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苦荞籽粒发育期cDNA文库的构建及部分EST分析

摘要第1-5页
ABSTRACT第5-10页
第一章 文献综述第10-29页
   ·荞麦籽粒成分第10-14页
     ·荞麦籽粒蛋白质成分第10页
     ·荞麦蛋白质氨基酸组成第10页
     ·荞麦中的特殊蛋白质第10-12页
     ·荞麦蛋白质的生理功能第12页
     ·荞麦籽粒中的生物类黄酮第12-14页
     ·其他营养素第14页
   ·cDNA 文库第14-17页
     ·cDNA 文库的构建第15-16页
     ·新型cDNA 文库第16页
     ·cDNA 全长文库第16-17页
     ·cDNA 文库分析与评价第17页
     ·cDNA 文库克隆基因第17页
     ·RACE 法第17页
   ·SMART 技术构建全长cDNA 文库第17-23页
   ·引物设计第23-24页
   ·表达序列标签(EST)第24-26页
     ·基因识别及发现新基因第24-25页
     ·以EST 分析基因表达丰度第25页
     ·EST 与基因遗传图谱的绘制第25页
     ·利用EST 数据库进行电子克隆第25页
     ·基因组功能注释第25-26页
     ·通过EST 寻找SSR 和SNP 分子标记第26页
   ·EST 分析第26-27页
     ·EST 数据预处理第26-27页
     ·基因的注释和功能分类第27页
   ·研究的目的和意义第27-29页
第二章 苦荞籽粒发育期cDNA 文库的构建及部分测序第29-38页
   ·材料与试剂第29-30页
     ·植物材料第29页
     ·主要试剂第29页
     ·主要溶液第29页
     ·所用主要仪器第29-30页
   ·RNA 的提取、纯化与检测第30-31页
     ·Trizol 提取总RNA 及检测第30页
     ·Concert~(TM) plant RNA Reagent 提取总RNA 与检测第30-31页
     ·RNA 样品的DNase 处理第31页
   ·cDNA 文库的构建第31-36页
     ·cDNA 第一链的合成第31-32页
     ·cDNA 的LD-PCR(long distance PCR)扩增第32页
     ·蛋白酶K 消化第32-33页
     ·sfi I 消化第33页
     ·CHROMA SPIN-400 Column 分级分离cDNA第33-34页
     ·cDNA 与λTriplEx2 载体的连接第34页
     ·包装反应第34页
     ·文库滴度的测定第34-35页
     ·文库重组率的鉴定第35-36页
   ·插入片段的检测及分析第36-38页
     ·λ噬菌体文库的质粒化第36页
     ·质粒提取第36页
     ·质粒插入片段的PCR 检测第36-37页
     ·插入片段的测序第37-38页
第三章 结果及分析第38-54页
   ·总RNA 的提取第38-39页
   ·LD- PCR 扩增第39-40页
   ·CHROMA SPIN-400 Column 分级分离cDNA第40页
   ·cDNA 文库的滴度第40-41页
   ·cDNA 文库的重组率检测第41页
   ·噬菌体质粒化以及插入片段的PCR 检测第41-43页
     ·噬菌体质粒化第41-42页
     ·质粒中插入片段的PCR 扩增第42-43页
     ·插入片段长度统计第43页
   ·讨论第43-45页
     ·RNA 提取方法第43-44页
     ·RNA 电泳检测第44页
     ·DNase 处理RNA第44页
     ·LD- PCR 扩增第44页
     ·CHROMA SPIN-400 Column 分级分离cDNA第44页
     ·cDNA 与λTriplEx2 载体的连接第44-45页
     ·文库滴度的鉴定第45页
   ·EST 生物信息学分析第45-54页
结论第54-55页
参考文献第55-58页
附录 1:缩略词第58-59页
附录 2:引物序列第59-60页
附录 3:EST 登陆号第60-61页
附录 4:总 RNA 提取第61-62页
附录 5:质粒提取及 PCR 扩增第62-69页
致谢第69-70页
作者简介第70页

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