细菌必需基因的预测及进化特征的分析
| 摘要 | 第5-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-15页 |
| 1.1 必需基因及其生物学意义 | 第10页 |
| 1.2 细菌必需基因预测的发展 | 第10-13页 |
| 1.3 本文的主要研究工作 | 第13页 |
| 1.4 本文结构 | 第13-15页 |
| 第二章 细菌序列的组成特征及数据集 | 第15-22页 |
| 2.1 背景 | 第15-16页 |
| 2.2 材料与组成特征 | 第16-20页 |
| 2.2.1 细菌基因组序列 | 第16-17页 |
| 2.2.2 组成特征 | 第17-20页 |
| 2.3 建立数据集 | 第20页 |
| 2.4 本章小结 | 第20-22页 |
| 第三章 预测必需基因的理论方法 | 第22-45页 |
| 3.1 引言 | 第22页 |
| 3.2 原始分类方法 | 第22-28页 |
| 3.2.1 支持向量机 | 第22-26页 |
| 3.2.2 主成分回归 | 第26-28页 |
| 3.3 原始分类方法预测结果 | 第28-32页 |
| 3.3.1 支持向量机预测结果 | 第28-30页 |
| 3.3.2 主成分回归预测结果 | 第30-32页 |
| 3.4 原始分类方法的改进 | 第32-33页 |
| 3.4.1 支持向量机的改进 | 第32-33页 |
| 3.4.2 主成分回归的改进 | 第33页 |
| 3.5 改进分类方法预测结果 | 第33-38页 |
| 3.5.1 改进后支持向量机预测结果 | 第33-36页 |
| 3.5.2 改进后主成分回归预测结果 | 第36-38页 |
| 3.6 四种方法的比较 | 第38-41页 |
| 3.7 网上服务 | 第41-43页 |
| 3.8 本章小结 | 第43-45页 |
| 第四章 细菌进化特征的分析 | 第45-54页 |
| 4.1 背景 | 第45-46页 |
| 4.2 基因的功能性分析 | 第46-51页 |
| 4.2.1 数据来源 | 第47-48页 |
| 4.2.2 CAI的计算 | 第48-49页 |
| 4.2.3 基于实验的基因表达数据 | 第49页 |
| 4.2.4 方法和结果 | 第49-51页 |
| 4.3 基于水平转移基因的进化特征分析 | 第51-53页 |
| 4.3.1 方法和结论 | 第51-53页 |
| 4.4 本章小结 | 第53-54页 |
| 第五章 本文总结和未来展望 | 第54-57页 |
| 5.1 全文总结 | 第54-56页 |
| 5.2 未来工作展望 | 第56-57页 |
| 致谢 | 第57-58页 |
| 参考文献 | 第58-64页 |
| 硕士期间的研究成果 | 第64-65页 |
