| 摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-11页 |
| 缩略词表 | 第12-17页 |
| 第一章 引言 | 第17-38页 |
| 1 铁皮石斛概述 | 第17-20页 |
| 1.1 铁皮石斛资源现状 | 第17-18页 |
| 1.2 铁皮石斛病害概况 | 第18-20页 |
| 2 黑斑病研究进展 | 第20-24页 |
| 2.1 黑斑病概况 | 第20-22页 |
| 2.2 铁皮石斛黑斑病研究 | 第22-24页 |
| 3 黑斑病的防治 | 第24-31页 |
| 3.1 物理防治 | 第24-25页 |
| 3.2 化学防治 | 第25-27页 |
| 3.2.1 化学农药应用 | 第25-26页 |
| 3.2.2 铁皮石斛化学防治 | 第26页 |
| 3.2.3 化学防治存在的问题 | 第26-27页 |
| 3.3 生物防治 | 第27-31页 |
| 3.3.1 内生菌增强植物抗性 | 第28-29页 |
| 3.3.2 拮抗菌及其次生代谢产物抑制病原菌 | 第29-30页 |
| 3.3.3 微生态平衡防治植物病害 | 第30-31页 |
| 4 微生物研究方法 | 第31-36页 |
| 4.1 应用宏基因组学挖掘新的微生物资源 | 第33-34页 |
| 4.2 应用宏基因组学系统诊断病害和病原微生物 | 第34-36页 |
| 5 本研究的目的及意义 | 第36-38页 |
| 第二章 基于宏基因组测序分析铁皮石斛黑斑病病原菌多样性 | 第38-56页 |
| 1 实验材料 | 第38-40页 |
| 2 实验方法 | 第40-44页 |
| 2.1 样品采集和处理 | 第40-41页 |
| 2.2 基因组DNA提取 | 第41页 |
| 2.3 ITS序列PCR扩增与测序 | 第41页 |
| 2.4 数据分析 | 第41-44页 |
| 3 结果与分析 | 第44-54页 |
| 3.1 Illumina测序分析 | 第44-45页 |
| 3.2 多样性指数及主成分分析 | 第45-48页 |
| 3.3 真菌种群结构分析 | 第48-54页 |
| 3.3.1 健康与病样真菌种群结构比较 | 第49-50页 |
| 3.3.2 不同地区真菌种群结构比较 | 第50-54页 |
| 4 小结与讨论 | 第54-56页 |
| 第三章 铁皮石斛黑斑病病原菌的分离鉴定及致病性研究 | 第56-68页 |
| 1 实验材料 | 第56-57页 |
| 2 实验方法 | 第57-59页 |
| 2.1 真菌分离 | 第57页 |
| 2.2 真菌鉴定 | 第57-59页 |
| 2.2.1 形态鉴定 | 第57页 |
| 2.2.2 分子鉴定 | 第57-59页 |
| 2.3 致病性试验 | 第59页 |
| 3 结果与分析 | 第59-67页 |
| 3.1 潜在病原菌分离 | 第59-60页 |
| 3.2 潜在病原菌鉴定 | 第60-63页 |
| 3.3 致病性试验 | 第63-67页 |
| 3.3.1 离体叶片致病性试验 | 第63-66页 |
| 3.3.2 组培苗致病性试验 | 第66-67页 |
| 4 小结与讨论 | 第67-68页 |
| 第四章 铁皮石斛内生细菌多样性分析及拮抗菌筛选 | 第68-82页 |
| 1 实验材料 | 第68页 |
| 2 实验方法 | 第68-71页 |
| 2.1 内生细菌多样性分析 | 第68-70页 |
| 2.1.1 样品采集与处理 | 第68-69页 |
| 2.1.2 基因组DNA提取 | 第69页 |
| 2.1.3 16SrDNAPCR扩增及测序 | 第69页 |
| 2.1.4 数据分析 | 第69-70页 |
| 2.2 拮抗菌筛选 | 第70-71页 |
| 2.2.1 内生菌分离 | 第70页 |
| 2.2.2 拮抗菌筛选 | 第70页 |
| 2.2.3 拮抗菌鉴定 | 第70-71页 |
| 3 结果与分析 | 第71-79页 |
| 3.1 内生细菌多样性分析 | 第71-78页 |
| 3.1.1 Illumina测序结果分析 | 第71-72页 |
| 3.1.2 多样性指数及主成分分析 | 第72-74页 |
| 3.1.3 细菌群落结构分析 | 第74-78页 |
| 3.2 拮抗菌筛选及鉴定 | 第78-79页 |
| 3.3 拮抗菌的鉴定 | 第79页 |
| 4 小结与讨论 | 第79-82页 |
| 第五章 总结与展望 | 第82-84页 |
| 参考文献 | 第84-93页 |
| 附录一 培养基配方 | 第93-94页 |
| 附录二 重要溶液配制 | 第94-96页 |
| 攻读硕士学位期间的研究成果 | 第96-97页 |
| 致谢 | 第97页 |