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利用组学技术探究湖羊和新西兰兔甲烷排放差异的微生物机制

中文摘要第5-8页
Abstract第8-11页
缩略词清单第20-22页
第一部分 文献综述第22-41页
    第一节 瘤胃的功能第22-29页
        1 瘤胃发酵和“种间氢转移”第22-23页
        2 瘤胃微生物第23-24页
        3 瘤胃甲烷生成第24页
        4 瘤胃甲烷生成的调控和抑制瘤胃甲烷生成的后果第24-29页
    第二节 反刍动物和单胃草食动物甲烷排放量的差异及可能原因第29-33页
        1 反刍动物和单胃草食动物甲烷排放量的差异第29-31页
        2 反刍动物和单胃草食动物甲烷排放量差异的可能原因第31-33页
    第三节 动物消化道氢代谢微生物的研究手段第33-37页
        1 实时荧光定量PCR第33-34页
        2 微生物多样性分析(扩增子测序)第34-35页
        3 宏基因组学第35-37页
    第四节 宏转录组学揭示氢代谢差异的优势第37-39页
    第五节 本研究的目的、意义和内容第39-41页
        1 本研究的目的和意义第39页
        2 研究内容第39-41页
第二部分 试验研究第41-131页
    1 试验动物和试验设计第41页
    2 样品采集第41-43页
    第一章 湖羊和新西兰兔甲烷、二氧化碳排放量的比较第43-48页
        1 材料与方法第43-44页
        2 结果第44-46页
        3 讨论第46-47页
        4 小结第47-48页
    第二章 湖羊瘤胃内容物和新西兰兔盲肠内容物发酵参数和微生物酶活性的比较第48-58页
        第一节 湖羊瘤胃内容物和新西兰兔盲肠内容物发酵参数的比较第48-52页
            1 材料与方法第48-49页
            2 结果第49-50页
            3 讨论第50-51页
            4 小结第51-52页
        第二节 湖羊瘤胃内容物和新西兰兔盲肠内容物微生物酶活性的比较第52-58页
            1 材料与方法第52-55页
            2 结果第55-56页
            3 讨论第56-57页
            4 小结第57-58页
    第三章 湖羊瘤胃内容物和新西兰兔盲肠内容物古菌数量、多样性、基因表达量以及甲烷生成途径差异基因数量的比较第58-90页
        第一节 湖羊瘤胃内容物和新西兰兔盲肠内容物古菌数量的比较第58-65页
            1 材料与方法第58-62页
            2 结果第62-63页
            3 讨论第63-64页
            4 小结第64-65页
        第二节 湖羊瘤胃内容物和新西兰兔盲肠内容物古菌多样性的比较第65-72页
            1 材料与方法第65-66页
            2 结果第66-70页
            3 讨论第70-71页
            4 小结第71-72页
        第三节 湖羊瘤胃内容物和新西兰兔盲肠内容物古菌基因表达量和物种注释的比较第72-81页
            1 材料与方法第72-74页
            2 结果第74-79页
            3 讨论第79-80页
            4 小结第80-81页
        第四节 湖羊瘤胃内容物和新西兰兔盲肠内容物转录组KEGG功能注释和甲烷生成途径差异基因数量的比较第81-90页
            1 材料与方法第81-82页
            2 结果第82-88页
            3 讨论第88-89页
            4 小结第89-90页
    第四章 湖羊瘤胃内容物和新西兰兔盲肠内容物氢代谢微生物数量、多样性、基因表达量的比较以及与甲烷排放量的关联分析第90-115页
        第一节 湖羊瘤胃内容物和新西兰兔盲肠内容物氢代谢微生物数量的比较第90-95页
            1 材料与方法第90-91页
            2 结果第91-93页
            3 讨论第93-94页
            4 小结第94-95页
        第二节 湖羊瘤胃内容物和新西兰兔盲肠内容物细菌多样性的比较第95-104页
            1 材料与方法第95页
            2 结果第95-102页
            3 讨论第102-103页
            4 小结第103-104页
        第三节 湖羊瘤胃内容物和新西兰兔盲肠内容物细菌基因表达量和物种注释的比较第104-109页
            1 材料与方法第104页
            2 结果第104-107页
            3 讨论第107-108页
            4 小结第108-109页
        第四节 甲烷排放量、消化道发酵参数、消化道主要微生物的关联分析第109-115页
            1 材料与方法第109页
            2 结果第109-112页
            3 讨论第112-114页
            4 小结第114-115页
    第五章 湖羊瘤胃内容物和新西兰兔盲肠内容物CAZy注释的比较和具有碳水化合物代谢功能微生物的挖掘第115-131页
        第一节 湖羊瘤胃内容物和新西兰兔盲肠内容物CAZy注释的比较第115-124页
            1 材料与方法第115-116页
            2 结果第116-122页
            3 讨论第122-123页
            4 小结第123-124页
        第二节 湖羊瘤胃内容物和新西兰兔盲肠内容物具有有碳水化合物代谢功能微生物的挖掘第124-131页
            1 材料与方法第124页
            2 结果第124-129页
            3 讨论第129-130页
            4 小结第130-131页
第三部分 综合讨论第131-134页
第四部分 提示、创新点及研究展望第134-135页
    1 提示第134页
    2 创新点第134页
    3 研究展望第134-135页
参考文献第135-152页
致谢第152-154页
个人简历第154-155页

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