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基于高通量测序的东湖不同富营养化区域细菌群落结构研究

摘要第6-8页
Abstract第8-9页
缩略语表第10-11页
1. 前言第11-21页
    1.1 湖泊富营养化第11-13页
        1.1.1 湖泊富营养的现状第11页
        1.1.2 湖泊富营养化的危害第11-12页
        1.1.3 湖泊富营养化的防治第12-13页
    1.2 细菌在湖泊生态系统中的作用第13-14页
    1.3 湖泊的细菌群落结构概述第14-15页
    1.4 细菌群落结构的研究方法和进展第15-19页
        1.4.1 16S rDNA克隆文库第15-16页
        1.4.2 变性梯度凝胶电泳第16-17页
        1.4.3 T-RFLP第17-18页
        1.4.4 高通量测序第18-19页
    1.5 东湖概况第19页
    1.6 研究目的与意义第19-20页
    1.7 课题的研究路线第20-21页
2. 材料和方法第21-30页
    2.1 材料第21-22页
        2.1.1 试剂与试剂盒第21页
        2.1.2 实验仪器第21-22页
    2.2 实验方法第22-30页
        2.2.1 实验分组和样品的采集第22-24页
        2.2.2 水体理化指标检测方法第24-25页
        2.2.3 底泥理化性质检测方法第25页
        2.2.4 样品细菌基因组总DNA的提取第25-27页
        2.2.5 Illumina MiSeq高通量测序第27-29页
        2.2.6 其他数据分析第29-30页
3. 结果与分析第30-65页
    3.1 东湖的环境参数第30-33页
        3.1.1 水体环境参数第30-31页
        3.1.2 底泥环境参数第31-33页
        3.1.3 水体和底泥营养盐的关系第33页
    3.2 测序数据统计第33-35页
    3.3 共有/独有OTU分析第35-36页
    3.4 α-多样性分析第36-38页
        3.4.1 水体的 α-多样性指数第36-37页
        3.4.2 底泥的 α-多样性指数第37-38页
    3.5 细菌的群落结构分析第38-51页
        3.5.1 水体细菌门水平的群落结构第38-41页
        3.5.2 底泥细菌门水平的群落结构第41-45页
        3.5.3 水体细菌属水平的群落结构第45-48页
        3.5.4 底泥细菌属水平的群落结构第48-51页
    3.6 主成分分析第51-56页
        3.6.1 水体细菌多样性的主成分分析第52-54页
        3.6.2 底泥细菌多样性的主成分分析第54-56页
    3.7 组内不同时间样本分类学组成的差异分析第56-62页
        3.7.1 水体细菌的差异分析第56-59页
        3.7.2 底泥细菌的差异分析第59-62页
    3.8 RDA分析第62-65页
        3.8.1 水体细菌群落组成与环境因子的相关性分析第62-63页
        3.8.2 底泥细菌群落组成与环境因子的相关性分析第63-65页
4. 讨论第65-70页
    4.1 东湖不同富营养化湖区水体和底泥细菌的多样性第65页
    4.2 东湖不同富营养化湖区水体和底泥细菌的群落结构第65-68页
    4.3 环境因子与细菌群落结构的关系第68-70页
5. 总结与展望第70-71页
参考文献第71-81页
攻读硕士期间的学术成果第81-82页
致谢第82页

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