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猪FBXO32与其转录因子家族的基因克隆、定位、SNP检测及与生产性状的关联分析

摘要第1-9页
ABSTRACT第9-11页
1 文献综述第11-26页
   ·猪基因组计划和基因图谱第11-13页
   ·骨骼肌中蛋白合成和分解途径第13-15页
     ·骨骼肌中蛋白合成途径第13-14页
     ·猪骨骼肌蛋白质降解途径第14-15页
   ·FBXO32基因的研究进展第15-21页
     ·UPP途径第15-19页
     ·SCF-E3复合体的重要组成部分—FBXO32第19-21页
     ·FBXO32是催化骨骼肌肌肉萎缩的重要基因第21页
   ·调控FBXO32的FoxO转录因子基因家族的研究进展第21-26页
2 研究的目的意义第26-27页
3 材料和方法第27-40页
   ·材料第27-30页
     ·组织样品第27页
     ·DNA样品第27-28页
     ·培养基、工具酶及试剂盒第28页
     ·主要试剂及配制第28-29页
       ·主要试剂第28-29页
       ·主要试剂配制第29页
     ·主要仪器设备第29-30页
     ·数据库及分析软件第30页
       ·常用分子生物学网站第30页
       ·统计软件第30页
   ·方法第30-40页
     ·猪FBXO32、FoxO1、FoxO3a和FoxO4基因的分离方法第30-36页
       ·猪EST信息的获取和整理第30页
       ·引物设计第30-33页
       ·总RNA提取第33页
       ·RNA的甲醛凝胶电泳第33页
       ·反转录反应(Reverse transcription RT)第33页
       ·PCR扩增条件第33页
       ·RACE技术第33-34页
       ·PCR产物、RACE产物及RT-PCR产物的纯化、克隆和测序第34-36页
     ·四个基因染色体精细定位—RH法第36-37页
       ·引物设计第36页
       ·PCR扩增分型条件第36-37页
       ·数据分析方法第37页
     ·利用RT-PCR进行FBXO32编码区的扩增第37-38页
     ·利用RT-PCR进行FBXO32、FoxO1、FoxO3a和FoxO4基因组织表达谱研究的方法第38页
     ·PCR-RFLP方法检测猪FBXO32和FoxO3a基因的多态性第38-39页
       ·扩增引物第38页
       ·酶切条件第38-39页
       ·基因分型第39页
     ·多态标记与性状的关联分析方法第39-40页
4 结果第40-54页
   ·猪FBXO32、FoxO1、FoxO3a和FoxO4基因的分离、鉴定及相关研究第40-44页
     ·总RNA的提取与检测结果第40页
     ·分离猪FBXO32、FoxO1、FoxO3a和FoxO4基因的结果第40-41页
     ·猪FBXO32基因完整编码区(CDS)的序列分析第41-43页
       ·猪FBXO32基因cDNA序列分析结果第41-42页
       ·生物信息学分析序列第42-43页
     ·3'RACE获得猪Fox03a基因3'UTR结果第43-44页
   ·猪FBXO32、FoxO1、FoxO3a和FoxO4基因的染色体定位结果第44-47页
     ·利用SCHP的染色体区域定位结果第44-45页
     ·利用IMpRH的精细定位结果第45-47页
   ·猪FBXO32、FOxO1、FOxO3a和FoxO4基因的组织表达谱分析第47-48页
   ·猪FBXO32和FoxO3a基因的SNP检测及其与性状的关联分析第48-54页
     ·猪FBXO32基因第五内含子多态检测及与性状的关联分析第48-50页
       ·SNP检测结果第48页
       ·不同猪群基因型频率的检测结果第48-49页
       ·FBXO32基因多态与生产性状的关联分析第49-50页
     ·猪FoxO3a基因第二外显子多态检测及与性状的关联分析第50-54页
       ·SNP检测结果第50-51页
       ·不同猪群基因型频率的检测结果第51页
       ·FoxO3a基因第二外显子SNP与生产性状的关联分析第51-54页
5 讨论第54-59页
   ·关于基因的引物设计第54-55页
     ·RACE引物的设计及注意事项第54页
     ·定位引物的设计第54-55页
   ·基因的定位结果第55-56页
   ·关于基因的表达谱分析第56-57页
     ·猪EST的来源组织与表达谱结果的比较第56页
     ·同源基因在人和鼠的基因芯片分析结果与表达谱结果的比较第56-57页
   ·关于基因的多态性检测及性状的关联分析第57-59页
     ·FBXO32基因第五内含子的多态性第57-58页
     ·FoxO3a基因第二外显子的多态性第58-59页
6 小结第59-61页
   ·本研究获得的结果第59页
   ·本研究的创新点第59页
   ·本研究的不足之处第59-60页
   ·下一步值得研究的工作第60-61页
参考文献第61-66页
在读期间已发表(待发表)的论文及已申报的专利第66-67页
附录第67-72页
 附录1 缩略词表第67-68页
 附录2 主要性状的中英文对照和缩写第68-69页
 附录3 FBXO32基因第五内含子序列第69-70页
 附录4 FoxO3a基因3'UTR序列第70-71页
 附录5 FoxO3a基因第二外显子序列第71-72页
致谢第72页

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