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srGAP2 F-BAR结构域的结构生物学研究

摘要第6-8页
ABSTRACT第8-9页
第一章 绪论第12-26页
    1.1 BAR 结构域超家族第12-13页
    1.2 BAR 结构域蛋白与细胞骨架第13-14页
    1.3 BAR 结构域蛋白与 GTPases第14页
    1.4 BAR 结构域蛋白与细胞结构第14-19页
    1.5 BAR 结构域蛋白参与的膜塑形过程的机制第19-23页
    1.6 BAR 结构域蛋白与 Rab 蛋白第23-25页
    1.7 本研究的目的与意义第25-26页
第二章 材料与方法第26-48页
    2.1 主要实验仪器第26-27页
    2.2 材料与试剂第27-29页
        2.2.1 主要试剂第27-28页
        2.2.2 菌株与细胞系第28页
        2.2.3 载体第28页
        2.2.4 基因第28-29页
        2.2.5 实验所用引物第29页
    2.3 试剂和溶液配制第29-32页
        2.3.1 培养基配制第29页
        2.3.2 常用溶液配制第29-32页
    2.4 实验方法及步骤第32-48页
        2.4.1 PCR 引物设计第32页
        2.4.2 PCR 反应第32-33页
        2.4.3 限制性内切酶对片段和载体进行酶切及 DNA 连接反应第33-35页
        2.4.4 DNA 凝胶电泳第35页
        2.4.5 DNA 回收第35-36页
        2.4.6 质粒抽提第36-37页
        2.4.7 大肠杆菌感受态细胞第37页
        2.4.8 原核表达检测第37-38页
        2.4.9 蛋白质大规模原核表达第38页
        2.4.10 蛋白质亲和层析纯化(重力柱)第38-39页
        2.4.11 蛋白质分子筛层析纯化第39-40页
        2.4.12 蛋白质浓度测定(Bradford 法)第40-41页
        2.4.13 蛋白质浓缩第41页
        2.4.14 测序第41页
        2.4.15 贴壁型哺乳动物细胞培养第41-42页
        2.4.16 外源基因导入真核细胞表达第42-43页
        2.4.17 细胞收集及破碎第43页
        2.4.18 His-pulldown第43-44页
        2.4.19 Western blot第44-45页
        2.4.20 蛋白质结晶及结构解析第45-46页
        2.4.21 蛋白质序列生物信息学分析第46-48页
第三章 实验结果第48-71页
    3.1 srGAP2 F-BAR domain 蛋白质序列的生物信息学分析第48-55页
        3.1.1 srGAP2 F-BAR domain 蛋白质序列比对分析第48-49页
        3.1.2 srGAP2 F-BAR domain 蛋白质序列的折叠倾向预测第49-51页
        3.1.3 使用 Psipred Prediction 软件对 srGAP2 F-BAR domain 蛋白质进行二级结构预测第51-55页
    3.2 srGAP2 F-BAR domain 蛋白质的原核表达、纯化第55-65页
        3.2.1 原核表达载体构建第55-56页
        3.2.2 srrGP2 F-BAR domain 蛋白的原核表达与纯化第56-65页
    3.3 真核蛋白 Rab4,5,7,8,11 的表达第65页
    3.4 Rab4,5,7,8,11; GFP-N1 与 F-BAR-1-357 及 F-BAR-1-480 pulldown第65-66页
    3.5 srGAP2 F-BAR domain 蛋白质的结晶与结构解析第66-71页
        3.5.1 srGAP2 F-BAR domain 蛋白质结晶条件的初筛第66-67页
        3.5.2 srGAP2 F-BAR-15-347 蛋白质晶体优化第67-69页
        3.5.3 srGAP2 F-BAR-15-347 蛋白质晶体 X 射线衍射和结构解析第69-71页
第四章 分析与讨论第71-73页
第五章 结论第73-74页
参考文献第74-78页
致谢第78-79页
攻读学位期间发表的学术论文目录第79页

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