| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第1章 绪论 | 第11-16页 |
| 1.1 引言 | 第11-12页 |
| 1.2 CDK2 以及抑制剂的介绍 | 第12-13页 |
| 1.2.1 CDK2 简介 | 第12页 |
| 1.2.2 CDK2 抑制剂的分类 | 第12页 |
| 1.2.3 CDK2 抑制剂的研究现状 | 第12-13页 |
| 1.3 嘧啶类抑制剂的研究进展 | 第13-14页 |
| 1.3.1 CDK2 嘧啶类抑制剂的分类 | 第13页 |
| 1.3.2 CDK2 嘧啶类抑制剂的研究历程 | 第13-14页 |
| 1.4 嘌呤类抑制剂的研究进展 | 第14页 |
| 1.4.1 嘌呤类抑制剂的研究历程 | 第14页 |
| 1.5 本章小结 | 第14-16页 |
| 第2章 理论基础及计算方法 | 第16-22页 |
| 2.1 分子对接 | 第16-18页 |
| 2.1.1 分子对接方法的分类 | 第16-17页 |
| 2.1.2 常用分子对接软件 | 第17-18页 |
| 2.2 分子动力学模拟 | 第18-21页 |
| 2.2.1 分子动力学的发展历程 | 第18页 |
| 2.2.2 分子力场 | 第18-19页 |
| 2.2.3 分子动力学模拟的算法 | 第19-20页 |
| 2.2.4 分子动力学模拟的条件 | 第20-21页 |
| 2.3 本章小结 | 第21-22页 |
| 第3章 CDK2 与嘧啶类抑制剂的分子对接与动力学模拟 | 第22-40页 |
| 3.1 引言 | 第22页 |
| 3.2 分子对接 | 第22-29页 |
| 3.2.1 嘧啶并[4，5-d]嘧啶衍生物的选取与准备 | 第22-23页 |
| 3.2.2 CDK2 的准备 | 第23-25页 |
| 3.2.3 分子对接 | 第25页 |
| 3.2.4 分子对接结果 | 第25-28页 |
| 3.2.5 分子动力学模拟的步骤 | 第28-29页 |
| 3.2.6 结合自由能的计算 | 第29页 |
| 3.3 分子动力学模拟结果与讨论 | 第29-38页 |
| 3.3.1 RMSDs | 第29-31页 |
| 3.3.2 氢键分析 | 第31-35页 |
| 3.3.3 结合自由能 | 第35页 |
| 3.3.4 能量分解 | 第35-38页 |
| 3.4 本章小结 | 第38-40页 |
| 第4章 嘌呤类抑制剂与 CDK2 分子对接及分子动力学模拟 | 第40-56页 |
| 4.1 引言 | 第40页 |
| 4.2 分子对接 | 第40-46页 |
| 4.2.1 2，6，9-三取代嘌呤的选取与准备 | 第40-42页 |
| 4.2.2 CDK2 受体的准备 | 第42页 |
| 4.2.3 分子对接 | 第42页 |
| 4.2.4 分子对接结果 | 第42-46页 |
| 4.3 分子动力学模拟结果与讨论 | 第46-54页 |
| 4.3.1 RMSDs | 第46-47页 |
| 4.3.2 氢键分析 | 第47-51页 |
| 4.3.3 结合自由能 | 第51页 |
| 4.3.4 能量分解 | 第51-54页 |
| 4.4 本章小结 | 第54-56页 |
| 第5章 新型 2，6，9-三取代嘌呤抑制剂的设计 | 第56-61页 |
| 5.1 设计的依据 | 第56页 |
| 5.2 2，6，9-三取代嘌呤的设计 | 第56-57页 |
| 5.3 分子对接与动力学模拟 | 第57页 |
| 5.4 结果与讨论 | 第57-60页 |
| 5.4.1 RMSDs | 第57-58页 |
| 5.4.2 氢键分析 | 第58-59页 |
| 5.4.3 新设计分子与嘌呤类抑制剂的对比 | 第59-60页 |
| 5.5 本章小结 | 第60-61页 |
| 结论 | 第61-62页 |
| 参考文献 | 第62-69页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第69-70页 |
| 致谢 | 第70页 |
