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Toehold介导的DNA催化链替换反应及DNA/RNA纳米结构组装

摘要第5-7页
ABSTRACT第7-8页
第一章 绪论第22-46页
    1.1 纳米尺度材料的发展与挑战第22-23页
    1.2 DNA的特性及其作为纳米材料的特点第23-25页
        1.2.1 DNA的基本化学结构和特性第23-24页
        1.2.2 DNA的杂交第24-25页
        1.2.3 DNA作为纳米材料的应用第25页
    1.3 DNA链替换反应第25-28页
    1.4 催化DNA链替换反应的发展、应用及挑战第28-31页
    1.5 DNA在结构纳米科技中的发展及应用第31-37页
    1.6 RNA纳米技术的发展和应用第37-38页
    1.7 本文所涉及的相关技术和仪器第38-44页
        1.7.1 荧光共振能量转移第38-39页
        1.7.2 纳米金第39-41页
        1.7.3 原子力显微镜第41-44页
    1.8 本论文的研究方向及内容第44-46页
第二章 DNA光子纳米线进行多组份目标链检测第46-68页
    2.2 引言第46-49页
        2.2.1 DNA链替换反应的发展与挑战第46-47页
        2.2.2 多颜色FRET的特点第47-49页
    2.3 实验部分第49-53页
        2.3.1 实验材料第49-51页
        2.3.2 三组份DNA光子纳米线的组装第51页
        2.3.3 荧光光谱扫描测试设计的反应能力第51页
        2.3.4 浓度梯度实验第51页
        2.3.5 复合物L-A1-A2的退火反应第51页
        2.3.6 反应动力学实验第51页
        2.3.7 基于一种目标链存在的情况下反应体系的浓度梯度实验和反应动力学检测第51-52页
        2.3.8 荧光显色实验第52页
        2.3.9 改装的DNA光子纳米线系统的功能化检测第52页
        2.3.10 活细胞成像实验第52-53页
        2.3.11 利用流式细胞术进行活细胞中单检测实验第53页
    2.4 结果与讨论第53-66页
        2.4.1 非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测复合物L-P1-P2的纯度第54-55页
        2.4.2 DNA光子纳米线进行多组份目标物检测第55-56页
        2.4.3 多组份目标物检测的灵敏度测试第56-58页
        2.4.4 多组份目标物检测的反应动力学研究第58-59页
        2.4.5 基于一种目标链存在的情况下反应体系的浓度梯度实验和反应动力学检测第59-60页
        2.4.6 改装的DNA光子纳米线系统的功能化检测第60-63页
        2.4.7 活细胞成像实验及流式细胞术进行活细胞中单检测实验第63-66页
    2.5 本章小结第66-68页
第三章 调节目标物检测中的泄露问题第68-88页
    3.2 引言第68-72页
        3.2.1 催化DNA链替换反应的发展及挑战第68-70页
        3.2.2 AuNps-DNA的发展及挑战第70-72页
    3.3 实验部分第72-74页
        3.3.1 实验材料第72-73页
        3.3.2 AuNPs接枝DNA第73页
        3.3.3 通过退火得到NP_Protector上形成带有荧光链Reporter的双链DNA第73页
        3.3.4 荧光检测第73页
        3.3.5 目标链检测特异性的研究第73页
        3.3.6 对比经典的溶液中催化TMSDR和我们设计的模型第73-74页
    3.4 结果与讨论第74-86页
        3.4.1 AuNPs的接枝率第75-76页
        3.4.2 探索纳米金表面和DNA有效序列之间合适的长度第76-77页
        3.4.3 探索合适的toehold策略第77-78页
        3.4.4 探索NP Fuel的使用量第78-79页
        3.4.5 该模型进行目标物检测的灵敏度研究第79-83页
        3.4.6 新模型的反应动力学研究第83页
        3.4.7 对比溶液中游离催化TMSDR的泄露第83-84页
        3.4.8 识别单核苷酸多态性的研究第84-86页
    3.5 本章小结第86-88页
第四章 单链核酸折纸的构建第88-100页
    4.2 引言第88-91页
    4.3 实验部分第91-93页
        4.3.1 实验材料第91-92页
        4.3.2 体外PCR样品准备第92页
        4.3.3 PCR样品纯化第92页
        4.3.4 核酸外切实验第92页
        4.3.5 T7体外转录第92页
        4.3.6 折叠组装反应第92-93页
        4.3.7 AFM成像第93页
        4.3.8 凝胶电泳分析第93页
    4.4 结果与讨论第93-99页
        4.4.1 DNA单链折纸第95-96页
        4.4.2 DNA单链折纸的可寻址性第96-98页
        4.4.3 RNA单链折纸第98-99页
    4.5 本章小结第99-100页
第五章 DNA纳米结构的动态可控第100-110页
    5.2 引言第100-102页
    5.3 实验部分第102-104页
        5.3.1 实验材料第102-103页
        5.3.2 上游反应发卡结构的形成第103页
        5.3.3 下游DNA十字形结构的形成第103页
        5.3.4 上游DNA催化链替换反应的检测第103页
        5.3.5 DNA十字形结构的催组装第103-104页
        5.3.6 DNA十字结构组装的直接热退火反应第104页
    5.4 结果与讨论第104-109页
        5.4.1 上游催化链替换反应的效果第105-107页
        5.4.2 下游DNA十字形纳米结构的组装第107-109页
    5.5 本章小结第109-110页
第六章 总结与展望第110-116页
    6.1 总结第111-112页
    6.2 结论第112-113页
    6.3 展望第113-116页
参考文献第116-126页
致谢第126-128页
在读期间发表的学术论文与取得的研究成果第128-129页

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