| 致谢 | 第4-6页 |
| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 第一章 引言 | 第12-44页 |
| 1.1 寨卡病毒的研究现状 | 第12-22页 |
| 1.1.1 寨卡病毒的研究历史 | 第12-14页 |
| 1.1.2 寨卡病毒基因组结构 | 第14页 |
| 1.1.3 寨卡病毒的分类 | 第14-16页 |
| 1.1.4 寨卡病毒的生命周期 | 第16-17页 |
| 1.1.5 寨卡病毒大规模流行原因分析 | 第17-22页 |
| 1.2 病毒-宿主相互作用介绍 | 第22-44页 |
| 1.2.1 基于全基因组筛选病毒与宿主间相互作用的研究现状 | 第22-34页 |
| 1.2.2 基于iTRAQ定量蛋白质组学技术在病毒与宿主间相互作用的研究现状 | 第34-44页 |
| 第二章 寨卡病毒感染伊蚊细胞C6/36的定量蛋白质组学分析 | 第44-76页 |
| 2.1 引言 | 第44页 |
| 2.2 实验材料及方法 | 第44-56页 |
| 2.2.0 细胞系及病毒株 | 第44-45页 |
| 2.2.1 试剂及抗体 | 第45页 |
| 2.2.2 细胞传代培养 | 第45页 |
| 2.2.3 ZIKV扩增 | 第45-46页 |
| 2.2.4 寨卡病毒生长曲线检测 | 第46页 |
| 2.2.5 寨卡病毒噬斑定量实验 | 第46-47页 |
| 2.2.6 iTRAQ~(TM)定量蛋白质组学样品制备 | 第47-48页 |
| 2.2.7 SCX(强阳离子交换层析)分离肽段 | 第48-49页 |
| 2.2.8 LC-MS/MS分析肽段 | 第49页 |
| 2.2.9 质谱数据分析 | 第49-50页 |
| 2.2.10 基因聚类(GeneOntology)分析 | 第50页 |
| 2.2.11 细胞转染 | 第50-51页 |
| 2.2.12 蛋白质免疫印迹实验(Westernblot) | 第51-52页 |
| 2.2.13 报告基因分析 | 第52页 |
| 2.2.14 MTT实验 | 第52-53页 |
| 2.2.15 荧光定量PCR实验 | 第53-54页 |
| 2.2.16 免疫荧光及激光共聚焦实验 | 第54-55页 |
| 2.2.17 小鼠实验 | 第55-56页 |
| 2.3 实验结果 | 第56-71页 |
| 2.3.1 伊蚊细胞C6/36对ZIKV高度易染 | 第56-57页 |
| 2.3.2 ZIKV感染C6/36细胞的定量蛋白质组学分析 | 第57-59页 |
| 2.3.3 实时荧光定量PCR验证质谱结果 | 第59-60页 |
| 2.3.4 定量蛋白质组学结果聚类(GO)分析 | 第60-62页 |
| 2.3.5 CHCHD2蛋白通过抑制I型干扰素促进ZIKV复制 | 第62-65页 |
| 2.3.6 蛋白酶体抑制剂在细胞水平抑制ZIKV感染 | 第65-70页 |
| 2.3.7 Bortezomib缓解ZIKV引起的小鼠病理症状 | 第70-71页 |
| 2.4 讨论与小结 | 第71-75页 |
| 2.4.1 天然免疫应答 | 第72-73页 |
| 2.4.2 非折叠蛋白应激反应(UPR) | 第73-74页 |
| 2.4.3 泛素蛋白酶体 | 第74页 |
| 2.4.4 其他生物学进程 | 第74-75页 |
| 2.5 本章小结 | 第75-76页 |
| 第三章 寨卡病毒感染人神经细胞U251的定量蛋白质组学分析 | 第76-106页 |
| 3.1 引言 | 第76-77页 |
| 3.2 实验材料及方法 | 第77-79页 |
| 3.2.1 细胞系及病毒株 | 第77页 |
| 3.2.2 抗体及试剂 | 第77页 |
| 3.2.3 活细胞内质网及溶酶体成像实验 | 第77-78页 |
| 3.2.4 U251细胞的转染实验 | 第78页 |
| 3.2.5 溶酶体抑制剂BFA及CQ抑制ZIKV感染实验 | 第78页 |
| 3.2.6 蛋白相互作用网络(STRING)分析和作图 | 第78页 |
| 3.2.7 其他实验方法 | 第78-79页 |
| 3.3 实验结果 | 第79-101页 |
| 3.3.1 筛选ZIKV易感细胞系 | 第79页 |
| 3.3.2 ZIKV感染人神经细胞U251定量蛋白质组学实验 | 第79-82页 |
| 3.3.3 质谱结果重复性分析及验证与差异表达蛋白筛选 | 第82-84页 |
| 3.3.4 质谱结果生物信息学分析 | 第84-89页 |
| 3.3.5 质谱数据结果验证 | 第89-90页 |
| 3.3.6 ZIKV感染U25118h引起内质网结构重排 | 第90-93页 |
| 3.3.7 ZIKV感染U25136h引发内质网蛋白降解 | 第93-97页 |
| 3.3.8 溶酶体抑制剂抑制ZIKV进入过程及中期释放过程 | 第97-99页 |
| 3.3.9 ZIKV感染U251激活非折叠蛋白反应及凋亡通路 | 第99-101页 |
| 3.4 讨论及小结 | 第101-106页 |
| 3.4.1 天然免疫系统 | 第102页 |
| 3.4.2 内质网 | 第102-103页 |
| 3.4.3 线粒体 | 第103-104页 |
| 3.4.4 细胞凋亡 | 第104页 |
| 3.4.5 其他蛋白 | 第104-105页 |
| 3.4.6 小结 | 第105-106页 |
| 第四章 结论与讨论 | 第106-108页 |
| 参考文献 | 第108-124页 |
| 附录 | 第124-170页 |
| 作者简历 | 第170-171页 |
