中文摘要 | 第1-13页 |
Abstract | 第13-17页 |
第一章 文献综述 | 第17-58页 |
1. 鸡的肉质风味研究进展 | 第17-19页 |
·肉质风味的含义 | 第17-18页 |
·肉品风味的产生 | 第18-19页 |
2. 肌苷酸作为风味物质的研究进展 | 第19-26页 |
·肌苷酸的呈味作用 | 第19-20页 |
·肌苷酸的合成代谢 | 第20-23页 |
·肌苷酸的从头合成途径 | 第20-22页 |
·肌苷酸的补救合成途径 | 第22-23页 |
·由次黄嘌呤核苷酸转换成AMP 或GMP | 第23页 |
·屠宰后肌苷酸的形成 | 第23页 |
·影响肌肉肌苷酸含量的因素 | 第23-25页 |
·遗传因素 | 第24页 |
·饲料组成 | 第24-25页 |
·屠宰方法 | 第25页 |
·保藏温度和时间 | 第25页 |
·肌苷酸含量的遗传力及与其他性状间的相关 | 第25-26页 |
3. 肉质性状相关候选基因的研究进展 | 第26-37页 |
·与肌苷酸合成代谢相关的基因 | 第26-31页 |
·ADSL 基因 | 第26-27页 |
·GARS-AIRS-GART 基因 | 第27-28页 |
·GPAT 基因与AIRC 基因 | 第28-29页 |
·PURH 基因 | 第29-30页 |
·AMPD1 基因 | 第30-31页 |
·与脂肪代谢相关性状的候选基因 | 第31-37页 |
·心肌型脂肪酸结合蛋白(H-FABP)基因 | 第32-33页 |
·脂肪型脂肪酸结合蛋白(A-FABP)基因 | 第33-34页 |
·细胞外脂肪酸结合蛋白(EX-FABP)基因 | 第34-35页 |
·脂蛋白脂酶(LPL)基因 | 第35-36页 |
·瘦蛋白受体(OBR)基因 | 第36-37页 |
·解偶联蛋白(UCP)基因 | 第37页 |
4. 家禽肉质选择的主要方法 | 第37-48页 |
·分子标记辅助选择在家禽育种中的应用 | 第38-46页 |
·限制性酶切片段长度多态性(RFLP) | 第39-40页 |
·DNA 指纹标记 | 第40页 |
·RAPD 标记 | 第40-41页 |
·微卫星标记 | 第41-42页 |
·SNP 标记 | 第42-45页 |
·SNP 的基本概念 | 第42-43页 |
·SNP 的检测方法 | 第43-44页 |
·SNP 在畜禽遗传育种中的应用 | 第44-45页 |
·几种新型分子标记 | 第45-46页 |
·RMAPD 标记 | 第45页 |
·SRAP 标记 | 第45-46页 |
·TRAP 标记 | 第46页 |
·候选基因法 | 第46-48页 |
·候选基因法的基本概念 | 第46页 |
·候选基因分析法的步骤 | 第46-47页 |
·连锁关系的验证 | 第47页 |
·候选基因分析法的不足 | 第47-48页 |
5.R T-PCR 定量技术 | 第48-52页 |
·非竞争性RT-PCR 技术 | 第49-50页 |
·竞争性RT-PCR 技术 | 第50-51页 |
·RT-PCR 方法用于畜禽相关基因表达的研究 | 第51-52页 |
6 多基因聚合在优质鸡育种中的应用 | 第52-55页 |
·优质鸡的概念 | 第52-53页 |
·基因聚合育种的基本原理 | 第53-54页 |
·基因聚合在畜禽育种中的研究进展 | 第54-55页 |
7. 本研究目的和意义 | 第55-58页 |
第二章 肌苷酸合成相关酶基因单核苷酸多态性及其与鸡肉肌苷酸含量的关联分析 | 第58-89页 |
第一节 鸡GPAT 基因和AIRC 基因的单核苷酸多态性及其与肌苷酸含量的关联分析 | 第58-81页 |
1. 引言 | 第58-59页 |
2. 材料与方法 | 第59-66页 |
·试验动物 | 第59页 |
·主要溶液的配制 | 第59-61页 |
