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霉菌蛋白酶基因的克隆、表达及水解特性的研究

摘要第5-8页
Abstract第8-10页
英文缩略语第11-18页
第一章 绪论第18-38页
    1.1 微生物源蛋白酶的分类与来源第18-21页
        1.1.1 天冬氨酸蛋白酶第19页
        1.1.2 半胱氨酸蛋白酶第19-20页
        1.1.3 丝氨酸蛋白酶第20页
        1.1.4 金属蛋白酶第20-21页
    1.2 微生物蛋白酶的生产第21-23页
        1.2.1 产蛋白酶菌株的分离第21页
        1.2.2 产蛋白酶菌株的培养第21-22页
        1.2.3 产蛋白酶菌株的发酵第22-23页
            1.2.3.1 液体发酵第22页
            1.2.3.2 固体发酵第22-23页
    1.3 微生物蛋白酶的分离纯化第23-24页
    1.4 提高蛋白酶产量的传统方法第24-26页
        1.4.1 自然选育第24-25页
        1.4.2 诱变育种第25页
        1.4.3 体内基因重组育种第25-26页
    1.5 微生物蛋白酶的基因工程第26-29页
    1.6 微生物蛋白酶的蛋白酶工程第29-33页
        1.6.1 微生物蛋白酶工程的理性设计第30-31页
        1.6.2 微生物蛋白酶工程的定向进化第31-32页
        1.6.3 高通量筛选的定向进化第32-33页
    1.7 蛋白酶对大豆蛋白水解的开发应用第33-35页
    1.8 本课题的研究意义和主要研究内容第35-38页
        1.8.1 本课题的研究意义第35-36页
        1.8.2 本课题的主要研究内容第36-38页
第二章 几种霉菌蛋白酶基因的克隆及序列分析第38-87页
    2.1 材料与方法第38-52页
        2.1.1 材料第38-43页
            2.1.1.1 试验菌株与载体第38-39页
            2.1.1.2 主要试剂第39页
            2.1.1.3 克隆霉菌蛋白酶基因的引物第39-42页
            2.1.1.4 培养基第42页
            2.1.1.5 主要仪器第42-43页
        2.1.2 方法第43-52页
            2.1.2.1 霉菌菌株的活化和培养第43页
            2.1.2.2 霉菌菌丝体 RNA 的提取和检测第43-44页
            2.1.2.3 反转录 cDNA 第一链的合成第44页
            2.1.2.4 未报道的丝氨酸蛋白酶基因的克隆第44-48页
            2.1.2.5 未报道的氨肽酶基因的克隆第48-50页
            2.1.2.6 已报道的蛋白酶基因的克隆第50页
            2.1.2.7 对蛋白酶基因的核苷酸序列的分析第50页
            2.1.2.8 密码子使用的偏好性第50页
            2.1.2.9 蛋白酶序列的基本性质分析第50-51页
            2.1.2.10 蛋白酶 Motif、功能位点和结构功能域的预测第51页
            2.1.2.11 蛋白酶氨基酸序列分子进化分析第51页
            2.1.2.12 蛋白酶的同源建模、二级结构和三级结构分析第51页
            2.1.2.13 氢键数和盐键数的预测第51-52页
            2.1.2.14 蛋白酶的溶剂可及表面积的预测第52页
    2.2 结果与分析第52-85页
        2.2.1 霉菌蛋白酶基因的克隆结果第52-57页
            2.2.1.1 霉菌菌丝体 RNA 的提取结果第52页
            2.2.1.2 未报道的丝氨酸蛋白酶基因和氨肽酶基因的克隆结果第52-56页
            2.2.1.3 已报道的蛋白酶基因的克隆结果第56-57页
        2.2.2 霉菌蛋白酶基因的序列分析第57-85页
            2.2.2.1 丝氨酸蛋白酶的生物信息学分析第57-68页
            2.2.2.2 酸性蛋白酶的生物信息学分析第68-78页
            2.2.2.3 中性蛋白酶的生物信息学分析第78-82页
