| 摘要 | 第5-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 第一章 研究背景与现状 | 第13-26页 |
| 1 蛱蝶概述 | 第13-18页 |
| 1.1 蛱蝶科生物学特征及系统分类 | 第13-14页 |
| 1.2 蛱蝶科系统学研究现状 | 第14-17页 |
| 1.3 蛱蝶科主要类群起源与进化研究现状 | 第17-18页 |
| 2 昆虫线粒体基因组 | 第18-19页 |
| 2.1 鳞翅目昆虫线粒体基因组结构和特点 | 第18-19页 |
| 2.2 线粒体基因组在鳞翅目昆虫分子系统学研究中的应用 | 第19页 |
| 3 分子系统学 | 第19-22页 |
| 3.1 分子系统学概况 | 第19-20页 |
| 3.2 系统发育树构建方法 | 第20-22页 |
| 4 谱系发育年代学与分子钟 | 第22-23页 |
| 5 生物地理学 | 第23-24页 |
| 5.1 生物地理学定义及其发展 | 第23页 |
| 5.2 历史生物地理学概况 | 第23-24页 |
| 6. 本研究的目的和意义 | 第24-26页 |
| 第二章 八种蛱蝶线粒体基因组全序列的测定和比较分析 | 第26-47页 |
| 1 材料与方法 | 第27-29页 |
| 1.1 实验材料 | 第27页 |
| 1.2 实验方法 | 第27-29页 |
| 2 结果与讨论 | 第29-47页 |
| 2.1 线粒体基因组结构与组成 | 第29-37页 |
| 2.2 蛋白质编码基因（PCGs） | 第37-43页 |
| 2.3 转运RNA（t RNA）基因和核糖体RNA（r RNA）基因 | 第43-44页 |
| 2.4 A+T丰富区（A+T-rich region） | 第44-47页 |
| 第三章 基于线粒体基因组全序列数据分析蛱蝶类主要类群间的系统发生关系 | 第47-62页 |
| 1 材料与方法 | 第48-51页 |
| 1.1 材料 | 第48-49页 |
| 1.2 数据处理 | 第49-51页 |
| 2 结果与讨论 | 第51-62页 |
| 2.1 序列组成与变异 | 第51-53页 |
| 2.2 分子系统发生分析 | 第53-62页 |
| 第四章 基于三个基因联合数据探讨蛱蝶亚科主要类群的系统发生关系 | 第62-87页 |
| 1 材料与方法 | 第65-75页 |
| 1.1 实验材料 | 第65-74页 |
| 1.2 实验方法 | 第74-75页 |
| 2 结果 | 第75-82页 |
| 2.1 序列组成与变异 | 第75-77页 |
| 2.2 分子系统树 | 第77-82页 |
| 3 讨论 | 第82-87页 |
| 3.1 网蛱蝶族的系统发生关系 | 第82-83页 |
| 3.2 眼蛱蝶族的分类界限与系统发生关系 | 第83页 |
| 3.3 维蛱蝶族的分类界限与系统发生关系 | 第83-84页 |
| 3.4 枯叶蛱蝶族的分类界限与系统发生关系 | 第84页 |
| 3.5 蛱蝶族各属间的系统发生关系 | 第84-85页 |
| 3.6 黄肱蛱蝶族的分类界限与系统发生地位 | 第85-87页 |
| 第五章 蛱蝶亚科（鳞翅目：蛱蝶科）主要类群的历史生物地理学研究 | 第87-96页 |
| 1 研究方法 | 第88-89页 |
| 1.1 谱系年代学分析 | 第88-89页 |
| 1.2 生物地理学分析 | 第89页 |
| 2 结果与分析 | 第89-93页 |
| 2.1 分歧时间的估算 | 第89-90页 |
| 2.2 系统地理学分析 | 第90-93页 |
| 3. 讨论 | 第93-96页 |
| 参考文献（References） | 第96-111页 |
| 致谢 | 第111-112页 |
| 附：攻读博士学位期间论文发表及获奖情况 | 第112页 |
