基因组中重复序列识别与分析
| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一章 绪论 | 第8-15页 |
| ·引言 | 第8-10页 |
| ·国内外研究现状和发展前景 | 第10-13页 |
| ·研究现状 | 第10-12页 |
| ·发展前景 | 第12-13页 |
| ·论文的结构和主要贡献 | 第13-15页 |
| ·论文的结构 | 第13-14页 |
| ·论文的主要贡献 | 第14-15页 |
| 第二章 生物学基础和相关工作 | 第15-24页 |
| ·基因组和基因组中的重复序列 | 第15-21页 |
| ·基因组 | 第15-18页 |
| ·基因组中的重复序列 | 第18-21页 |
| ·数据库文件格式和序列格式 | 第21-23页 |
| ·数据库文件格式 | 第21-22页 |
| ·序列文件格式 | 第22-23页 |
| ·串联重复序列识别问题的提出及难点和挑战 | 第23页 |
| ·小结 | 第23-24页 |
| 第三章 精确串联重复识别算法 | 第24-34页 |
| ·基本概念和问题描述 | 第24-26页 |
| ·串联重复定义及相关推论 | 第24-26页 |
| ·最大串联重复 | 第26页 |
| ·后缀列和最大公共前缀列 | 第26-29页 |
| ·算法及其理论基础 | 第29-32页 |
| ·算法的理论基础 | 第29-31页 |
| ·精确串联重复识别算法 | 第31-32页 |
| ·算法实现 | 第32-33页 |
| ·小结 | 第33-34页 |
| 第四章 模糊串联重复识别算法 | 第34-44页 |
| ·模糊串联重复的定义 | 第34-35页 |
| ·双序列比对算法 | 第35-41页 |
| ·双序列比对简介 | 第35-37页 |
| ·动态规划全局序列比对算法 | 第37-39页 |
| ·回绕动态规划算法 | 第39-41页 |
| ·模糊串联重复识别算法 | 第41-42页 |
| ·算法实现 | 第42-43页 |
| ·小结 | 第43-44页 |
| 第五章 算法具体应用和测试 | 第44-49页 |
| ·实验数据和算法应用 | 第44-47页 |
| ·算法测试 | 第47页 |
| ·小结 | 第47-49页 |
| 第六章 总结和展望 | 第49-51页 |
| ·工作总结 | 第49页 |
| ·未来工作展望 | 第49-51页 |
| 致谢 | 第51-52页 |
| 参考文献 | 第52-56页 |