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MicroRNA重要位点的信息熵分析和高粱microRNA及其靶基因预测

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-10页
第一章 文献综述第10-27页
   ·关于miRNA第10-22页
     ·miRNA 的发现第10-11页
     ·miRNA 的特征及其基因组织形式第11-13页
     ·miRNA 的生物产生第13-17页
     ·miRNA 的作用机制第17-20页
     ·miRNA 的功能第20-22页
   ·香农信息熵简介第22页
   ·高粱简介第22页
   ·miRNA基因的发现方法第22-24页
     ·直接克隆法(direct cloning)第22-23页
     ·正向遗传学筛选(forward genetics)第23页
     ·生物信息学预测第23-24页
     ·前人关于生物信息学预测方法的使用第24页
   ·Perl编程语言、RNAShapes软件、基因勘测序列(GSS)第24-25页
     ·Perl 编程语言第24-25页
     ·RNAShapes 软件第25页
     ·基因勘测序列(GSS)第25页
   ·研究的目的和意义第25-27页
第二章 材料与方法第27-32页
   ·实验材料第27页
     ·miRNA 数据第27页
     ·高粱GSS 序列第27页
   ·试验方法第27-32页
     ·Perl 语言程序第27页
     ·信息熵方法对miRNA 的研究第27-29页
     ·预测高粱miRNA 的数据处理第29-32页
第三章 实验结果第32-42页
   ·信息熵分析实验结果第32-36页
     ·模拟数据结果第32页
     ·动物前体miRNA第32-33页
     ·植物前体miRNA第33-35页
     ·病毒前体miRNA第35-36页
   ·生物信息学预测miRNA的结果第36-42页
     ·17 条新的候选miRNAs第36-38页
     ·miR1279 家族和 miR827 家族分别有 4 个和 2 个成员第38-41页
     ·miRNA 的保守性第41页
     ·潜在靶基因第41-42页
第四章 实验讨论与分析第42-46页
   ·信息熵分析结果的讨论第42-44页
     ·动物,植物和病毒miRNA 前体的区别第42页
     ·保守性与酶第42-43页
     ·多数位点之间具有关联性第43页
     ·具有高度保守性的位点第43-44页
   ·生物信息学预测结果的讨论第44-46页
第五章 结论和创新点第46-47页
   ·结论第46页
   ·创新点第46-47页
参考文献第47-54页
致谢第54-55页
作者简介第55-56页
附录第56-69页

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