| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5页 |
| 英文缩略词表 | 第8-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第9-34页 |
| 1.1 农业动物在人类生产实践中的重要作用 | 第9页 |
| 1.2 基因组学研究及其在农业动物遗传定位研究中的应用 | 第9-17页 |
| 1.2.1 基因组学的研究内容 | 第10页 |
| 1.2.2 基因组学的研究技术 | 第10-12页 |
| 1.2.3 农业动物遗传定位研究进展 | 第12-17页 |
| 1.3 结构变异与表型变异 | 第17-24页 |
| 1.3.1 结构变异 | 第17-18页 |
| 1.3.2 结构变异的研究方法 | 第18-21页 |
| 1.3.3 农业动物结构变异的研究进展 | 第21-22页 |
| 1.3.4 结构变异在表型变异形成中的功能与作用 | 第22-24页 |
| 1.4 羽毛及其变异研究 | 第24-31页 |
| 1.4.1 羽毛的发育 | 第25-27页 |
| 1.4.2 鸡中羽毛变异的研究进展 | 第27-28页 |
| 1.4.3 HOX基因在羽毛发育中的作用 | 第28-31页 |
| 1.5 本研究的目的与意义 | 第31-34页 |
| 1.5.1 鸡的重要研究价值 | 第31-32页 |
| 1.5.2 研究鸡胡须性状的重要意义 | 第32-34页 |
| 第二章 材料和方法 | 第34-56页 |
| 2.1 研究材料 | 第34-39页 |
| 2.1.1 实验群体 | 第34-35页 |
| 2.1.2 样本采集 | 第35页 |
| 2.1.3 主要实验仪器与耗材 | 第35-36页 |
| 2.1.4 主要试剂 | 第36-37页 |
| 2.1.5 试剂的配置 | 第37-39页 |
| 2.2 研究方法 | 第39-56页 |
| 2.2.1 技术路线 | 第39-40页 |
| 2.2.2 禽血DNA提取 | 第40页 |
| 2.2.3 组织样本RNA的提取与反转录 | 第40-41页 |
| 2.2.4 组织样本总蛋白提取与浓度测定 | 第41页 |
| 2.2.5 长片段PCR | 第41-42页 |
| 2.2.6 PCR产物的胶回收 | 第42页 |
| 2.2.7 染色体步移(Genome walking) | 第42-44页 |
| 2.2.8 Western Blot | 第44-45页 |
| 2.2.9 RACE | 第45-48页 |
| 2.2.10 质粒提取 | 第48-49页 |
| 2.2.11 荧光定量PCR | 第49-50页 |
| 2.2.12 地高辛(DIG)标记的RNA探针合成 | 第50-51页 |
| 2.2.13 全胚RNA原位杂交 | 第51-52页 |
| 2.2.14 SNP位点的基因分型 | 第52-56页 |
| 第三章 实验结果 | 第56-85页 |
| 3.1 鸡胡须性状的基因定位 | 第56-68页 |
| 3.1.1 全基因组关联分析 | 第56-58页 |
| 3.1.2 连锁分析及IBD定位 | 第58-59页 |
| 3.1.3 致因突变的发现 | 第59-64页 |
| 3.1.4 致因突变的验证 | 第64-66页 |
| 3.1.5 基因分型 | 第66-68页 |
| 3.2 定位区间内候选基因的表达与功能分析 | 第68-81页 |
| 3.2.1 RACE分析转录本变异 | 第69页 |
| 3.2.2 mRNA表达差异分析 | 第69-76页 |
| 3.2.3 原位杂交分析 | 第76-80页 |
| 3.2.4 蛋白差异表达分析 | 第80-81页 |
| 3.3 讨论 | 第81-85页 |
| 3.3.1 分型位点的解释与CNV1两个拷贝前后顺序的确定 | 第81-82页 |
| 3.3.2 候选基因功能分析 | 第82-83页 |
| 3.3.3 结构变异对HOX基因表达的影响 | 第83-84页 |
| 3.3.4 HOXB8参与调控胡须羽毛发育 | 第84-85页 |
| 第四章 结论 | 第85-86页 |
| 参考文献 | 第86-97页 |
| 附录 | 第97-104页 |
| 致谢 | 第104-106页 |
| 个人简介 | 第106页 |
