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Ⅰ型鸭肝炎病毒ZJ-V株基因组全序列解析与RT-PCR检测方法建立

摘要第1-6页
Abstract第6-14页
文献综述第14-22页
 1 病原学研究第14-19页
   ·病原形态第14页
   ·分类地位第14-15页
   ·病毒增殖第15-16页
   ·病毒纯化第16页
   ·DHV-Ⅰ基因组基本结构第16-19页
     ·DHV-Ⅰ基因组非编码区第17-18页
     ·DHV-Ⅰ的基因组编码区第18-19页
 2 DHV病原检测第19-20页
   ·中和试验第19页
   ·琼脂扩散试验第19页
   ·免疫电镜第19页
   ·间接血凝抑制试验第19-20页
   ·荧光抗体技术第20页
   ·酶联免疫吸附试验与单克隆抗体技术第20页
 3 防治第20-21页
 4 展望第21-22页
1 引言第22-23页
2 材料与方法第23-34页
   ·材料第23页
     ·试验毒株第23页
     ·病料来源第23页
     ·工程菌与载体第23页
     ·主要试剂第23页
     ·主要仪器第23页
   ·ZJ-V株基因组全长cDNA分子克隆第23-30页
     ·引物设计与合成第23-24页
     ·病毒RNA的提取第24页
     ·cDNA第一链的合成第24-25页
     ·目的基因的PCR扩增第25-27页
       ·片段A的PCR扩增第25页
       ·片段B的PCR扩增第25页
       ·片段C的PCR扩增第25-26页
       ·片段D的PCR扩增第26页
       ·片段E的PCR扩增第26-27页
     ·PCR产物的纯化与回收第27页
     ·PCR产物的连接第27-28页
     ·感受态细胞的制备第28页
     ·感受态细胞的转化第28页
     ·重组质粒的提取第28-30页
     ·重组质粒的PCR鉴定第30页
     ·核苷酸序列测定第30页
   ·ZJ-V株全基因组序列解析第30-31页
     ·ZJ-V株全基因组核苷酸序列及编码的氨基酸序列分析第30页
     ·VP1的核苷酸及所编码的氨基酸序列结果与分析第30-31页
     ·分离株VP1的核苷酸序列系统进化关系分析第31页
     ·DVH-Ⅰ结构蛋白二级结构和B细胞抗原表位预测第31页
   ·Ⅰ型鸭病毒性肝炎RT-PCR检测方法的建立及初步应用第31-34页
     ·引物合成第31页
     ·病料处理第31-32页
     ·病毒总RNA抽提第32页
     ·对照菌/毒株的DNA或RNA抽提第32页
     ·基因组cDNA的合成第32页
     ·PCR扩增条件的优化第32页
     ·RT-PCR特异性试验第32页
     ·RT-PCR敏感性试验第32页
     ·应用RT-PCR对病料和分离毒株进行检测第32页
     ·鸡胚接种试验第32页
     ·DHV-Ⅰ增殖试验第32-34页
3 结果与分析第34-50页
   ·PCR扩增结果第34页
   ·重组质粒的鉴定第34-35页
   ·ZJ-V株全基因组核苷酸序列测定结果第35-36页
   ·ZJ-V株全基因组序列解析第36-46页
     ·P1区核苷酸序列比较及其推导的氨基酸序列分析第36-37页
     ·DHV-Ⅰ VP1编码区氨基酸差异分析第37页
     ·VP1系统进化树分析第37-38页
     ·P2区核苷酸序列比较及其推导的氨基酸序列分析第38-39页
     ·P3区核苷酸序列比较及其推导的氨基酸序列分析第39-40页
     ·5′端非编码区一级、二级结构分析第40-41页
     ·3′端非编码区(3′NCR)一级、二级结构分析第41-42页
     ·VP1蛋白预测的二级结构与B细胞表位预测第42-44页
     ·VP3蛋白预测的二级结构与B细胞表位预测第44-45页
     ·VP0蛋白预测的二级结构与B细胞表位预测第45-46页
   ·Ⅰ型鸭病毒性肝炎RT-PCR检测方法的建立第46-50页
     ·RT-PCR条件的优化第46-47页
     ·PCR特异性试验第47页
     ·RT-PCR检测DHV-Ⅰ型的敏感性第47-48页
     ·RT-PCR检测临床病料和阳性分离株检测结果第48页
     ·鸡胚接种试验结果第48页
     ·DHV病毒细胞培养结果第48-50页
4 讨论第50-55页
   ·P1结构蛋白编码区第50页
   ·P2非结构蛋白编码区第50页
   ·P3非结构蛋白编码区第50-51页
   ·3′端非编码区第51页
   ·5′端非编码区第51页
   ·VP1基因序列分析第51-53页
   ·DHV-Ⅰ结构蛋白预测二级结构第53页
   ·B细胞抗原表位预测结果第53-54页
   ·RT-PCR诊断方法的快速特异性第54页
   ·增殖病毒细胞模型选择第54页
   ·不同血清型的鉴定第54-55页
5 结论第55-56页
参考文献第56-61页
附录第61-68页
致谢第68-69页
作者简介第69页

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