| 摘要 | 第1-4页 |
| ABSTRACT | 第4-8页 |
| 第一章 论文的引出与研究计划 | 第8-14页 |
| ·现阶段药物研究概况 | 第8-12页 |
| ·药物研发过程 | 第8-9页 |
| ·目前药物设计开发中的艰难境地 | 第9页 |
| ·解决方法及国际进展 | 第9-11页 |
| ·生物相关性的提出 | 第11-12页 |
| ·论文研究计划 | 第12-14页 |
| 第二章 理论基础 | 第14-26页 |
| ·计算机辅助药物设计的概念 | 第14页 |
| ·计算机辅助药物设计的意义 | 第14-17页 |
| ·计算机辅助药物设计的研究方法 | 第17-20页 |
| ·药物作用的基本理论 | 第17-18页 |
| ·计算机辅助药物设计的方法分类 | 第18-19页 |
| ·直接药物设计 | 第19页 |
| ·间接药物设计 | 第19-20页 |
| ·计算机基础 | 第20-23页 |
| ·UNIX/LINUX 简介 | 第20-21页 |
| ·编程语言简介 | 第21-22页 |
| ·应用软件简介 | 第22-23页 |
| ·分子相似性理论 | 第23-26页 |
| ·分子相似性定义 | 第23页 |
| ·分子相似性计算方法及步骤 | 第23-25页 |
| ·分子相似性计算的本地实现 | 第25-26页 |
| 第三章 生物相关性理论的提出及定量计算 | 第26-36页 |
| ·背景 | 第26-27页 |
| ·生物相关性代表数据库的确定 | 第27-28页 |
| ·TCMD、CMC、ACD-3D、MDDR 数据库的准备 | 第28-29页 |
| ·TCMD | 第28页 |
| ·CMC | 第28页 |
| ·ACD-3D | 第28-29页 |
| ·MDDR | 第29页 |
| ·对数据库的处理 | 第29页 |
| ·BRCD、TCMD、CMC、ACD-3D、MDDR 数据库的分子性质计算 | 第29-30页 |
| ·TCMD、CMC、ACD-3D、MDDR 数据库的生物相关性计算 | 第30-31页 |
| ·Bayesian 模型计算方法 | 第30页 |
| ·分子相似性计算方法 | 第30-31页 |
| ·结果分析 | 第31-35页 |
| ·BRCD、TCMD、CMC、ACD-3D、MDDR 数据库的分子性质计算 | 第31-33页 |
| ·Bayesian 模型 | 第33页 |
| ·分子相似性计算方法 | 第33-35页 |
| ·论讨 | 第35-36页 |
| ·生物相关性与类药性的区别 | 第35页 |
| ·生物相关性指标的合理性 | 第35页 |
| ·生物相关性对药物研究中的应用 | 第35-36页 |
| 第四章 生物相关性在候选化合物库设计中的应用 | 第36-42页 |
| ·概述 | 第36页 |
| ·数据准备 | 第36页 |
| ·类药性计算 | 第36-37页 |
| ·生物相关性计算 | 第37页 |
| ·结果分析 | 第37-40页 |
| ·CMC 和MDDR 中各活性分子生物相关性比较 | 第37-38页 |
| ·生物相关性对药物筛选成功率的影响 | 第38-40页 |
| ·讨论 | 第40-42页 |
| 第五章 论文总结 | 第42-44页 |
| 参考文献 | 第44-48页 |
| 附录 1 图表索引 | 第48-50页 |
| 附录 2 攻读硕士期间已发表或准备发表的论文目录 | 第50-52页 |
| 致谢 | 第52页 |
