原核生物基因组预测模型性能比较研究
| 摘要 | 第5-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-15页 |
| 1.1 研究背景与研究意义 | 第10-12页 |
| 1.1.1 原核生物基因组预测模型的发展 | 第10-11页 |
| 1.1.2 研究意义 | 第11-12页 |
| 1.2 与本文相关的生物学知识 | 第12-14页 |
| 1.3 本文研究内容与组织结构 | 第14-15页 |
| 第二章 基因重注释 | 第15-26页 |
| 2.1 按GC含量分布选择样本基因组 | 第15-16页 |
| 2.2 查找样本基因组新基因 | 第16-22页 |
| 2.2.1 Blast介绍 | 第16-17页 |
| 2.2.2 查找新基因方法 | 第17-22页 |
| 2.3 排除样本基因组非编码ORFs | 第22-25页 |
| 2.3.1 注释文件中的基因类型 | 第22页 |
| 2.3.2 非编码ORFs的识别 | 第22-25页 |
| 2.4 小结 | 第25-26页 |
| 第三章 预测模型性能比较 | 第26-38页 |
| 3.1 预测性能评价参数 | 第26页 |
| 3.2 独立预测模型结果与分析 | 第26-32页 |
| 3.2.1 基因预测结果准确度比较与分析 | 第29-30页 |
| 3.2.2 基因预测结果额外预测率比较和分析 | 第30-32页 |
| 3.2.3 小结 | 第32页 |
| 3.3 联合预测模型结果与分析 | 第32-38页 |
| 3.3.1 联合预测结果中的最佳组合研究 | 第33-35页 |
| 3.3.2 联合预测与独立预测最佳结果的对比 | 第35-36页 |
| 3.3.3 小结 | 第36-38页 |
| 第四章 相关自动化工具和在线服务的开发 | 第38-47页 |
| 4.1 批量基因重注释工具的设计 | 第38-42页 |
| 4.1.1 流程设计 | 第38-40页 |
| 4.1.2 功能实现 | 第40-42页 |
| 4.2 基因预测在线服务的开发 | 第42-46页 |
| 4.2.1 流程设计 | 第42-45页 |
| 4.2.2 功能实现 | 第45-46页 |
| 4.3 小结 | 第46-47页 |
| 第五章 总结和展望 | 第47-49页 |
| 5.1 总结 | 第47-48页 |
| 5.2 展望 | 第48-49页 |
| 致谢 | 第49-50页 |
| 参考文献 | 第50-53页 |
| 附录 | 第53-78页 |
| 攻读硕士学位期间取得的成果 | 第78-79页 |