            2.2.2.4 氨肽酶的生物信息学分析第82-85页
    2.3 小结第85-87页
        2.3.1 几种霉菌蛋白酶基因的克隆结果第85页
        2.3.2 对克隆获得的蛋白酶基因的序列分析结果第85-87页
第三章 蛋白酶基因的异源表达及酶学性质的研究第87-123页
    3.1 材料与方法第87-100页
        3.1.1 材料第87-91页
            3.1.1.1 菌株与质粒第87-88页
            3.1.1.2 酶与主要试剂第88页
            3.1.1.3 克隆霉菌蛋白酶基因的表达引物第88-90页
            3.1.1.4 主要仪器第90页
            3.1.1.5 培养基及储液第90-91页
        3.1.2 方法第91-100页
            3.1.2.1 蛋白酶基因在大肠杆菌中的表达第91-93页
            3.1.2.2 蛋白酶基因在毕赤酵母中的表达第93-96页
            3.1.2.3 重组蛋白酶的酶活测定第96-97页
            3.1.2.4 重组蛋白酶的 SDS-PAGE 电泳鉴定第97页
            3.1.2.5 重组蛋白酶的 InVision~(TM)His-tag In-gel Stain 染色鉴定第97页
            3.1.2.6 重组毕赤酵母工程菌的遗传稳定性分析第97页
            3.1.2.7 重组蛋白酶的纯化第97-98页
            3.1.2.8 重组蛋白酶的酶谱试验第98页
            3.1.2.9 重组蛋白酶的酶学性质研究第98-100页
    3.2 结果与分析第100-119页
        3.2.1 蛋白酶基因在大肠杆菌中的表达结果第100-101页
            3.2.1.1 蛋白酶基因在大肠杆菌中表达的表达载体构建结果第100页
            3.2.1.2 蛋白酶基因在大肠杆菌中诱导表达结果第100-101页
            3.2.1.3 从包涵体中纯化溶解重组蛋白酶的结果第101页
        3.2.2 蛋白酶基因在毕赤酵母的诱导表达结果第101-119页
            3.2.2.1 蛋白酶基因在毕赤酵母中表达的表达载体构建第101-102页
            3.2.2.2 重组毕赤酵母的筛选和鉴定第102-103页
            3.2.2.3 重组毕赤酵母菌株诱导表达重组蛋白酶的结果第103-106页
            3.2.2.4 重组毕赤酵母菌株诱导表达发酵液酶活的结果第106-107页
            3.2.2.5 重组毕赤酵母工程菌的遗传稳定性分析第107页
            3.2.2.6 重组米曲霉 AlpII 的纯化及酶学性质结果第107-112页
            3.2.2.7 重组黑曲霉 AlpI 的纯化及酶学性质结果第112-115页
            3.2.2.8 重组米曲霉 NpI 的纯化及酶学性质结果第115-119页
    3.3 讨论第119-120页
        3.3.1 表达系统的选择第119页
        3.3.2 重组蛋白酶的表达量第119-120页
        3.3.3 重组蛋白酶的纯化第120页
    3.4 本章小结第120-123页
第四章 重组蛋白酶分子的定点突变第123-140页
    4.1 材料与方法第123-128页
        4.1.1 材料第123-126页
            4.1.1.1 菌株与质粒第123页
            4.1.1.2 酶与主要试剂第123-124页
            4.1.1.3 定点突变引物第124-126页
            4.1.1.4 主要仪器第126页
            4.1.1.5 培养基及储液第126页
        4.1.2 方法第126-128页
            4.1.2.1 重组蛋白酶突变位点的确定第126-127页
            4.1.2.2 定点突变的方法第127-128页
            4.1.2.3 含突变位点的蛋白基因在毕赤酵母中的表达第128页
            4.1.2.4 含突变位点的重组蛋白酶的纯化和性质研究第128页
            4.1.2.5 突变后重组蛋白酶的结构预测分析第128页
