Chinese Abstract | 第11-13页 |
Abstract | 第13-15页 |
1. Introduction | 第16-33页 |
1.1. Whitefly | 第16-21页 |
1.1.1. Morphological description and taxonomy | 第16-17页 |
1.1.2. Scientific classification | 第17-18页 |
1.1.3. Reproduction and metamorphosis | 第18页 |
1.1.4. Agricultural threats and important species | 第18-19页 |
1.1.5. Bemisia tabaci: A cryptic species complex | 第19页 |
1.1.6. Distribution of whitefly and domination | 第19页 |
1.1.7. Molecular identification of B. tabaci | 第19页 |
1.1.8. Identification of B. tabaci in Pakistan | 第19-20页 |
1.1.9. Why identification of B. tabaci cryptic species in Pakistan is important | 第20-21页 |
1.2. Begomoviruses | 第21-29页 |
1.2.1. Family Geminiviridae | 第21-22页 |
1.2.2. Geminivirus taxonomy and nomenclature | 第22页 |
1.2.3. Genus Begomovirus | 第22页 |
1.2.4. Morphology and genome organization | 第22-24页 |
1.2.5. Alphasatellites | 第24-25页 |
1.2.6. Betasatellites | 第25页 |
1.2.7. Damages caused by begomoviruses | 第25-26页 |
1.2.8. Economic importance of begomoviruses in Pakistan | 第26-27页 |
1.2.9. Molecular identification of begomoviruses in Pakistan | 第27-28页 |
1.2.10. Why identification of begomoviruses is important in Pakistan? | 第28-29页 |
1.3. Association between begomoviruses and whitefly | 第29-33页 |
1.3.1. What characters make whitefly an important begomovirus vector? | 第29-30页 |
1.3.2. How whitefly spreads begomoviruses worldwide? | 第30页 |
1.3.3. Whitefly facilitates in emergence of begomoviruses | 第30-31页 |
1.3.4. Biodiversity and evolution in whitefly ensures biodiversity and evolution inbegomoviruses | 第31页 |
1.3.5. Whitefly helps in epidemics of begomovirus disease complexes | 第31-33页 |
2. Aims of the Study | 第33-34页 |
3. Material and Methods | 第34-42页 |
3.1. Identification of whiteflies from Pakistan | 第34-38页 |
3.1.1. Whitefly collection | 第34页 |
3.1.2. Preparation of lysis buffer | 第34页 |
3.1.3. Homogenization of whitefly | 第34页 |
3.1.4. mtCOI PCR amplification | 第34-35页 |
3.1.5. Preparation of agrose gel | 第35页 |
3.1.6. Gel electrophoresis and photographing | 第35页 |
3.1.7. Gel extraction and purification | 第35-36页 |
3.1.8. Preparation of Lysogeny broth (LB) culture | 第36页 |
3.1.9. Cloning (Ligation and Transformation) | 第36-37页 |
3.1.10. Check PCR analysis | 第37页 |
3.1.11. Sequencing and sequence analysis | 第37-38页 |
3.1.12. Genetic distance and phylogenetic analysis of mtCOI sequences | 第38页 |
3.1.13. Genetic diversity and distribution analysis | 第38页 |
3.2. Identification of begomoviruses | 第38-42页 |
3.2.1. Collection of whitefly and processing | 第38页 |
3.2.2. Homogenization of whitefly | 第38-39页 |
3.2.3. PCR amplification and sequence analysis for identification of begomoviruses | 第39页 |
3.2.4. Gel extraction and purification | 第39-40页 |
3.2.5. Cloning (Ligation and Transformation) | 第40页 |
3.2.6. Check PCR analysis | 第40页 |
3.2.7. Sequencing and sequence analysis | 第40-41页 |
3.2.8. Phylogenetic analysis, Pairwise distance analysis and geographical distribution | 第41-42页 |
4. Results | 第42-59页 |
4.1. Identification of whiteflies from Pakistan | 第42-50页 |
4.1.1. Phylogenetic and distance analysis of mtCOI sequences | 第42-47页 |
4.1.2. Genetic diversity and species distribution | 第47-50页 |
4.2. Identification of begomoviruses in Pakistan | 第50-59页 |
5. Discussions | 第59-64页 |
5.1. Diversity of whiteflies | 第59-61页 |
5.2. Diversity of begomoviruses | 第61-64页 |
Conclusion | 第64-65页 |
References | 第65-86页 |
Equipment's used during research | 第86-87页 |
List of published articles during this academic program | 第87-91页 |
Acknowledgement | 第91-92页 |
Appendix table. BLAST (n) results for 177 sequences revealed in present study | 第92-96页 |