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鸡肌苷酸相关候选基因遗传效应及表达规律研究

中文摘要第1-13页
Abstract第13-17页
第一章 文献综述第17-58页
 1. 鸡的肉质风味研究进展第17-19页
   ·肉质风味的含义第17-18页
   ·肉品风味的产生第18-19页
 2. 肌苷酸作为风味物质的研究进展第19-26页
   ·肌苷酸的呈味作用第19-20页
   ·肌苷酸的合成代谢第20-23页
     ·肌苷酸的从头合成途径第20-22页
     ·肌苷酸的补救合成途径第22-23页
     ·由次黄嘌呤核苷酸转换成AMP 或GMP第23页
     ·屠宰后肌苷酸的形成第23页
   ·影响肌肉肌苷酸含量的因素第23-25页
     ·遗传因素第24页
     ·饲料组成第24-25页
     ·屠宰方法第25页
     ·保藏温度和时间第25页
   ·肌苷酸含量的遗传力及与其他性状间的相关第25-26页
 3. 肉质性状相关候选基因的研究进展第26-37页
   ·与肌苷酸合成代谢相关的基因第26-31页
     ·ADSL 基因第26-27页
     ·GARS-AIRS-GART 基因第27-28页
     ·GPAT 基因与AIRC 基因第28-29页
     ·PURH 基因第29-30页
     ·AMPD1 基因第30-31页
   ·与脂肪代谢相关性状的候选基因第31-37页
     ·心肌型脂肪酸结合蛋白(H-FABP)基因第32-33页
     ·脂肪型脂肪酸结合蛋白(A-FABP)基因第33-34页
     ·细胞外脂肪酸结合蛋白(EX-FABP)基因第34-35页
     ·脂蛋白脂酶(LPL)基因第35-36页
     ·瘦蛋白受体(OBR)基因第36-37页
     ·解偶联蛋白(UCP)基因第37页
 4. 家禽肉质选择的主要方法第37-48页
   ·分子标记辅助选择在家禽育种中的应用第38-46页
     ·限制性酶切片段长度多态性(RFLP)第39-40页
     ·DNA 指纹标记第40页
     ·RAPD 标记第40-41页
     ·微卫星标记第41-42页
     ·SNP 标记第42-45页
       ·SNP 的基本概念第42-43页
       ·SNP 的检测方法第43-44页
       ·SNP 在畜禽遗传育种中的应用第44-45页
     ·几种新型分子标记第45-46页
       ·RMAPD 标记第45页
       ·SRAP 标记第45-46页
       ·TRAP 标记第46页
   ·候选基因法第46-48页
     ·候选基因法的基本概念第46页
     ·候选基因分析法的步骤第46-47页
     ·连锁关系的验证第47页
     ·候选基因分析法的不足第47-48页
 5.R T-PCR 定量技术第48-52页
   ·非竞争性RT-PCR 技术第49-50页
   ·竞争性RT-PCR 技术第50-51页
   ·RT-PCR 方法用于畜禽相关基因表达的研究第51-52页
 6 多基因聚合在优质鸡育种中的应用第52-55页
   ·优质鸡的概念第52-53页
   ·基因聚合育种的基本原理第53-54页
   ·基因聚合在畜禽育种中的研究进展第54-55页
 7. 本研究目的和意义第55-58页
第二章 肌苷酸合成相关酶基因单核苷酸多态性及其与鸡肉肌苷酸含量的关联分析第58-89页
 第一节 鸡GPAT 基因和AIRC 基因的单核苷酸多态性及其与肌苷酸含量的关联分析第58-81页
  1. 引言第58-59页
  2. 材料与方法第59-66页
   ·试验动物第59页
   ·主要溶液的配制第59-61页
   ·主要实验仪器第61页
   ·引物设计合成第61-62页
   ·试验方法第62-66页
     ·胸肌肌苷酸含量的测定第62-63页
     ·基因组DNA 的提取第63-64页
     ·PCR 扩增第64页
     ·SSCP 分析第64-65页
     ·多态片段的序列测定第65-66页
       ·PCR 产物的直接测序第65页
       ·克隆测序第65-66页
  3. 相关软件及统计方法第66-67页
   ·相关软件第66页
   ·统计方法第66-67页
     ·基因频率、基因型频率在各群体中分布的差异检验第66页
     ·关联分析第66-67页
  4. 结果与分析第67-77页
   ·不同鸡种胸肌肌苷酸含量第67页
   ·GPAT 基因SNP 筛查结果第67-69页
   ·AIRC 基因SNP 筛查结果第69页
   ·GPAT/AIRC 基因启动子区域SNP 筛查结果第69-70页
   ·GPAT 基因各SNP 位点在5 个鸡群体中的基因频率和基因型分布第70-72页
   ·AIRC 基因各SNP 位点在5 个鸡群体中的基因频率和基因型分布第72-74页
   ·GPAT第74-75页
   ·GPAT 基因与12 周龄母鸡胸肌肌苷酸含量的关联分析第75-76页
   ·AIRC 基因与12 周龄母鸡胸肌肌苷酸含量的关联分析第76-77页
   ·GPAT/AIRC 基因启动子与12 周龄母鸡胸肌肌苷酸含量关联分析第77页
  5. 讨论第77-81页
   ·不同鸡种胸肌肌苷酸含量的比较第77-78页
