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福建地区草莓病毒的分子检测和SPaV全基因组序列的获得

摘要第8-10页
ABSTRACT第10-11页
第一章 前言第13-28页
    1 草莓病毒病第13-19页
        1.1 草莓病毒病的地理分布第13-14页
        1.2 草莓病毒病的危害和症状第14页
        1.3 主要的草莓病毒第14-16页
        1.4 国内草莓病毒主要种类特性的研究现状第16-18页
            1.4.1 草莓轻型黄边病毒(SMYEV)第16页
            1.4.2 草莓皱缩病毒(SCV)第16-17页
            1.4.3 草莓镶脉病毒(SVBV)第17页
            1.4.4 草莓斑驳病毒(SMoV)第17-18页
        1.5 非国内草莓病毒主要种类特性的研究现状第18-19页
            1.5.1 草莓轻型黄边伴随病毒(SMYEaV)第18页
            1.5.2 草莓潜隐环斑病毒(SLRSV)第18-19页
        1.6 五种国内尚未报道的草莓病毒第19页
    2 草莓病毒病的检测方法第19-21页
        2.1 指示植物检测第19页
        2.2 血清学检测法第19-20页
        2.3 分子生物学检测法第20-21页
    3 高通量测序技术第21-26页
        3.1 高通量测序技术原理第22-23页
            3.1.1 Solexa测序技术第22页
            3.1.2 SOLiD测序技术第22-23页
            3.1.3 454测序技术第23页
        3.2 高通量技术的应用第23-26页
            3.2.1 高通量技术在DNA甲基化分析的应用第23-24页
            3.2.2 高通量技术在DNA水平上的应用第24页
            3.2.3 高通量技术在基因和转录组表达调控的应用第24页
            3.2.4 高通量技术在植物病毒检测上的应用第24-26页
    4 草莓病毒病的防控方法第26-27页
        4.1 选育抗性草莓品种第26页
        4.2 培育无病毒苗木第26页
        4.3 应用转基因技术获得抗病毒植株第26-27页
    5 本项目的目的和意义第27-28页
第二章 三种病毒(SCrV-3、SCrV-4和SPaV)在我国的首次报道和SPaV全基因组序列测定第28-47页
    1 材料和方法第29-40页
        1.1 材料第29-30页
            1.1.1 供试植物第29页
            1.1.2 供试菌株及载体第29-30页
            1.1.3 主要仪器和试剂第30页
        1.2 方法第30-40页
            1.2.1 草莓病叶样本总RNA的提取第30-31页
            1.2.2 反转录和各基因cDNA第一条链的合成第31-32页
            1.2.3 病毒基因片段的PCR扩增第32-34页
            1.2.4 PCR反应产物的电泳检测第34-35页
            1.2.5 PCR产物的回收第35页
            1.2.6 胶回收产物与克隆载体的连接第35-36页
            1.2.7 连接产物的转化第36页
            1.2.8 筛选阳性克隆第36-37页
            1.2.9 Small RNA提取第37页
            1.2.10 NGS数据分析第37-38页
            1.2.11 RT-PCR和RACE获取目的病毒基因组全序列第38-40页
            1.2.12 数据分析第40页
    2 结果与分析第40-46页
        2.1 SCrV-3和SCrV-4在我国的首次报道第40-42页
        2.2 SPaV在我国的首次报道第42-44页
        2.3 SPaV的全基因组序列第44-46页
    3 讨论第46-47页
第三章 草莓病毒病在福建省的发生和分布情况第47-56页
    1 材料和方法第48-51页
        1.1 材料第48页
        1.2 方法第48-51页
            1.2.1 总RNA提取第48-49页
            1.2.2 RT-PCR检测和各基因cDNA第一条链的合成第49-51页
            1.2.3 克隆及测序分析第51页
    2 结果与分析第51-55页
        2.1 福建地区九种草莓病毒的PCR检测第51-52页
        2.2 福建省九种草莓病毒的发生和地理分布第52-53页
        2.3 草莓病毒病的复合侵染和田间症状第53-55页
    3 讨论第55-56页
第四章 全文总结与展望第56-57页
参考文献第57-62页
附录:已发表或接受的文章第62-63页
致谢第63页

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