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多倍体鱼转座子的遗传变异和雌核发育鱼性腺发育的分子生物学研究

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-10页
缩略语表第10-15页
第一章 前言和文献综述第15-52页
   ·DNA转座子研究进展第15-30页
     ·转座子的结构和分类第16-21页
     ·转座子的转座机理第21-26页
     ·转座子对基因组进化的影响第26-28页
     ·鱼类DNA转座子第28-29页
     ·展望第29-30页
   ·高迁移率族蛋白研究进展第30-43页
     ·HMGB1的分子结构第31-33页
     ·HMGB1的分子进化第33-35页
     ·HMGB1的核内功能第35-38页
     ·HMGB1的核外功能第38-40页
     ·HMGB1与转座子第40-43页
   ·抑制性消减杂交技术介绍及应用第43-51页
     ·基因差异表达研究技术第43-46页
     ·SSH技术原理第46-47页
     ·SSH技术操作流程第47-48页
     ·SSH技术研究应用第48-51页
   ·本项研究的目的和意义第51-52页
第二章 TC1转座子在多倍体杂交鱼内的遗传变化第52-84页
   ·材料和方法第53-60页
     ·动物和杂交第53-54页
     ·基因组DNA的提取和PCR扩增第54-55页
     ·序列分析第55页
     ·PCR扩增转座子的侧翼序列第55-57页
     ·基因组大小的测定第57页
     ·斑点杂交第57-58页
     ·Southern Blot杂交第58-59页
     ·聚类分析第59-60页
   ·结果第60-79页
     ·多倍体杂交鱼第60页
     ·不同倍性鱼的Tc1转座子第60-61页
     ·团头鲂分离出转座子Tmal的特征第61-64页
     ·四倍体鲫鲂转座子Ttel第64-67页
     ·侧翼序列分析第67-70页
     ·Tma1的分子遗传变异第70-73页
     ·不同倍性鱼基因组大小第73-75页
     ·不同倍性鱼的Tc1拷贝数第75-78页
     ·Tma1的聚类分析第78-79页
   ·讨论第79-84页
第三章 不同倍性鲫鲂高迁移率族蛋白基因克隆和原核表达第84-105页
   ·材料与方法第85-93页
     ·材料和试剂第85页
     ·总RNA提取第85-86页
     ·引物设计与RT-PCR扩增第86页
     ·RACE PCR克隆HMG1基因末端序列第86-89页
     ·序列拼接和同源性分析第89-90页
     ·生物信息学和系统进化分析第90页
     ·重组HMG1原核表达载体的构建第90-91页
     ·原核表达和SDS—PAGE检测第91-93页
   ·结果第93-102页
     ·总RNA提取和RT—PCR扩增结果第93-94页
     ·HMG1基因cDNA全长拼接及同源性比较第94-97页
     ·HMG生物信息学分析第97-98页
     ·HMG1系统进化分析第98-99页
     ·原核表达及SDS—PAGE检测第99-102页
   ·讨论第102-105页
第四章 雌核发育鱼卵巢发育基因鉴定和表达分析第105-126页
   ·材料和方法第106-114页
     ·动物材料第106-107页
     ·卵巢组织学观察第107-108页
     ·RNA的分离和cDNA的合成第108页
     ·抑制性消减杂交第108-110页
     ·构建SSH文库第110页
     ·斑点杂交筛选SSH文库第110-111页
     ·序列分析第111页
     ·基因表达的RT—PCR分析第111-112页
     ·定量RT—PCR分析第112-113页
     ·PMC基因的RACE—PCR克隆和组织表达分析第113-114页
   ·结果第114-122页
     ·性腺结构观察第114页
     ·增殖期卵巢cDNA接头连接效率第114-115页
     ·消减文库cDNA克隆片段大小的鉴定第115-116页
     ·筛选抑制性消减杂交文库第116-117页
     ·差异表达基因的序列分析第117-119页
     ·基因的表达分析第119-120页
     ·PMC基因的定量RT—PCR分析第120-121页
     ·PMC基因的RACE—PCR克隆和组织表达分析第121-122页
   ·讨论第122-126页
第五章 总结第126-129页
参考文献第129-143页
实验主要试剂与配制方法第143-144页
攻读博士学位期间已发表和待发的学术论文第144-145页
致谢第145-147页

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