·主要实验仪器 | 第61页 |
·引物设计合成 | 第61-62页 |
·试验方法 | 第62-66页 |
·胸肌肌苷酸含量的测定 | 第62-63页 |
·基因组DNA 的提取 | 第63-64页 |
·PCR 扩增 | 第64页 |
·SSCP 分析 | 第64-65页 |
·多态片段的序列测定 | 第65-66页 |
·PCR 产物的直接测序 | 第65页 |
·克隆测序 | 第65-66页 |
3. 相关软件及统计方法 | 第66-67页 |
·相关软件 | 第66页 |
·统计方法 | 第66-67页 |
·基因频率、基因型频率在各群体中分布的差异检验 | 第66页 |
·关联分析 | 第66-67页 |
4. 结果与分析 | 第67-77页 |
·不同鸡种胸肌肌苷酸含量 | 第67页 |
·GPAT 基因SNP 筛查结果 | 第67-69页 |
·AIRC 基因SNP 筛查结果 | 第69页 |
·GPAT/AIRC 基因启动子区域SNP 筛查结果 | 第69-70页 |
·GPAT 基因各SNP 位点在5 个鸡群体中的基因频率和基因型分布 | 第70-72页 |
·AIRC 基因各SNP 位点在5 个鸡群体中的基因频率和基因型分布 | 第72-74页 |
·GPAT | 第74-75页 |
·GPAT 基因与12 周龄母鸡胸肌肌苷酸含量的关联分析 | 第75-76页 |
·AIRC 基因与12 周龄母鸡胸肌肌苷酸含量的关联分析 | 第76-77页 |
·GPAT/AIRC 基因启动子与12 周龄母鸡胸肌肌苷酸含量关联分析 | 第77页 |
5. 讨论 | 第77-81页 |
·不同鸡种胸肌肌苷酸含量的比较 | 第77-78页 |
·鸡GPAT 基因、AIRC 基因单核苷酸多态性 | 第78-79页 |
·鸡GPAT 基因单核苷酸多态性与肌苷酸含量的关系 | 第79页 |
·鸡AIRC 基因单核苷酸多态性与肌苷酸含量的关系 | 第79-80页 |
·鸡GPAT/AIRC 基因启动子区单核苷酸多态性与肌苷酸含量的关系 | 第80-81页 |
第二节 鸡PURH 基因的单核苷酸多态性及其与肌苷酸含量关联分析 | 第81-89页 |
1. 引言 | 第81-82页 |
2. 材料与方法 | 第82-83页 |
3. 结果与分析 | 第83-87页 |
·PURH 基因SNP 筛查结果 | 第83-84页 |
·PURH 基因各SNP 位点在5 个鸡群体中的基因频率和基因型分布 | 第84-86页 |
·PURH 基因与12 周龄母鸡胸肌肌苷酸含量的关联分析 | 第86-87页 |
4. 讨论 | 第87-89页 |
·鸡PURH 基因单核苷酸多态性 | 第87页 |
·鸡PURH 基因单核苷酸多态性与肌苷酸含量的关系 | 第87-89页 |
第三章 肌苷酸合成相关酶基因在白耳鸡不同生长阶段表达规律研究 | 第89-113页 |
1. 试验材料 | 第89-90页 |
·动物材料 | 第89页 |
·主要试剂 | 第89-90页 |
2. 试验方法 | 第90-95页 |
·鸡组织RNA 的提取 | 第90-91页 |
·提取RNA 的准备工作 | 第90页 |
·Trizol 法提取组织总RNA | 第90页 |
·RNA 的检测 | 第90-91页 |
·反转录 | 第91页 |
·聚合酶链式反应(PCR)反应 | 第91-95页 |
·引物的选择和退火温度(Tm)的确定 | 第91-92页 |
·循环数的确定 | 第92-95页 |
·琼脂糖凝胶电泳 | 第95页 |
·半定量RT-PCR 分析 | 第95页 |
3. 试验结果 | 第95-107页 |
·组织总RNA 的提取 | 第95-96页 |
·循环数对目的基因和β-actin 基因表达的影响 | 第96-100页 |
·不同生长阶段ADSL 基因表达的变化规律 | 第100-101页 |
