| 附表 | 第3-6页 |
| 摘要 | 第6-7页 |
| abstract | 第7-8页 |
| Chapter-1 Introduction | 第12-30页 |
| 1.1 Starch | 第12-14页 |
| 1.1.1 Structure of starch | 第13页 |
| 1.1.2 Formation of starch | 第13-14页 |
| 1.2 The enzymes involved in starch biosynthesis | 第14-17页 |
| 1.2.1 Synthesis of ADP-glucose,the precursor of starch biosynthesis | 第14-15页 |
| 1.2.2 The enzymes involved in amylose synthesis | 第15页 |
| 1.2.3 Starch branching enzyme(SBE) | 第15-17页 |
| 1.2.4 Debranching enzyme(DBE) | 第17页 |
| 1.3 Starch synthase(SS) | 第17-21页 |
| 1.3.1 Role of SSIV in starch formation | 第19页 |
| 1.3.2 SSIV in Arabidopsis | 第19-20页 |
| 1.3.3 SSIV in Rice | 第20页 |
| 1.3.4 SSIV in Wheat | 第20-21页 |
| 1.4 TILLING | 第21-25页 |
| 1.5 EcoTILLING | 第25-26页 |
| 1.6 DNA markers and their application in wheat breeding | 第26-29页 |
| 1.6.1 Marker assisted evaluation of germplasm resources for plant breeding | 第27-28页 |
| 1.6.2 Linkage and association analysis | 第28页 |
| 1.6.3 Populations for association analysis | 第28-29页 |
| 1.6.4 Grain trait related genes and their FMs | 第29页 |
| 1.7 The purpose of present study | 第29-30页 |
| Chapter-2 Material and methods | 第30-35页 |
| 2.1 Material | 第30页 |
| 2.2 DNA extraction and pool strategy | 第30-31页 |
| 2.2.1 Buffer stock solution | 第30-31页 |
| 2.2.2 DNA extraction protocol | 第31页 |
| 2.2.3 DNA pooling | 第31页 |
| 2.3 Primer development | 第31-32页 |
| 2.4 PCR amplification | 第32页 |
| 2.5 Polymorphism screening | 第32-33页 |
| 2.5.1 Gel Loading and image analyzing | 第32-33页 |
| 2.6 Sanger sequencing | 第33页 |
| 2.7 Marker development | 第33页 |
| 2.8 Association analysis | 第33页 |
| 2.9 RNA extraction protocol | 第33-34页 |
| 2.10 cDNA synthesis | 第34页 |
| 2.11 Quantitative real time PCR protocol | 第34-35页 |
| Chapter-3 Results and analysis | 第35-46页 |
| 3.1 Specific primers for Ta SSIV-A | 第35-36页 |
| 3.2 SNPs of Ta SSIV | 第36-37页 |
| 3.3 Natural variations in Ta SSIV | 第37-39页 |
| 3.4 SNPs frequency in Ta SSIV-A,B and D | 第39页 |
| 3.5 Nucleotide variations of Ta SSIV-A,B and D in natural population | 第39-40页 |
| 3.6 Sequence polymorphism assays and marker development | 第40-41页 |
| 3.7 Association between haplotypes and yield related traits | 第41-43页 |
| 3.8 Geographic distribution of Ta SSIV-A haplotype | 第43-44页 |
| 3.9 Positive selection of Hap-2-1A in China wheat breeding process | 第44页 |
| 3.10 Expression analysis of Ta SSIV-A,B and D genes at the seedling stage | 第44-46页 |
| Chapter-4 Discussion | 第46-50页 |
| 4.1 Use of EcoTILLING approach to discover SNPs for specific genes | 第46页 |
| 4.2 Marker assisted evaluation of germplasm resources for crop breeding | 第46-47页 |
| 4.3 Functional marker development and genotyping in wheat | 第47-48页 |
| 4.4 Importance and association of TGW with Ta SSIV-A haplotype | 第48页 |
| 4.5 Geographical distribution of haplotypes in China and Pakistan | 第48-49页 |
| 4.6 Expression analysis | 第49-50页 |
| Conclusion | 第50-51页 |
| Reference | 第51-62页 |
| 附表 | 第62-73页 |
| Acknowledgement | 第73-74页 |
| CURRICULUM VITAE | 第74页 |
