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基因组中重复序列识别与分析

摘要第1-7页
Abstract第7-8页
第一章 绪论第8-15页
   ·引言第8-10页
   ·国内外研究现状和发展前景第10-13页
     ·研究现状第10-12页
     ·发展前景第12-13页
   ·论文的结构和主要贡献第13-15页
     ·论文的结构第13-14页
     ·论文的主要贡献第14-15页
第二章 生物学基础和相关工作第15-24页
   ·基因组和基因组中的重复序列第15-21页
     ·基因组第15-18页
     ·基因组中的重复序列第18-21页
   ·数据库文件格式和序列格式第21-23页
     ·数据库文件格式第21-22页
     ·序列文件格式第22-23页
   ·串联重复序列识别问题的提出及难点和挑战第23页
   ·小结第23-24页
第三章 精确串联重复识别算法第24-34页
   ·基本概念和问题描述第24-26页
     ·串联重复定义及相关推论第24-26页
     ·最大串联重复第26页
   ·后缀列和最大公共前缀列第26-29页
   ·算法及其理论基础第29-32页
     ·算法的理论基础第29-31页
     ·精确串联重复识别算法第31-32页
   ·算法实现第32-33页
   ·小结第33-34页
第四章 模糊串联重复识别算法第34-44页
   ·模糊串联重复的定义第34-35页
   ·双序列比对算法第35-41页
     ·双序列比对简介第35-37页
     ·动态规划全局序列比对算法第37-39页
     ·回绕动态规划算法第39-41页
   ·模糊串联重复识别算法第41-42页
   ·算法实现第42-43页
   ·小结第43-44页
第五章 算法具体应用和测试第44-49页
   ·实验数据和算法应用第44-47页
   ·算法测试第47页
   ·小结第47-49页
第六章 总结和展望第49-51页
   ·工作总结第49页
   ·未来工作展望第49-51页
致谢第51-52页
参考文献第52-56页

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