·不同生长阶段GARS-AIRS-GART 基因表达的变化规律 | 第101-102页 |
·不同生长阶段GPAT 基因表达的变化规律 | 第102-103页 |
·不同生长阶段AIRC 基因表达的变化规律 | 第103-104页 |
·不同生长阶段PURH 基因表达的变化规律 | 第104-105页 |
·12 周龄白耳鸡不同组织中各基因的表达规律 | 第105-106页 |
·5 个基因在白耳鸡胸肌中表达量的相关分析 | 第106-107页 |
4. 讨论 | 第107-113页 |
·RT-PCR 方法的构建 | 第107-108页 |
·白耳鸡不同生长阶段不同组织中ADSL 基因表达的变化规律 | 第108-109页 |
·白耳鸡不同生长阶段不同组织中GARS-AIRS-GART 基因表达的变化规律 | 第109-110页 |
·白耳鸡不同生长阶段不同组织中GPAT 基因表达的变化规律 | 第110-111页 |
·白耳鸡不同生长阶段不同组织中AIRC 基因表达的变化规律 | 第111页 |
·白耳鸡不同生长阶段不同组织中PURH 基因表达的变化规律 | 第111-112页 |
·5 个基因在胸肌中相对表达量的相关性 | 第112-113页 |
第四章 肌苷酸合成相关酶基因在白耳鸡群体中多基因聚合效应初探 | 第113-137页 |
1. 材料与方法 | 第113-114页 |
·试验动物 | 第113页 |
·主要溶液的配制及主要实验仪器 | 第113页 |
·引物序列 | 第113-114页 |
·试验方法 | 第114页 |
2. 相关软件及统计方法 | 第114页 |
·相关软件 | 第114页 |
·统计方法 | 第114页 |
3. 结果与分析 | 第114-133页 |
·12 周龄白耳鸡胸肌中肌苷酸含量 | 第114-115页 |
·各候选基因在白耳鸡群体中的基因频率及基因型频率 | 第115-116页 |
·5 个候选基因各基因型对白耳鸡胸肌肌苷酸含量的单基因效应分析 | 第116-117页 |
·5 个候选基因合并基因型对白耳鸡胸肌肌苷酸含量两基因效应分析 | 第117-120页 |
·5 个候选基因合并基因型对白耳鸡胸肌肌苷酸含量的三基因效应分析 | 第120-125页 |
·5 个候选基因合并基因型对白耳鸡胸肌肌苷酸含量的四基因效应分析 | 第125-131页 |
·5 个候选基因合并基因型对白耳鸡胸肌肌苷酸含量的五基因效应分析 | 第131-133页 |
4. 讨论 | 第133-137页 |
·白耳鸡胸肌中肌苷酸含量 | 第133页 |
·5 个候选基因对白耳鸡胸肌肌苷酸含量的单基因效应 | 第133-134页 |
·5 个候选基因合并基因型对白耳鸡胸肌肌苷酸含量的基因效应 | 第134-137页 |
全文结论 | 第137-140页 |
1. GPAT 基因外显子 2 的变异对鸡肉肌苷酸含量有显著影响 | 第137页 |
2. AIRC 基因外显子 3 和外显子 8 的变异对鸡肉肌苷酸含量有显著影响 | 第137页 |
3. GPAT/AIRC 基因启动子区的变异对鸡肉肌苷酸含量有显著影响 | 第137-138页 |
4. PURH 基因外显子 16 的变异对鸡肉肌苷酸含量有显著的影响 | 第138页 |
5. 在白耳鸡群体不同生长阶段不同组织中均检测到 5 个候选基因的表达,大多数基因的表达量呈时序性变化,并且不同基因的表达量之间存在一定的正相关 | 第138页 |
6. 多基因聚合后合并基因型对白耳鸡胸肌肌苷酸含量影响效果显著,合并的位点越多,效应越大 | 第138-140页 |
参考文献 | 第140-157页 |
致谢 | 第157-159页 |
攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第159-162页 |