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全基因组选择和育种模拟在纯系育种作物亲本选配和组合预测中的利用研究

摘要第6-8页
abstract第8-9页
英文缩略表第13-14页
第一章 引言第14-30页
    1.1 分子标记辅助选择育种方法概述第14-16页
    1.2 全基因组选择预测模型研究进展第16-23页
        1.2.1 线性预测模型第16-19页
        1.2.2 Beyas模型第19-21页
        1.2.3 机器学习模型第21-23页
    1.3 显性和上位性基因型效应的预测第23-24页
    1.4 多性状和多环境预测模型第24-25页
    1.5 不同预测模型的整合第25-26页
    1.6 影响模型预测效果的因素第26-27页
    1.7 全基因组选择在植物育种中的应用研究第27页
    1.8 育种模拟原理及其在植物育种中的应用第27-28页
    1.9 本研究的目的和意义第28-30页
第二章 基于全基因组选择的杂交组合预测模拟研究第30-39页
    2.1 前言第30-31页
    2.2 材料与方法第31-34页
        2.2.1 材料第31页
        2.2.2 全基因组选择模型第31页
        2.2.3 模拟第31-33页
        2.2.4 杂交组合有效性与遗传增益的计算第33-34页
    2.3 结果第34-37页
        2.3.1 不同模型在不同结构下对遗传方差和杂交组合有效性的预测结果第34-36页
        2.3.2 不同杂交组合预测方法的遗传增益第36-37页
    2.4 讨论第37-39页
        2.4.1 影响遗传方差和杂交组合有效性预测准确率的因素第37页
        2.4.2 在杂交组合预测中考虑遗传方差能提高遗传增益第37-38页
        2.4.3 模拟研究的假设条件第38-39页
第三章 小麦产量和品质协同改良的亲本选配研究第39-50页
    3.1 前言第39页
    3.2 材料与方法第39-41页
        3.2.1 群体表型数据第39-40页
        3.2.2 表型分析和选择指数构建第40页
        3.2.3 群体基因型数据第40页
        3.2.4 全基因组选择模型第40-41页
        3.2.5 亲本选配方案第41页
    3.3 结果第41-46页
        3.3.1 方差分析结果和性状相关第41页
        3.3.2 不同GS模型对性状的预测准确率第41-44页
        3.3.3 后代群体中均值、遗传方差以及性状相关的结果第44-45页
        3.3.4 不同亲本选配方案的结果第45-46页
    3.4 讨论第46-50页
        3.4.1 后代群体中不同性状的均值和方差对杂交组合有效性的影响第46-47页
        3.4.2 利用选择指数进行亲本选配以同时改良产量和品质第47-50页
第四章 在全基因组选择中拟合上位性效应的研究第50-60页
    4.1 前言第50-51页
    4.2 材料与方法第51-53页
        4.2.1 表型与基因型第51页
        4.2.2 GS预测模型第51-53页
        4.2.3 交叉验证第53页
    4.3 结果第53-58页
        4.3.1 水稻群体中不同模型预测的结果第53页
        4.3.2 黄淮南片小麦训练群体中不同模型预测的结果第53-54页
        4.3.3 黄淮北片小麦训练群体中不同模型预测的结果第54-58页
    4.4 讨论第58-60页
        4.4.1 包含上位性效应能显著提高模型的预测效果第58页
        4.4.2 影响上位性效应预测效果的因素第58-60页
第五章 全基因组选择中多环境预测的研究第60-66页
    5.1 前言第60页
    5.2 材料与方法第60-61页
        5.2.1 表型和基因型数据第60页
        5.2.2 GS模型第60-61页
        5.2.3 交叉验证第61页
    5.3 结果第61-63页
        5.3.1 不同地点之间性状的相关性第61页
        5.3.2 多环境模型预测准确率第61-63页
    5.4 讨论第63-66页
第六章 全文结论与讨论第66-69页
    6.1 全文结论与讨论第66-67页
    6.2 全基因组选择应用于作物育种时有待进一步研究的问题第67-69页
参考文献第69-79页
附录第79-87页
致谢第87-88页
作者简历第88页

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