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室温稳定PCR试剂及其在鼠疫菌检测中的应用的研究

中文摘要第1-8页
ABSTRACT第8-10页
缩略词表第10-11页
前言第11-19页
 一、鼠疫和鼠疫菌第11-12页
 二、鼠疫菌检测的研究概况第12-15页
 三、PCR 试剂稳定性的研究概况第15-16页
 参考文献第16-19页
一、实验材料第19-21页
   ·菌株及所用基因组DNA第19-20页
   ·主要试剂第20页
   ·主要仪器设备第20-21页
二、实验方法第21-28页
   ·细菌培养及细菌DNA 提取第21页
     ·细菌培养第21页
     ·细菌基因组 DNA 提取第21页
   ·鼠疫菌实时定量PCR 引物和探针的设计与合成第21-22页
     ·实时定量PCR 引物和探针以及克隆PCR 引物的初筛第21-22页
   ·定量PCR 反应体系及程序的优化第22-23页
     ·定量PCR 反应体系第22-23页
     ·不同DNA 聚合酶比较第23页
     ·引物和TaqMan 探针浓度的优化第23页
     ·镁离子用量的优化第23页
     ·反应程序的优化第23页
   ·定量标准品及定量标准曲线的制备第23-25页
     ·常规PCR 反应体系(25μl)第23页
     ·常规PCR 反应程序第23页
     ·PCR 产物纯化第23-24页
     ·连接产物和T 载体第24页
     ·大肠杆菌感受态细胞制备第24页
     ·重组质粒的转化第24页
     ·阳性克隆的鉴定第24页
     ·重组质粒小量提取第24-25页
     ·制备定量标准品并计算其相应拷贝数第25页
   ·特异性实验第25页
   ·灵敏度实验第25-26页
   ·试剂产品化及稳定性实验第26页
     ·试剂产品化方法第26页
     ·试剂产品化的稳定性评估第26页
   ·模拟污染土壤样本实验第26-27页
     ·模拟污染土壤样本的制备第26-27页
     ·从模拟污染土壤样本中提取DNA 的处理步骤第27页
     ·定量PCR 检测模拟污染土壤样本的灵敏度实验第27页
     ·定量PCR 检测模拟污染土壤样本的特异性实验第27页
     ·定量PCR 检测模拟污染土壤样本的盲测实验第27页
   ·与国外同类试剂比较第27-28页
三、实验结果第28-35页
   ·定量PCR 反应体系、程序的优化第28页
   ·定量标准曲线的制备第28-29页
   ·特异性实验第29-32页
   ·灵敏度实验第32-33页
   ·试剂产品化的稳定性评价第33-34页
   ·模拟污染土壤样本实验第34页
     ·土壤样本的灵敏度实验第34页
     ·土壤样本的特异性实验第34页
     ·土壤样本的盲测实验第34页
   ·与国外同类试剂比较第34-35页
四、讨论第35-37页
附录第37-41页
 附录1:荧光定量PCR 试剂考核实验原始记录第37-41页
综述第41-48页
 鼠疫菌检测的研究进展第41-45页
 参考文献第45-48页
个人简历第48-49页
致谢第49页

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