| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-8页 |
| 引言 | 第13-28页 |
| 1 线粒体DNA的组织结构与特点 | 第13-14页 |
| 1.1 线粒体DNA的特征 | 第13-14页 |
| 2 线粒体基因组序列的测序方法 | 第14-16页 |
| 2.1 常规PCR测序 | 第15页 |
| 2.2 基于预扩增mtDNA的高通量方法 | 第15页 |
| 2.3 无需预扩增mtDNA的高通量方法 | 第15页 |
| 2.4 从转录组数据中获得线粒体基因组序列的方法 | 第15-16页 |
| 3 分子系统学研究 | 第16-22页 |
| 3.1 分子系统学先前的研究方法 | 第16-17页 |
| 3.2 目前分子系统学的研究方法 | 第17-22页 |
| 4 分子系统发育分析的基因选择 | 第22-25页 |
| 4.1 18S rDNA基因和COI基因的联合应用 | 第23-24页 |
| 4.2 16S rRNA和COI序列在分类阶元上的应用 | 第24页 |
| 4.3 线粒体全基因组的使用 | 第24-25页 |
| 5 选题依据及研究目的意义 | 第25-28页 |
| 5.1 选题依据 | 第25-26页 |
| 5.2 研究目的及意义 | 第26-28页 |
| 第一章 哈氏仿对虾线粒体 16S rRNA和COI基因的序列比较及其与仿对虾属的系统进化分析 | 第28-39页 |
| 1 材料与方法 | 第29-30页 |
| 1.1 实验材料 | 第29页 |
| 1.2 基因组DNA的提取及检测 | 第29页 |
| 1.3 PCR扩增及质量鉴定 | 第29-30页 |
| 1.4 序列分析 | 第30页 |
| 2 结果 | 第30-36页 |
| 2.1 16S rRNA和COI基因片段的序列分析 | 第30-32页 |
| 2.2 基于 16S rRNA基因序列的不同物种间的遗传距离及系统进化分析 | 第32-33页 |
| 2.3 基于COI基因序列的不同物种间的遗传距离及系统进化分析 | 第33-36页 |
| 3 讨论 | 第36-39页 |
| 3.1 哈氏仿对虾 16S rRNA和COI基因片段的比较分析 | 第36-37页 |
| 3.2 遗传距离及系统进化分析 | 第37-39页 |
| 第二章 假长缝拟对虾线粒体 16S rRNA和COI基因的序列比较及其与拟对虾属系统进化分析 | 第39-51页 |
| 1 材料与方法 | 第40页 |
| 1.1 实验材料 | 第40页 |
| 1.2 基因组DNA的提取及检测 | 第40页 |
| 1.3 PCR扩增及质量鉴定 | 第40页 |
| 1.4 序列分析 | 第40页 |
| 2 结果 | 第40-48页 |
| 2.1 16S rRNA和COI基因片段的PCR扩增 | 第40页 |
| 2.2 16S rRNA和COI基因片段的序列分析 | 第40-42页 |
| 2.3 基于 16S rRNA基因序列的不同物种间的遗传距离及系统进化分析 | 第42-44页 |
| 2.4 基于COI基因序列的不同物种间的遗传距离及系统进化分析 | 第44-48页 |
| 3 讨论 | 第48-51页 |
| 3.1 假长缝拟对虾 16S rRNA和COI基因片段的比较分析 | 第48-49页 |
| 3.2 遗传距离及系统进化分析 | 第49-51页 |
| 第三章 高脊管鞭虾、凹管鞭虾和鹰爪虾线粒体 16S rRNA和COI基因序列比较及其与对虾科的系统进化分析 | 第51-67页 |
| 1 材料与方法 | 第52-53页 |
| 1.1 实验材料 | 第52-53页 |
| 1.2 基因组DNA的提取及检测 | 第53页 |
| 1.3 PCR扩增及质量鉴定 | 第53页 |
| 1.4 序列分析 | 第53页 |
| 2 结果 | 第53-64页 |
| 2.1 16S rRNA和COI基因片段的PCR扩增 | 第53页 |
| 2.2 16S rRNA和COI基因片段的序列分析 | 第53-57页 |
| 2.3 基于 16S rRNA基因序列的不同物种间的遗传距离及系统进化分析 | 第57-60页 |
| 2.4 基于COI基因序列的不同物种间的遗传距离及系统进化分析 | 第60-64页 |
| 3 讨论 | 第64-67页 |
| 3.1 高脊管鞭虾、凹管鞭虾和鹰爪虾 16S rRNA和COI基因片段的比较分析 | 第64-65页 |
| 3.2 遗传距离及系统进化分析 | 第65-67页 |
| 第四章 哈氏仿对虾和高脊管鞭虾的线粒体全基因组 | 第67-93页 |
| 1 材料与方法 | 第67-72页 |
| 1.1 实验材料 | 第67-68页 |
| 1.2 实验方法 | 第68-72页 |
| 2 实验结果和讨论 | 第72-93页 |
| 2.1 线粒体基因组的基本特征 | 第72-91页 |
| 2.2 基于线粒体全序列探讨哈氏仿对虾和高脊管鞭虾的系统发生 | 第91-93页 |
| 参考文献 | 第93-99页 |
| 硕士期间发表的论文与成果 | 第99-100页 |
| 致谢 | 第100页 |
