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基于糖组、代谢组和转录组的黄精种质资源研究

摘要第3-6页
Abstract第6-10页
第1章 研究综述第15-29页
    1.1 黄精概况第15-22页
        1.1.1 黄精生物学特征与生长发育特性第15-16页
        1.1.2 黄精本草考证第16-17页
        1.1.3 黄精资源分布及蕴藏量第17页
        1.1.4 黄精中主要化学成分第17-18页
        1.1.5 黄精的药用价值与药理活性第18-21页
        1.1.6 黄精种质资源研究第21-22页
    1.2 研究方法概况第22-25页
        1.2.1 糖组学研究第22-23页
        1.2.2 代谢组学研究第23-24页
        1.2.3 转录组研究第24页
        1.2.4 多糖代谢通路研究第24-25页
    1.3 立题背景、研究内容及意义第25-29页
        1.3.1 立题背景第25-26页
        1.3.2 研究意义第26页
        1.3.3 研究内容和技术路线第26-29页
第2章 黄精种质表型多样性分析第29-51页
    2.1 实验材料第29-31页
        2.1.1 采样第29-30页
        2.1.2 采样地气象信息第30-31页
    2.2 研究方法第31-35页
        2.2.1 表型指标统计第31-34页
        2.2.2 种质资源规范化描述第34页
        2.2.3 统计分析第34-35页
    2.3 结果与分析第35-48页
        2.3.1 黄精表型性状差异显著性分析第35-44页
        2.3.2 黄精表型性状变异分析第44页
        2.3.3 黄精表型性状相关分析第44-45页
        2.3.4 黄精种质聚类分析第45-47页
        2.3.5 黄精表型与生态因子关联分析第47-48页
    2.4 小结和讨论第48-51页
第3章 不同种质黄精多糖结构分析第51-81页
    3.1 实验材料和试剂第51-53页
        3.1.1 实验材料第51-52页
        3.1.2 实验试剂第52页
        3.1.3 实验仪器第52-53页
    3.2 实验方法第53-56页
        3.2.1 不同种质多糖提取第53页
        3.2.2 不同种质多糖的单糖组成分析第53-54页
        3.2.3 多糖纯化第54页
        3.2.4 多糖表观性状鉴定第54-55页
        3.2.5 黄精纯多糖结构分析第55-56页
    3.3 实验结果第56-78页
        3.3.1 不同黄精种质粗多糖含量分析第56-57页
        3.3.2 不同种质黄精多糖的单糖组成分析第57-62页
        3.3.3 多糖纯化结果第62-64页
        3.3.4 多糖表观性状分析第64-65页
        3.3.5 黄精纯化多糖结构分析第65-78页
    3.4 小结和讨论第78-81页
第4章 不同种质黄精代谢组分析第81-99页
    4.1 实验材料与试剂第81-82页
        4.1.1 实验材料第81-82页
        4.1.2 实验试剂第82页
        4.1.3 实验仪器第82页
    4.2 实验方法第82-84页
        4.2.1 样品处理第82页
        4.2.2 样品检测第82-83页
        4.2.3 数据统计分析第83-84页
    4.3 实验结果第84-96页
        4.3.1 不同种质LC-MS轮廓分析第84-85页
        4.3.2 总体样本的偏最小二乘方-判别分析(PLS-DA)第85-87页
        4.3.3 可能生物标记物的筛选结果第87-92页
        4.3.4 二级质谱鉴定结果第92页
        4.3.5 热图分析第92页
        4.3.6 相关性分析结果第92-93页
        4.3.7 代谢物箱式图与Z-score分析结果第93-95页
        4.3.8 化合物KEGG注释第95-96页
    4.4 小结和讨论第96-99页
第5章 黄精转录组研究及多糖合成通路分析第99-131页
    5.1 试剂与材料第99页
        5.1.1 试剂第99页
        5.1.2 材料第99页
    5.2 方法第99-105页
        5.2.1 提取总RNA第99-100页
        5.2.2 RNA文库的构建、质控及测序第100页
        5.2.3 生物信息学分析第100-102页
        5.2.4 内参基因的筛选第102-104页
        5.2.5 多糖合成通路基因qRT-PCR检测第104-105页
        5.2.6 多糖合成基因的组织部位表达分析第105页
    5.3 结果和讨论第105-129页
        5.3.1 测序统计结果第105-106页
        5.3.2 序列拼接第106-107页
        5.3.3 Unigene的功能注释分析第107-110页
        5.3.4 基因结构分析第110-113页
        5.3.5 黄精Unigene pathway分析第113-115页
        5.3.6 黄精多糖代谢通路分析第115-118页
        5.3.7 差异基因表达分析第118-121页
        5.3.8 黄精内参基因筛选结果第121-126页
        5.3.9 多糖合成通路基因表达水平检测第126-128页
        5.3.10 多糖合成基因的组织部位表达分析第128-129页
    5.4 小结和讨论第129-131页
第6章 黄精种质的SSR分子标记开发及DNA指纹图谱构建第131-143页
    6.1 实验试剂与材料第131-132页
        6.1.1 实验试剂第131页
        6.1.2 实验材料第131-132页
    6.2 实验方法第132-134页
        6.2.1 总DNA提取第132页
        6.2.2 PCR扩增第132-134页
        6.2.3 PCR产物的变性第134页
        6.2.4 PCR产物的检测第134页
        6.2.5 数据处理第134页
        6.2.6 指纹图谱构建第134页
    6.3 实验结果第134-141页
        6.3.1 DNA提取结果第134-135页
        6.3.2 SSR扩增多态性分析结果第135-137页
        6.3.3 指纹图谱构建第137-139页
        6.3.4 聚类和主成分分析第139-140页
        6.3.5 DNA指纹图谱QR编码第140-141页
    6.4 小结和讨论第141-143页
第7章 结论第143-145页
参考文献第145-161页
附录第161-197页
致谢第197-199页
攻读博士学位期间的研究成果第199-200页

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