   ·鸡GPAT 基因、AIRC 基因单核苷酸多态性第78-79页
   ·鸡GPAT 基因单核苷酸多态性与肌苷酸含量的关系第79页
   ·鸡AIRC 基因单核苷酸多态性与肌苷酸含量的关系第79-80页
   ·鸡GPAT/AIRC 基因启动子区单核苷酸多态性与肌苷酸含量的关系第80-81页
 第二节 鸡PURH 基因的单核苷酸多态性及其与肌苷酸含量关联分析第81-89页
  1. 引言第81-82页
  2. 材料与方法第82-83页
  3. 结果与分析第83-87页
   ·PURH 基因SNP 筛查结果第83-84页
   ·PURH 基因各SNP 位点在5 个鸡群体中的基因频率和基因型分布第84-86页
   ·PURH 基因与12 周龄母鸡胸肌肌苷酸含量的关联分析第86-87页
  4. 讨论第87-89页
   ·鸡PURH 基因单核苷酸多态性第87页
   ·鸡PURH 基因单核苷酸多态性与肌苷酸含量的关系第87-89页
第三章 肌苷酸合成相关酶基因在白耳鸡不同生长阶段表达规律研究第89-113页
 1. 试验材料第89-90页
   ·动物材料第89页
   ·主要试剂第89-90页
 2. 试验方法第90-95页
   ·鸡组织RNA 的提取第90-91页
     ·提取RNA 的准备工作第90页
     ·Trizol 法提取组织总RNA第90页
     ·RNA 的检测第90-91页
   ·反转录第91页
   ·聚合酶链式反应(PCR)反应第91-95页
     ·引物的选择和退火温度(Tm)的确定第91-92页
     ·循环数的确定第92-95页
   ·琼脂糖凝胶电泳第95页
   ·半定量RT-PCR 分析第95页
 3. 试验结果第95-107页
   ·组织总RNA 的提取第95-96页
   ·循环数对目的基因和β-actin 基因表达的影响第96-100页
   ·不同生长阶段ADSL 基因表达的变化规律第100-101页
   ·不同生长阶段GARS-AIRS-GART 基因表达的变化规律第101-102页
   ·不同生长阶段GPAT 基因表达的变化规律第102-103页
   ·不同生长阶段AIRC 基因表达的变化规律第103-104页
   ·不同生长阶段PURH 基因表达的变化规律第104-105页
   ·12 周龄白耳鸡不同组织中各基因的表达规律第105-106页
   ·5 个基因在白耳鸡胸肌中表达量的相关分析第106-107页
 4. 讨论第107-113页
   ·RT-PCR 方法的构建第107-108页
   ·白耳鸡不同生长阶段不同组织中ADSL 基因表达的变化规律第108-109页
   ·白耳鸡不同生长阶段不同组织中GARS-AIRS-GART 基因表达的变化规律第109-110页
   ·白耳鸡不同生长阶段不同组织中GPAT 基因表达的变化规律第110-111页
   ·白耳鸡不同生长阶段不同组织中AIRC 基因表达的变化规律第111页
   ·白耳鸡不同生长阶段不同组织中PURH 基因表达的变化规律第111-112页
   ·5 个基因在胸肌中相对表达量的相关性第112-113页
第四章 肌苷酸合成相关酶基因在白耳鸡群体中多基因聚合效应初探第113-137页
 1. 材料与方法第113-114页
   ·试验动物第113页
   ·主要溶液的配制及主要实验仪器第113页
   ·引物序列第113-114页
   ·试验方法第114页
 2. 相关软件及统计方法第114页
   ·相关软件第114页
   ·统计方法第114页
 3. 结果与分析第114-133页
   ·12 周龄白耳鸡胸肌中肌苷酸含量第114-115页
   ·各候选基因在白耳鸡群体中的基因频率及基因型频率第115-116页
   ·5 个候选基因各基因型对白耳鸡胸肌肌苷酸含量的单基因效应分析第116-117页
   ·5 个候选基因合并基因型对白耳鸡胸肌肌苷酸含量两基因效应分析第117-120页
   ·5 个候选基因合并基因型对白耳鸡胸肌肌苷酸含量的三基因效应分析第120-125页
   ·5 个候选基因合并基因型对白耳鸡胸肌肌苷酸含量的四基因效应分析第125-131页
   ·5 个候选基因合并基因型对白耳鸡胸肌肌苷酸含量的五基因效应分析第131-133页
 4. 讨论第133-137页
   ·白耳鸡胸肌中肌苷酸含量第133页
   ·5 个候选基因对白耳鸡胸肌肌苷酸含量的单基因效应第133-134页
   ·5 个候选基因合并基因型对白耳鸡胸肌肌苷酸含量的基因效应第134-137页
全文结论第137-140页
 1. GPAT 基因外显子 2 的变异对鸡肉肌苷酸含量有显著影响第137页
 2. AIRC 基因外显子 3 和外显子 8 的变异对鸡肉肌苷酸含量有显著影响第137页
 3. GPAT/AIRC 基因启动子区的变异对鸡肉肌苷酸含量有显著影响第137-138页
  4. PURH 基因外显子 16 的变异对鸡肉肌苷酸含量有显著的影响第138页
 5. 在白耳鸡群体不同生长阶段不同组织中均检测到 5 个候选基因的表达,大多数基因的表达量呈时序性变化,并且不同基因的表达量之间存在一定的正相关第138页
 6. 多基因聚合后合并基因型对白耳鸡胸肌肌苷酸含量影响效果显著,合并的位点越多,效应越大第138-140页
参考文献第140-157页
致谢第157-159页
攻读学位期间发表的学术论文目录第159-162页

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