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利用Red重组系统构建dsRNA原核表达体系抗烟草花叶病毒的研究

中文摘要第1-15页
Abstract第15-18页
1 前言第18-39页
   ·植物抗病毒基因工程第18-24页
     ·利用病毒来源的基因的抗病毒策略第18-22页
     ·利用非病毒来源的基因的策略第22-24页
   ·RNA 介导的病毒抗性与PTGS第24-26页
   ·RNaseIII 超家族与 dsRNA第26-33页
     ·I 型RNaseIII:细菌的RNaseIII 酶和酿酒酵母的Rnt1 酶第28-30页
     ·II 型RNaseIII:Drosha 酶类第30页
     ·III 型RNaseIII:Dicer 酶类第30-31页
     ·RNaseIII 在生命科学领域内的应用第31-33页
   ·基因打靶技术第33-37页
     ·基因打靶的原理第33-34页
     ·打靶载体的构建第34页
     ·外源DNA 导人的方式第34页
     ·基因打靶的筛选方法第34-36页
     ·基因打靶的策略第36-37页
   ·本研究的目的和意义第37-39页
2 研究报告第39-101页
 第一章 原核表达 dsRNA 抗烟草花叶病毒体系的构建第39-88页
   ·材料第39-43页
     ·菌株、质粒、培养基和试剂第39-41页
     ·引物第41-43页
     ·TMV 毒源第43页
   ·方法第43-70页
     ·大肠杆菌感受态细胞的制备第43-44页
     ·质粒pKD46 向大肠杆菌中的转化第44页
     ·质粒pKD46 的提取第44-45页
     ·质粒pKD46 的酶切鉴定第45-46页
     ·线性打靶DNA 片段的制备第46页
     ·JM109(DE3)/pKD46 和 HMS174(DE3)PlysS/pKD46 电转化感受态细胞的制备第46-47页
     ·M-JM109 和 M-HMS174 突变体的构建第47页
     ·M-JM109lacY 突变体的构建第47-48页
     ·菌落直接法PCR 初步筛选重组菌株第48-49页
     ·点杂交和测序进一步鉴定构建的缺失体第49-52页
       ·大肠杆菌基因组DNA 的提取第49-50页
       ·DNA 探针的标记第50-51页
       ·DNA 的固定第51页
       ·预杂交和杂交第51-52页
       ·杂交信号的检测第52页
     ·dsRNA 原核表达载体的构建第52-58页
       ·LCP480 载体的构建第53-54页
       ·pET-CP480 载体的构建第54-55页
       ·pGEM-CP480 载体的构建第55-58页
     ·dsRNA 的诱导表达第58-59页
     ·dsRNA 的提取第59-60页
       ·小量提取dsRNA的方法(Trizol法)第59-60页
       ·大量提取dsRNA 的方法第60页
     ·荧光定量PCR 方法分析dsRNA 的相对表达量第60-61页
     ·dsRNA 介导的病毒抗性鉴定第61页
     ·植物总RNA 的提取第61-62页
     ·植物总RNA 杂交步骤第62-67页
       ·RNA 探针的制备第62-63页
       ·DIG 标记有效性检测第63-64页
       ·甲醛变性凝胶电泳第64-65页
       ·转膜第65-66页
       ·杂交第66-67页
       ·化学发光法检测第67页
     ·siRNA 提取和杂交第67-70页
       ·siRNA 提取第67-68页
       ·PAGE 电泳第68页
       ·转膜第68-69页
       ·siRNA 杂交和检测第69-70页
     ·间接ELISA 检测第70页
   ·结果与分析第70-88页
     ·rnc 基因和LacY 基因缺失突变株的制备第70-76页
       ·pKD46 质粒导入大肠杆菌菌株第70-71页
       ·打靶DNA 片段的扩增第71页
       ·JM109 (DE3)菌株rnc 基因的敲除第71-72页
       ·HMS174(DE3)PlysS 菌株 rnc 基因的敲除第72页
       ·M-JM109 菌株LacY 基因的敲除第72-76页
     ·不同原核表达载体的构建第76-82页
       ·LCP480 载体的构建第76-77页
       ·pET-CP480 载体的构建第77-80页
       ·pGEM-CP480 载体的构建第80-82页
     ·dsRNA 的诱导表达第82-85页
     ·dsRNA 介导的病毒抗性第85-86页
     ·Northern blot第86-88页
 第二章 原核表达的 TMV 不同功能基因 dsRNA 介导的抗病性比较研究第88-101页
   ·材料与方法第88-93页
     ·菌株和质粒第88-89页
     ·引物第89-91页
     ·方法第91-93页
       ·TMV 不同功能基因的克隆第91-92页
       ·TMV 不同功能基因发夹结构表达载体的构建第92-93页
       ·dsRNA 的表达、提取和分析第93页
       ·TMV 不同功能基因的dsRNA 介导的病毒抗性鉴定第93页
       ·TMV 不同功能基因的探针的制备第93页
   ·结果与分析第93-101页
     ·TMV 不同功能基因的克隆第93-94页
     ·TMV 不同功能基因发夹结构表达载体的构建第94-97页
     ·dsRNA 的表达、提取和分析第97-98页
     ·TMV 不同功能基因dsRNA 介导的病毒抗性鉴定第98-99页
     ·Northern blot第99-101页
3 讨论第101-106页
   ·大肠杆菌 rnc 基因缺失体的构建第101页
   ·原核表达 dsRNA 的最佳体系的建立第101-102页
   ·RNA 干扰和PTGS第102-104页
   ·TMV 不同功能基因来源的 dsRNA 介导的抗病性比较第104-106页
4 结论第106-107页
5 参考文献第107-120页
6 附录第120-133页
   ·质粒图谱第120-121页
     ·L4440 载体图和相关序列位点第120-121页
     ·pGEM~(?)-T Easy 载体图和相关序列位点第121页
     ·pET-22b(+)载体图和相关序列位点第121页
   ·常用培养基的配制第121-122页
   ·抗生素的配制第122-123页
   ·常用缓冲液和试剂的配制第123-126页
   ·克隆的基因序列第126-133页
     ·TMV 复制酶蛋白基因部分序列第126-128页
     ·TMV 运动蛋白基因部分序列第128-131页
     ·TMVRNA 聚合酶蛋白基因部分序列第131-133页
7 致谢第133-134页
8 攻读学位期间发表论文情况第134页

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