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三型分泌系统开关蛋白SepD调控效应蛋白输出的分子机制

中文摘要第4-6页
英文摘要第6-16页
缩略词表第16-17页
第一章 前言第17-31页
    1.1 细菌分泌系统第17-19页
    1.2 肠出血性大肠杆菌O157的流行现状和致病机制第19-20页
        1.2.1 肠出血性大肠杆菌O157的流行现状第19-20页
        1.2.2 肠出血性大肠杆菌O157的致病机制第20页
    1.3 细菌T3SS研究进展第20-22页
        1.3.1 EHEC作为T3SS模式微生物的优势第20页
        1.3.2 EHEC T3SS结构和LEE毒力岛第20-22页
        1.3.3 效应蛋白的作用第22页
    1.4 效应蛋白转运的研究进展第22-28页
        1.4.1 效应蛋白转运和分泌的关系第23-24页
        1.4.2 效应蛋白转运的研究方法第24页
        1.4.3 效应蛋白氨基端分泌信号第24-25页
        1.4.4 效应蛋白的伴侣蛋白结合区第25-27页
        1.4.5 效应蛋白在T3SS跨膜通道上的定位第27页
        1.4.6 开关蛋白SepD/SepL第27-28页
    1.5 研究内容第28-29页
        1.5.1 SepD相互作用蛋白的筛选第28-29页
        1.5.2 SepD调控效应蛋白转运的机制研究第29页
    1.6 研究目的和意义第29-31页
第二章 SepD相互作用蛋白的筛选第31-50页
    2.1 引言第31-32页
    2.2 实验材料第32-37页
        2.2.1 菌株与质粒第32页
        2.2.2 引物第32-33页
        2.2.3 仪器第33-34页
        2.2.4 主要试剂第34-35页
        2.2.5 溶液配制第35-37页
    2.3 实验方法第37-46页
        2.3.0 菌株的培养及保存第37页
        2.3.1 琼脂糖胶制备及跑胶第37-38页
        2.3.2 SDS-PAGE胶配制及跑胶第38-39页
        2.3.3 细菌基因组DNA提取第39页
        2.3.4 DNA扩增及PCR体系第39-40页
        2.3.5 DNA片段纯化或胶回收第40页
        2.3.6 限制性内切酶酶切及T4 DNA连接酶酶连体系第40-41页
        2.3.7 大肠杆菌感受态制备第41-42页
        2.3.8 质粒提取第42-43页
        2.3.9 质粒转化第43-44页
        2.3.10 菌落PCR第44页
        2.3.11 重组蛋白的表达第44-45页
        2.3.12 western-blot实验第45页
        2.3.13 GST-pull down实验第45-46页
    2.4 实验结果与分析第46-49页
        2.4.1 重组质粒的构建第46-47页
        2.4.2 诱导重组质粒表达蛋白条件的探索第47-48页
        2.4.3 GST pull down检测蛋白相互作用第48-49页
    2.5 小结第49-50页
第三章 SepD调控效应蛋白转运的机制研究第50-77页
    3.1 引言第50页
    3.2 实验材料第50-57页
        3.2.1 菌株与质粒第50-52页
        3.2.2 引物第52-56页
        3.2.3 仪器第56页
        3.2.4 主要试剂第56-57页
        3.2.5 溶液配制第57页
    3.3 实验方法第57-63页
        3.3.1 无缝克隆第57页
        3.3.2 His标签蛋白纯化、透析、浓缩及浓度测定第57-58页
        3.3.3 酶联免疫吸附实验第58-59页
        3.3.4 多克隆抗体的制备第59-60页
        3.3.6 基因敲除第60-61页
        3.3.7 质谱分析第61页
        3.3.8 细菌质膜分离实验第61-62页
        3.3.9 绿色荧光蛋白测定实验第62-63页
        3.3.10 密度分析实验第63页
    3.4 实验结果与分析第63-75页
        3.4.1 GST pull down反向检测CesT与SepD的相互作用第63页
        3.4.2 CesT与SepD各自结合功能域的筛选第63-68页
        3.4.3 分泌表型的研究第68-74页
        3.4.4 SepL的表达调控第74-75页
        3.4.5 OmpA-C多克隆抗体的制备第75页
    3.5 小结第75-77页
第四章 总结、讨论与展望第77-82页
    4.1 总结第77-78页
    4.2 讨论第78-80页
        4.2.1 SepD不同区域调控效应蛋白和转运蛋白分泌的影响第78-79页
        4.2.2 SepD和CesT的相互作用对效应蛋白分泌的影响第79页
        4.2.3 SepD和CesT的相互作用对SepL调控效应蛋白分泌的影响第79-80页
    4.3 展望第80-82页
参考文献第82-96页
附录第96-98页
致谢第98-99页
攻读硕士期间发表论文第99页

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