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牛12个基因的分离、定位、表达特征、SNPs检测及其与部分性状的关联分析

中文摘要第1-11页
英文摘要第11-14页
1.文献综述第14-30页
   ·牛的基因组计划和主要的三种基因图第14-15页
   ·表达序列标签(EST)在基因克隆中的应用第15-16页
   ·牛QTL定位研究现状第16-18页
   ·候选基因分析法克隆基因第18页
   ·牛的与肉质、采食和生长性状相关的候选基因第18-20页
   ·基因定位技术用于牛的研究现状第20页
   ·辐射杂种板(RH)用于牛染色体定位的研究现状第20-22页
   ·待分离基因的研究现状第22-30页
     ·胆囊收缩素促胰酶素(Cholcystokinin CCK)第22-23页
     ·谷氨酸脱羧酶(Glutamate decarboxylase GAD)第23-25页
     ·肠抑胃肽(Gastric inhibitory polypeptide GIP)第25-26页
     ·甘丙肽(Galanin GAL)第26-27页
     ·果糖二磷酸酶(Fructose-1,6-bisphosphatase FBP1)第27页
     ·磷酸酯酶(Phosphatase PSPH)第27页
     ·羧基肽酶(Carboxypeptidase CPB1)第27-28页
     ·PSMC1、PSMC2、PSMC4和PSMD1基因的研究及相关研究进展第28-30页
2.本研究的目的意义第30-31页
3.材料与方法第31-46页
   ·材料第31-35页
     ·DNA样品第31-32页
     ·组织样品第32页
     ·培养基、酶及试剂盒第32-33页
     ·菌株第33页
     ·主要试剂及配制第33-35页
       ·主要试剂第33-34页
       ·其它试剂的配制第34-35页
     ·主要仪器设备第35页
     ·主要分子生物学数据库及软件第35页
   ·方法第35-46页
     ·用于基因分离的引物的设计方法及引物序列第35-39页
     ·PCR扩增条件第39页
     ·产物的纯化、克隆,鉴定和测序第39-40页
     ·DNA序列同源性检索鉴定第40页
     ·候选基因cDNA全长序列的克隆方法第40-41页
     ·总RNA提取第41页
     ·RNA的甲醛凝胶电泳第41-42页
     ·RACE技术第42-43页
     ·RACE、RT-PCR产物的纯化、克隆,鉴定和测序第43页
     ·DNA序列同源性检索鉴定第43页
     ·基因的组织表达研究第43-44页
     ·分离基因物理定位的RH法第44-45页
       ·引物设计第44页
       ·PCR扩增分型方法第44-45页
     ·数据分析方法第45页
     ·基因的多态性检测方法第45页
     ·标记-性状关联分析第45-46页
       ·试验牛群第45-46页
       ·统计模型和软件第46页
4.结果第46-74页
   ·利用辐射杂种板(RH)进行精细定位结果第46-48页
   ·牛FBP1、CCK、CPB1和GIP基因的分离、鉴定及相关研究第48-56页
     ·总RNA的提取与检测结果第48-49页
     ·FBP1基因的RACE结果、cDNA序列分析和蛋白质的系统发生树第49-51页
     ·CCK基因的RACE结果及cDNA序列分析第51-52页
     ·CPB1基因的RACE结果及cDNA序列分析第52-55页
     ·GIP基因的RACE结果及cDNA序列分析第55-56页
   ·新分离的基因多态性检测结果第56-64页
     ·GAD1基因的多态性检测第56-58页
     ·GAD2基因的多态性检测第58-59页
     ·GIP基因的多态性检测第59-60页
     ·GAL基因的多态性检测第60-62页
     ·FBP1基因的多态性检测第62-63页
     ·PSMC1基因的多态性检测第63-64页
   ·不同基因多态性与性状的关联分析结果第64-70页
     ·GAD1基因SNP与部分性状的关联分析第65-66页
     ·GAL基因102位点SNP与部分性状的关联分析第66-67页
     ·GAL基因837位点SNP与部分性状的关联分析第67页
     ·GAD2基因Hae Ⅲ酶切多态与部分性状的关联分析第67-68页
     ·GIP基因SNP与部分性状的关联分析第68-69页
     ·FBP1基因SNP与部分性状的关联分析第69页
     ·PSMC1基因SNP与部分性状的关联分析第69-70页
   ·Real-time定量PCR第70-74页
     ·FBP1基因表达特征第70-72页
     ·PSPH基因的表达特征第72-73页
     ·PSMC1基因的表达特征第73-74页
5.讨论第74-83页
   ·关于基因的分离第74-75页
   ·关于基因的定位第75页
   ·关于SNP检测第75-77页
   ·关于总RNA质量和RACE方法第77页
   ·关于cDNA的分离和推导分析第77-78页
   ·关于基因多态性与性状的关联分析第78-81页
     ·GAD1和GAD2基因与性状的关联分析第79-80页
     ·基因与采食量、日增重等生产性状的关联分析第80页
     ·基因与背膘厚、眼肌面积等胴体性状的关联分析第80页
     ·基因与料肉比、净肉率、屠宰率等性状的关联分析第80-81页
     ·基因与胴体长、胴体胸深等胴体性状的关系第81页
     ·基因与胃、肠等消化器官发育有关性状的关联分析第81页
   ·关于荧光定量和RT-PCR分析基因在组织中的表达情况第81-83页
6.小结第83-86页
参考文献第86-105页
附录1 FBP1、CCK、GIP和CPB1基因的cDNA全长序列以及推导的氨基酸序列第105-109页
附录2 缩略词表第109-110页
附录3 主要性状的中英文对照和缩写第110-111页
在读期间已发表(待发表)论文和出版的著作第111-112页
致谢第112-113页

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