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牛IVF、SCNT和孤雌胚胎附植前发育过程中DNA甲基化的研究

内容提要第5-6页
中文摘要第6-9页
Abstract第9-12页
英文缩写词表第18-19页
前言第19-21页
第一篇 文献综述第21-55页
    第1章 哺乳动物发育早期DNA甲基化第21-33页
        1.1 DNA甲基化简述第21-23页
        1.2 DNA甲基化与染色质结构的关系第23页
        1.3 哺乳动物早期胚胎发育过程中DNA甲基化的动态变化第23-26页
            1.3.1 受精时期DNA甲基化的动态变化第24-25页
            1.3.2 卵裂阶段DNA甲基化的动态变化第25-26页
        1.4 DNA甲基化与X染色体失活第26-28页
        1.5 印记基因逃离附植前胚胎发育的去甲基化过程第28-29页
        1.6 体细胞核移植胚胎基因组重编程第29-30页
        1.7 DNA主动去甲基化对胚胎发育的重要性第30-31页
        1.8 结语第31-33页
    第2章 TET蛋白及5羟甲基胞嘧啶与DNA主动去甲基化第33-43页
        2.1 DNA主动去甲基化第33-35页
        2.2 TET蛋白家族:5m C向 5hm C转变的调节者第35-36页
        2.3 BER糖基化酶家族:DNA修复的调节者第36-37页
        2.4 哺乳动物细胞内存在着 5hm C去甲基转移活性第37-39页
        2.5 TET蛋白和 5hm C在全基因组的分布第39-40页
        2.6 参与DNA去甲基化的其它相关蛋白和分子第40-41页
        2.7 结语第41-43页
    第3章 表观遗传调控之组蛋白赖氨酸甲基化第43-55页
        3.1 简介第43页
        3.2 组蛋白赖氨酸甲基化引起的基因活化或抑制第43-44页
        3.3 起转录激活作用的组蛋白赖氨酸甲基化标记第44-46页
            3.3.1 转录起始第44-45页
            3.3.2 转录延伸第45-46页
        3.4 基因印记第46-47页
        3.5 H3K9甲基化引起的基因沉默第47-48页
        3.6 H3K4me3的建立与维持第48-49页
        3.7 H3K27甲基化对发育调节因子的抑制作用第49-50页
        3.8 组蛋白共价修饰间的相互作用第50-52页
        3.9 组蛋白甲基化与DNA甲基化第52-53页
        3.10 结语第53-55页
第二篇 实验研究第55-101页
    第1章 牛体外受精附植前胚胎DNA甲基化及组蛋白H3K9me3动态变化的研究第55-75页
        1.1 材料试剂第56-58页
            1.1.1 材料第56页
            1.1.2 主要仪器第56-57页
            1.1.3 主要试剂及溶液配制第57-58页
        1.2 实验方法第58-61页
            1.2.1 卵巢的收集第58页
            1.2.2 卵母细胞的获取和体外成熟第58页
            1.2.3 体外受精第58-59页
            1.2.4 体外受精胚胎的培养和胚胎的鉴定第59页
            1.2.5 微量RNA的提取第59页
            1.2.6 TET3/H3K9me3的免疫荧光染色第59-60页
            1.2.7 特定基因启动子区域甲基化水平的检测第60页
            1.2.8 统计学分析第60-61页
        1.3 结果第61-72页
            1.3.1 GV期和MII期卵母细胞 5m C/5hm C免疫荧光染色第61页
            1.3.2 IVF附植前胚胎 5m C/5hm C含量动态变化第61-63页
            1.3.3 卵母细胞和IVF附植前胚胎TET与DNMT基因家族表达情况第63-65页
            1.3.4 配子和IVF附植前胚胎satellite I与 α-satellite甲基化动态变化第65页
            1.3.5 配子和IVF附植前胚胎印记基因H19甲基化动态变化第65-67页
            1.3.6 配子和IVF附植前胚胎全能性相关基因甲基化动态变化第67-68页
            1.3.7 IVF附植前胚胎全能性相关基因转录水平检测第68页
