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玉米EST文库的构建、部分EST功能注释及其数据库的管理系统

中文摘要第1-4页
英文摘要第4-8页
第一章 前言第8-27页
   ·玉米在生产中存在的问题第8-10页
     ·玉米生产的国内外状况第8页
     ·玉米的类型第8-9页
     ·玉米的生物学特性及种植区带第9页
     ·影响玉米产量的生物和非生物因素第9-10页
   ·渗透胁迫逆境对玉米生理和生化过程的影响第10-13页
     ·逆境对玉米的伤害第10页
     ·玉米抗逆性的生理生化机制第10-13页
   ·玉米抗逆的指标第13-14页
     ·玉米对旱胁迫的敏感器官及时期第13页
     ·玉米抗旱指标研究第13-14页
   ·提高和改良玉米抗逆能力的措施和方法第14-15页
   ·与分子育种相关的研究现状第15-26页
     ·数量性状第15页
     ·玉米基因克隆的一般方法第15-25页
     ·其它方差异表达模式第25-26页
   ·本研究目的第26-27页
第二章 材料和方法第27-40页
   ·材料第27-29页
     ·样品第27页
     ·菌株、质粒第27页
     ·培养基第27-28页
     ·抗菌书素及其使用浓度第28页
     ·溶液与缓冲液第28-29页
   ·方法第29-40页
     ·玉米栽培与处理第29-30页
     ·RNA操作注意事项第30页
     ·总RNA的提取第30-31页
     ·mRNA的纯化第31页
     ·RNA浓度及纯度的检测第31-32页
     ·RNA琼脂糖胶快速电泳检测第32页
     ·cDNA文库构建与转化菌体保存第32-33页
     ·cDNA文库PCR筛选第33-34页
     ·大规模提取质粒第34-35页
     ·DNA测序第35-36页
     ·序列处理第36-37页
     ·EST序列注释第37-38页
     ·表达序列标签注释数据库管理系统第38-40页
第三章 结果与分析第40-61页
   ·非生物胁迫处理的玉米和正常条件下玉米第40-41页
   ·mRNA第41页
   ·cDNA文库第41-42页
     ·从mRNA逆转录的双链cDNA第41页
     ·柱分级分离后的cDNA第41-42页
   ·重排cDNA文库第42-45页
     ·符合要求cDNA文库克隆的比例第42-43页
     ·重排cDNA文库克隆外源插入长度分布第43-45页
   ·大规模提取的质粒第45-46页
   ·EST序列第46-47页
   ·基因注释第47-49页
     ·BLASTn注释第47-48页
     ·BLASTx注释第48-49页
   ·干旱早期诱导蛋白的基因第49-51页
   ·EST功能注释管理系统第51-61页
第四章 讨论第61-64页
   ·水份胁迫参数第61页
   ·文库的质量第61页
   ·文库的特点第61-62页
   ·EST序列的与5’端测序与3’端测序的比较第62页
   ·MSSNDBEST系统管理EST数据库特点第62-63页
   ·干旱早期诱导蛋白基因注释分析第63页
   ·本研究的玉米EST功能注释系统第63-64页
参考文献第64-72页
附录第72-73页
致谢第73页

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