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三个猪品种SLA-DQA基因多态性与仔猪腹泻的相关性分析

摘要第1-6页
Summary第6-12页
第一章 文献综述第12-23页
 1 仔猪腹泻病第12-13页
 2 MHC 概述第13-22页
   ·SLA 研究进展第14-17页
     ·SLAⅠ类分子及其基因第14-15页
     ·SLAⅡ类分子及其基因第15-17页
     ·SLAⅢ类基因及其研究第17页
   ·SLA 与生产性状的关系第17-22页
     ·SLA 单倍型与繁殖性能的关系第18页
     ·SLA 与猪抗病性状的关系第18-19页
     ·MHC-DQA 基因在其他物种上的研究进展第19-20页
     ·SLA-DQA 基因的研究进展第20-21页
     ·DQA 基因与疾病的相关性研究第21-22页
 3 本研究目的和意义第22-23页
第二章 材料和方法第23-34页
 1 试验材料第23-26页
   ·试验动物,地点、采样方法第23页
   ·主要试剂第23-24页
   ·主要仪器设备第24页
   ·试验地点第24页
   ·溶液试剂的配制第24-26页
 2 实验方法第26-32页
   ·基因组 DNA 的提取和检测第26-27页
     ·基因组 DNA 的提取第26-27页
     ·DNA 模板检测第27页
     ·核酸浓度检测和稀释第27页
   ·SLA-DQA 基因 PCR 扩增第27-29页
     ·引物设计第27-28页
     ·稀释引物第28页
     ·PCR 反应条件的确定第28页
     ·PCR 扩增产物检测第28-29页
   ·SLA-DQA 基因的 SSCP 检测第29页
   ·SLA-DQA 基因的克隆测序第29-32页
     ·目的片段的回收第29-30页
     ·感受态细胞的制备第30-31页
     ·连接转化第31页
     ·单菌落的克隆第31-32页
 3 统计分析方法第32-34页
   ·序列分析第32页
   ·基因频率和基因型频率的计算第32页
   ·遗传纯合度(Homozygosity)和杂合度(Heterozygosity)第32页
   ·有效等位基因数和多态信息含量第32-33页
   ·群体 Hardy-Weinberg 平衡检测第33页
   ·品种之间基因分布的差异显著性检验(卡方独立性检验)第33页
   ·基因型与仔猪腹泻评分进行最小二乘方差分析第33-34页
第三章 结果与分析第34-49页
 1 基因组 DNA 的提取结果第34-35页
 2 PCR-SSCP 检测结果第35-38页
   ·SLA-DQA 基因外显子 1 及部分内含子的 PCR-SSCP 多态性检测结果第35-36页
     ·DQA 基因 P1 扩增产物结果第35页
     ·DQA-P1 扩增结果的 SSCP 检测结果第35-36页
   ·SLA-DQA 基因外显子 2 及部分内含子的 PCR-SSCP 多态性检测结果第36页
     ·DQA 基因 P2 扩增产物结果第36页
     ·DQA-P2 扩增结果的 SSCP 检测结果第36页
   ·SLA-DQA 基因外显子 3 及部分内含子的 PCR-SSCP 多态性检测结果第36-37页
     ·DQA 基因 P3 扩增产物结果第36-37页
     ·DQA-P3 扩增结果的 SSCP 检测结果第37页
   ·SLA-DQA 基因外显子 3 及部分内含子的 PCR-SSCP 多态性检测结果第37-38页
     ·DQA 基因 P4 扩增产物结果第37-38页
     ·DQA-P4 扩增结果的 SSCP 检测结果第38页
 3. SLA-DQA 基因不同位点核苷酸位点变异第38-41页
   ·SLA-DQA 基因外显子 2 核苷酸位点变异第38-39页
   ·SLA-DQA 基因外显子 3 核苷酸位点变异第39-40页
   ·SLA-DQA 基因外显子 4 不同位点核苷酸位点变异第40-41页
 4. SLA-DQA 基因外显子 2、外显子 3、外显子 4 多态信息含量(PIC)、纯合度(Ho)、杂合度(He)和有效等位基因数分析第41-43页
 5 不同群体猪 SLA-DQA 基因与基因型频率分布第43-46页
   ·SLA-DQA 基因外显子 2 基因及基因型频率分布及 Hardy-Weinberg 平衡检测...第43-44页
   ·SLA-DQA 外显子 3 基因及基因型频率分布及 Hardy-Weinberg 平衡检测第44-45页
   ·SLA-DQA 外显子 4 基因及基因型频率分布及 Hardy-Weinberg 平衡检测第45-46页
 6 SLA-DQA 基因外显子 2、3、4 与仔猪腹泻的相关性分析第46-49页
第四章 讨论与分析第49-54页
 1 猪 SLA-DQA 基因的遗传分析第49-54页
   ·SLA-DQA 基因外显子 1 多态性第49页
   ·SLA-DQA 基因外显子 2、外显子 3 和外显子 4 的多态性分析第49-52页
   ·Hardy-Weinberg 平衡检测结果的分析第52页
   ·SLA-DQA 基因与仔猪腹泻的相关性分析第52-54页
第五章 结论第54-55页
参考文献第55-63页
致谢第63-64页
作者简介第64-65页
导师简介第65-66页

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