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上海地区小家鼠MUS MUSCULUS CASTANEUS群体遗传结构研究

摘要第1-8页
ABSTRACT第8-15页
1 引言第15-31页
   ·小家鼠进化遗传学研究现状第15-20页
     ·小家鼠进化遗传学研究位标第15-17页
     ·小家鼠分子进化遗传研究现状第17-19页
     ·分子系统学的方法论第19-20页
   ·小家鼠资源利用现状第20-23页
     ·小家鼠在研究人类复杂疾病中的优势第20-21页
     ·小家鼠资源应用于复杂疾病易感基因研究进展第21-23页
   ·本研究相关技术研究进展第23-29页
     ·荧光-构象敏感凝胶电泳第23-25页
     ·LDR-测序仪电泳SNP分型技术第25-27页
     ·通用荧光引物在荧光PCR反应中的应用第27-29页
   ·本研究目的和意义第29-31页
     ·研究目的第29页
     ·研究意义第29-31页
2 材料与方法第31-45页
   ·小家鼠样本采集第31-32页
   ·实验仪器及试剂第32-35页
     ·实验仪器第32-33页
     ·实验试剂第33页
     ·溶液配制方法第33-35页
   ·实验方法第35-43页
     ·小鼠DNA抽提及保存第35页
     ·荧光构象敏感聚丙烯酰胺凝胶电泳筛查碱基突变第35-38页
     ·DNA测序第38-39页
     ·微卫星序列扩增及检测第39-41页
     ·LDR-测序仪SNP分型第41-43页
     ·所用软件和网络数据库资源第43页
   ·统计学分析方案第43-45页
3 结果分析第45-60页
   ·鼠尾组织基因组DNA电泳第45页
   ·F-CSGE检测线粒体未知突变第45-49页
     ·F-CSGE的SNPs检测效果第45-46页
     ·F-CSGE峰型状态与突变DNA区段关系第46-47页
     ·线粒体DNA编码区SNPs第47-48页
     ·标签mtSNPs选择第48-49页
   ·autosomal STR分型及群体遗传结构第49-53页
     ·autosomal STR等位基因组成第49-50页
     ·autosomal STR多态性及群体遗传杂合度第50-51页
     ·autosomal STR哈代-温伯格平衡和群体遗传分化第51-52页
     ·群体间的亲缘关系及系统进化树第52-53页
   ·mtSNPs分型结果及遗传结构分析第53-58页
     ·mtSNPs分型结果第53-54页
     ·mtSNPs单倍型组成第54-55页
     ·mtSNPs单倍型多态性分析第55-56页
     ·mtSNPs祖先单倍型分析第56-57页
     ·mtSNPs在群体内及群体间多态性分析第57页
     ·群体间的亲缘关系及系统进化树第57-58页
   ·综合两类遗传标记构建系统进化树第58-60页
4 讨论第60-63页
   ·上海地区小家鼠常染色体STR多态性第60页
   ·上海地区小家鼠MTSNPs多态性第60-62页
     ·mtSNPs单体型比较和小鼠迁移假说第60-61页
     ·mtSNPs多态性应用群体遗传结构优势第61-62页
   ·mtSNPs和autosomal STR数据在构建系统进化树中的差异比较第62-63页
5 结论和展望第63-64页
参考文献第64-69页
课题来源第69-70页
攻读硕士学位期间发表学术论文目录第70-71页
致谢第71页

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