    4.2 结果与分析第128-139页
        4.2.1 重组米曲霉 AlpII 的定点突变结果第128-134页
            4.2.1.1 米曲霉 AlpII 二硫键突变位点的确定第128-129页
            4.2.1.2 米曲霉 AlpII 二硫键突变位点的测序结果第129-130页
            4.2.1.3 突变的米曲霉 AlpII 在毕赤酵母中的表达及纯化结果第130-131页
            4.2.1.4 突变的重组米曲霉 AlpII 的酶学性质第131-132页
            4.2.1.5 突变重组米曲霉 AlpII 的结构分析结果第132-134页
        4.2.2 重组黑曲霉 AlpI 的定点突变结果第134-137页
            4.2.2.1 黑曲霉 AlpI 二硫键突变位点的确定第134-135页
            4.2.2.2 黑曲霉 AlpI 二硫键突变位点的测序鉴定结果第135页
            4.2.2.3 突变的黑曲霉 AlpI 在毕赤酵母中的表达结果第135-136页
            4.2.2.4 突变的重组黑曲霉 AlpI 的结构分析第136-137页
        4.2.3 重组米曲霉 NpI 的定点突变结果第137-139页
            4.2.3.1 米曲霉 NpI 基因的定点突变位点的确定第137页
            4.2.3.2 米曲霉 NpI 基因的定点突变的测序结果第137-138页
            4.2.3.3 突变的米曲霉 NpI 在毕赤酵母中的表达结果第138-139页
    4.3 小结第139-140页
第五章 3 种重组蛋白酶对大豆分离蛋白的水解作用第140-149页
    5.1 材料与方法第140-142页
        5.1.1 试验材料第140页
        5.1.2 大豆分离蛋白水解度的测定-甲醛滴定法第140-141页
        5.1.3 重组蛋白酶对大豆分离蛋白的水解第141-142页
            5.1.3.1 对大豆分离蛋白的水解试验过程第141页
            5.1.3.2 温度对大豆分离蛋白水解度的影响第141页
            5.1.3.3 pH 对大豆分离蛋白水解度的影响第141页
            5.1.3.4 水解时间对大豆分离蛋白水解度的影响第141页
            5.1.3.5 加酶量对大豆分离蛋白水解度的影响第141-142页
    5.3 结果与分析第142-148页
        5.3.1 重组米曲霉碱性蛋白酶对大豆分离蛋白的水解结果第142-144页
            5.3.1.1 温度对大豆分离蛋白水解效果的影响结果第142页
            5.3.1.2 pH 对大豆分离蛋白水解效果的影响结果第142-143页
            5.3.1.3 水解时间对大豆分离蛋白水解效果的影响结果第143页
            5.3.1.4 加酶量对大豆分离蛋白水解效果的影响结果第143-144页
        5.3.2 重组黑曲霉碱性蛋白酶对大豆分离蛋白的水解结果第144-146页
            5.3.2.1 温度对大豆分离蛋白水解效果的影响结果第144-145页
            5.3.2.2 pH 对大豆分离蛋白水解效果的影响结果第145页
            5.3.2.3 水解时间对大豆分离蛋白水解效果的影响结果第145页
            5.3.2.4 加酶量对大豆分离蛋白水解效果的影响结果第145-146页
        5.3.3 重组米曲霉中性蛋白酶对大豆分离蛋白的水解结果第146-148页
            5.3.3.1 温度对大豆分离蛋白水解效果的影响结果第146-147页
            5.3.3.2 pH 对大豆分离蛋白水解效果的影响结果第147页
            5.3.3.3 水解时间对大豆分离蛋白水解效果的影响结果第147页
            5.3.3.4 加酶量对大豆分离蛋白水解效果的影响结果第147-148页
    5.4 小结第148-149页
结论与展望第149-153页
参考文献第153-167页
攻读博士学位期间取得的研究成果第167-168页
致谢第168-169页
附件第169页

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