ·生物软件 | 第29页 |
| ·实验方法 | 第29页 |
| ·黄颡鱼基因组DNA的提取 | 第29页 |
| ·用于遗传多样性检测的PCR反应 | 第29页 |
| ·PCR反应产物的检测 | 第29页 |
| ·微卫星基因型的判断 | 第29页 |
| ·群体内的遗传分析 | 第29-31页 |
| ·有效等位基因数 | 第29页 |
| ·等位基因频率 | 第29-30页 |
| ·Hardy-Weinberg平衡检验 | 第30页 |
| ·杂合度(H) | 第30-31页 |
| ·多态信息含量(PIC) | 第31页 |
| ·群体间的遗传分析 | 第31-33页 |
| ·F-统计量 | 第31-32页 |
| ·分子方差分析 | 第32页 |
| ·基因流和成对固定指数 | 第32页 |
| ·遗传距离 | 第32-33页 |
| ·聚类分析(cluster analysis) | 第33页 |
| 2 结果与分析 | 第33-39页 |
| ·各微卫星位点在四个群体中的观测等位基因数及有效等位基因数 | 第34页 |
| ·各微卫星位点在四个群体中的观测杂合度及期望杂合度 | 第34-35页 |
| ·各微卫星位点在四个群体中的PIC值及哈代温伯格平衡情况 | 第35-36页 |
| ·F-统计量分析 | 第36页 |
| ·四个黄颡鱼群体间的聚类分析 | 第36-38页 |
| ·黄颡鱼群体的分子方差分析 | 第38页 |
| ·黄颡鱼群体间的成对固定指数值(FST) | 第38-39页 |
| 3 讨论 | 第39-40页 |
| ·关于所开发标记的适用性 | 第39页 |
| ·四个黄颡鱼群体的遗传多样性分析 | 第39页 |
| ·四个黄颡鱼群体的亲缘关系与聚类分析 | 第39-40页 |
| 4 小结 | 第40-42页 |
| 第四章 结论 | 第42-43页 |
| 参考文献 | 第43-47页 |
| 致谢 | 第47-48页 |
| 附录一:测出的68条序列中含微卫星DNA的序列 | 第48-62页 |
| 附录二:四个黄颡鱼群体在6个微卫星标记上的等位基因频率 | 第62-64页 |
| 附录三:各微卫星座位PCR产物在8%非变性聚丙烯酰胺凝胶中电泳的部分结果 | 第64-66页 |
