玉米EST文库的构建、部分EST功能注释及其数据库的管理系统
中文摘要 | 第1-4页 |
英文摘要 | 第4-8页 |
第一章 前言 | 第8-27页 |
·玉米在生产中存在的问题 | 第8-10页 |
·玉米生产的国内外状况 | 第8页 |
·玉米的类型 | 第8-9页 |
·玉米的生物学特性及种植区带 | 第9页 |
·影响玉米产量的生物和非生物因素 | 第9-10页 |
·渗透胁迫逆境对玉米生理和生化过程的影响 | 第10-13页 |
·逆境对玉米的伤害 | 第10页 |
·玉米抗逆性的生理生化机制 | 第10-13页 |
·玉米抗逆的指标 | 第13-14页 |
·玉米对旱胁迫的敏感器官及时期 | 第13页 |
·玉米抗旱指标研究 | 第13-14页 |
·提高和改良玉米抗逆能力的措施和方法 | 第14-15页 |
·与分子育种相关的研究现状 | 第15-26页 |
·数量性状 | 第15页 |
·玉米基因克隆的一般方法 | 第15-25页 |
·其它方差异表达模式 | 第25-26页 |
·本研究目的 | 第26-27页 |
第二章 材料和方法 | 第27-40页 |
·材料 | 第27-29页 |
·样品 | 第27页 |
·菌株、质粒 | 第27页 |
·培养基 | 第27-28页 |
·抗菌书素及其使用浓度 | 第28页 |
·溶液与缓冲液 | 第28-29页 |
·方法 | 第29-40页 |
·玉米栽培与处理 | 第29-30页 |
·RNA操作注意事项 | 第30页 |
·总RNA的提取 | 第30-31页 |
·mRNA的纯化 | 第31页 |
·RNA浓度及纯度的检测 | 第31-32页 |
·RNA琼脂糖胶快速电泳检测 | 第32页 |
·cDNA文库构建与转化菌体保存 | 第32-33页 |
·cDNA文库PCR筛选 | 第33-34页 |
·大规模提取质粒 | 第34-35页 |
·DNA测序 | 第35-36页 |
·序列处理 | 第36-37页 |
·EST序列注释 | 第37-38页 |
·表达序列标签注释数据库管理系统 | 第38-40页 |
第三章 结果与分析 | 第40-61页 |
·非生物胁迫处理的玉米和正常条件下玉米 | 第40-41页 |
·mRNA | 第41页 |
·cDNA文库 | 第41-42页 |
·从mRNA逆转录的双链cDNA | 第41页 |
·柱分级分离后的cDNA | 第41-42页 |
·重排cDNA文库 | 第42-45页 |
·符合要求cDNA文库克隆的比例 | 第42-43页 |
·重排cDNA文库克隆外源插入长度分布 | 第43-45页 |
·大规模提取的质粒 | 第45-46页 |
·EST序列 | 第46-47页 |
·基因注释 | 第47-49页 |
·BLASTn注释 | 第47-48页 |
·BLASTx注释 | 第48-49页 |
·干旱早期诱导蛋白的基因 | 第49-51页 |
·EST功能注释管理系统 | 第51-61页 |
第四章 讨论 | 第61-64页 |
·水份胁迫参数 | 第61页 |
·文库的质量 | 第61页 |
·文库的特点 | 第61-62页 |
·EST序列的与5’端测序与3’端测序的比较 | 第62页 |
·MSSNDBEST系统管理EST数据库特点 | 第62-63页 |
·干旱早期诱导蛋白基因注释分析 | 第63页 |
·本研究的玉米EST功能注释系统 | 第63-64页 |
参考文献 | 第64-72页 |
附录 | 第72-73页 |
致谢 | 第73页 |