| 中文摘要 | 第1-6页 |
| 英文摘要 | 第6-8页 |
| 第一章 生物信息学概述 | 第8-16页 |
| 1．1 生物信息学的定义及发展历史 | 第8页 |
| 1．2 生物信息学的主要研究内容 | 第8-13页 |
| 1．2．1 数据库 | 第9页 |
| 1．2．2 基因组 | 第9-10页 |
| 1．2．3 基因组序列分析 | 第10-11页 |
| 1．2．4 蛋白质结构与功能预测 | 第11-12页 |
| 1．2．5 基因多态性分析与药物设计 | 第12页 |
| 1．2．6 分子进化 | 第12-13页 |
| 1．3 生物信息学前景展望 | 第13-15页 |
| 参考文献 | 第15-16页 |
| 第二章 蛋白质结构类型的理论预测 | 第16-28页 |
| 前言 | 第16-17页 |
| 2．1 氨基酸相关性分析(AACA) | 第17-19页 |
| 2．2 结果计算 | 第19-24页 |
| 2．3 蛋白质结构预测 | 第24-26页 |
| 2．4 结论 | 第26-27页 |
| 参考文献 | 第27-28页 |
| 第三章 SARS冠状病毒主蛋白酶可切割多肽的搜索 | 第28-38页 |
| 前言 | 第28-29页 |
| 3．1 SARS冠状病毒主蛋白酶结构的确定 | 第29-30页 |
| 3．2 多肽类酶抑制剂 | 第30页 |
| 3．3 可切割多肽与“变型钥匙”模型 | 第30-32页 |
| 3．4 可切割多肽的搜索 | 第32-35页 |
| 3．5 多肽抑制剂的特征 | 第35-36页 |
| 3．6 结论 | 第36页 |
| 参考文献 | 第36-38页 |
| 第四章：SARS CoV M~(Pro)的多肽类抑制剂的合成与化学修饰 | 第38-56页 |
| 前言 | 第38-40页 |
| 4．1 八肽AVLQSGFR的合成与抑毒实验 | 第40-41页 |
| 4．2 蛋白酶与抑制剂的相互作用 | 第41-52页 |
| 4．2．1 对接和能量最低化 | 第41-45页 |
| 4．2．2 疏水-亲水相互作用 | 第45-47页 |
| 4．2．3 量子化学计算 | 第47-52页 |
| 4．3 八肽化学修饰 | 第52-54页 |
| 4．4 结论 | 第54页 |
| 参考文献 | 第54-56页 |
| 发表论文 | 第56-57页 |
| 致谢 | 第57-58页 |
| 附录 | 第58-60页 |
| ZCURVE_CoV 2.0软件的应用实例 | 第58-59页 |
| 生物信息学常用网站 | 第59-60页 |