            1.3.8 GV期和MII期卵母细胞H3K3me3免疫荧光染色第68-70页
            1.3.9 IVF附植前胚胎H3K9me3含量动态变化第70-71页
            1.3.10 IVF附植前胚胎SUV39H1与SUV39H2基因转录水平检测第71-72页
        1.4 讨论第72-74页
        1.5 小结第74-75页
    第2章 牛体细胞核移附植前胚胎DNA甲基化动态变化的研究第75-91页
        2.1 材料试剂第76页
            2.1.1 材料第76页
            2.1.2 主要仪器和试剂第76页
            2.1.3 主要试剂及溶液配制第76页
        2.2 实验方法第76-78页
            2.2.1 卵巢的收集第76页
            2.2.2 卵母细胞的获取及体外成熟第76-77页
            2.2.3 体细胞核移植第77页
            2.2.4 微量RNA的提取第77页
            2.2.5 特定基因启动子区域甲基化水平的检测第77页
            2.2.6 TET3的免疫荧光染色第77页
            2.2.7 统计学分析第77-78页
        2.3 结果第78-89页
            2.3.1 SCNT附植前胚胎 5m C/5hm C含量动态变化第78-79页
            2.3.2 SCNT附植前胚胎TET和DNMT基因家族表达情况第79-82页
            2.3.3 供核细胞和SCNT囊胚satellite I、α-satellite甲基化水平第82页
            2.3.4 供核细胞和SCNT囊胚印记基因H19甲基化水平第82-83页
            2.3.5 供核细胞和SCNT囊胚全能性相关基因甲基化水平第83-84页
            2.3.6 供核细胞和SCNT囊胚全功能性相关基因转录水平第84页
            2.3.7 Vitamin C对SCNT附植前胚胎发育的影响第84-86页
            2.3.8 Vitamin C对牛SCNT囊胚特殊基因位点甲基化水平的影响第86-88页
            2.3.9 Vitamin C对牛SCNT囊胚全能性相关基因转录水平的影响第88-89页
        2.4 讨论第89-90页
        2.5 小结第90-91页
    第3章 DNA甲基转移酶抑制剂对牛孤雌胚胎发育影响的研究第91-101页
        3.1 材料试剂第92页
            3.1.1 材料第92页
            3.1.2 主要仪器和试剂第92页
            3.1.3 主要试剂及溶液配制第92页
        3.2 实验方法第92-94页
            3.2.1 卵巢的收集第92页
            3.2.2 卵母细胞的获取及体外成熟第92页
            3.2.3 孤雌激活与胚胎体外培养第92-93页
            3.2.4 微量RNA的提取第93页
            3.2.5 荧光定量PCR(RT-PCR)第93页
            3.2.6 特定基因启动子区域甲基化水平的检测第93页
            3.2.7 囊胚细胞凋亡检测第93页
            3.2.8 统计学分析第93-94页
        3.3 结果第94-98页
            3.3.1 DNMT抑制剂对牛附植前孤雌胚胎发育的影响第94页
            3.3.2 附植前孤雌胚胎DNMT基因家族表达情况第94-95页
            3.3.3 RG108对附植前孤雌胚胎DNMT基因家族表达的影响第95页
            3.3.4 RG108对牛孤雌胚胎NANOG基因表达和甲基化水平的影响第95-97页
            3.3.5 RG108对牛孤雌胚胎satellite I和 α-satellite甲基化水平的影响第97页
            3.3.6 RG108对牛孤雌囊胚凋亡情况的影响第97-98页
        3.4 讨论第98-100页
        3.5 小结第100-101页
结论第101-103页
参考文献第103-125页
附录第125-129页
导师简介第129-131页
作者简介第131-133页
攻读博士期间发表论文情况第133-135页
致谢第135页

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