摘要 | 第6-8页 |
ABSTRACT | 第8-10页 |
第一章 绪论 | 第14-31页 |
1.1 抗抑郁药概述 | 第14-17页 |
1.1.1 抗抑郁药的使用现状 | 第14-15页 |
1.1.2 抗抑郁药种类 | 第15-17页 |
1.2 阿米替林、氟西汀和米安色林概述 | 第17-21页 |
1.2.1 阿米替林、氟西汀和米安色林简介 | 第17页 |
1.2.2 阿米替林、氟西汀和米安色林在环境中的分布 | 第17-21页 |
1.3 阿米替林、氟西汀和米安色林的生物毒性研究现状 | 第21-22页 |
1.3.1 行为及生殖能力 | 第21页 |
1.3.2 神经及内分泌系统 | 第21-22页 |
1.3.3 免疫系统 | 第22页 |
1.4 RNA-Seq技术 | 第22-26页 |
1.4.1 测序技术的发展历程 | 第23页 |
1.4.2 RNA-Seq技术概述 | 第23-25页 |
1.4.3 RNA-Seq技术在差异表达基因研究方面的优势 | 第25-26页 |
1.5 研究目的与意义 | 第26-27页 |
1.5.1 斑马鱼的选取 | 第26页 |
1.5.2 本研究的目的和意义 | 第26-27页 |
1.6 研究内容和技术路线图 | 第27-30页 |
1.7 课题来源 | 第30-31页 |
第二章 抗抑郁药暴露对斑马鱼胚胎生长发育指标的影响 | 第31-45页 |
2.1 材料与方法 | 第31-36页 |
2.1.1 主要仪器与设备 | 第31-32页 |
2.1.2 主要药品及试剂 | 第32页 |
2.1.3 实验动物及饲养条件 | 第32页 |
2.1.4 实验设计 | 第32-33页 |
2.1.5 样品采集 | 第33页 |
2.1.6 总RNA提取 | 第33-36页 |
2.1.7 数据处理 | 第36页 |
2.2 实验结果与讨论 | 第36-44页 |
2.2.1 斑马鱼胚胎发育情况 | 第36页 |
2.2.2 斑马鱼胚胎孵化率 | 第36-37页 |
2.2.3 斑马鱼胚胎存活率 | 第37-38页 |
2.2.4 斑马鱼幼鱼体长 | 第38-40页 |
2.2.5 斑马鱼幼鱼RNA样品 | 第40-44页 |
2.3 本章小结 | 第44-45页 |
第三章 斑马鱼胚胎在抗抑郁药暴露后的RNA-Seq分析 | 第45-65页 |
3.1 实验流程及分析方法 | 第45-50页 |
3.1.1 RNA-Seq测序实验流程 | 第45-46页 |
3.1.2 测序数据质量控制 | 第46-47页 |
3.1.3 RNA-Seq数据与参考基因组序列比对 | 第47页 |
3.1.4 RNA-Seq文库质量评估 | 第47-48页 |
3.1.5 基因表达量分析 | 第48页 |
3.1.6 差异表达基因筛选分析 | 第48-49页 |
3.1.7 差异表达基因GO分类 | 第49页 |
3.1.8 差异表达基因KEGG注释 | 第49-50页 |
3.2 实验结果与讨论 | 第50-63页 |
3.2.1 测序数据及其质量控制 | 第50-51页 |
3.2.2 RNA-Seq数据与参考基因组序列比对 | 第51-53页 |
3.2.3 RNA-Seq文库质量评估 | 第53-55页 |
3.2.4 基因表达量分析 | 第55-57页 |
3.2.5 差异表达基因筛选分析 | 第57-61页 |
3.2.6 差异表达基因GO分类 | 第61-63页 |
3.2.7 差异表达基因KEGG注释 | 第63页 |
3.3 本章小结 | 第63-65页 |
第四章 RNA-Seq差异表达基因的验证及分析 | 第65-91页 |
4.1 材料与方法 | 第65-73页 |
4.1.1 主要仪器与设备 | 第65页 |
4.1.2 主要药品及试剂 | 第65-66页 |
4.1.3 实验动物及饲养条件 | 第66页 |
4.1.4 实验设计 | 第66页 |
4.1.5 样品采集 | 第66页 |
4.1.6 总RNA提取 | 第66-68页 |
4.1.7 cDNA模板合成 | 第68页 |
4.1.8 基因引物验证 | 第68-72页 |
4.1.9 抗抑郁药暴露后基因qRT-PCR分析 | 第72-73页 |
4.1.10 数据处理 | 第73页 |
4.2 实验结果与讨论 | 第73-90页 |
4.2.1 斑马鱼胚胎或幼鱼生理指标 | 第73-74页 |
4.2.2 斑马鱼幼鱼RNA样品 | 第74-75页 |
4.2.3 目的基因引物验证 | 第75-80页 |
4.2.4 RNA-Seq测序结果中差异表达基因的验证 | 第80-85页 |
4.2.5 抗抑郁药暴露对斑马鱼幼鱼的毒性评价 | 第85-90页 |
4.3 本章小结 | 第90-91页 |
第五章 结论与展望 | 第91-94页 |
5.1 研究结论 | 第91-92页 |
5.2 研究展望 | 第92-94页 |
参考文献 | 第94-102页 |
参与课题与科研成果 | 第102-104页 |
致谢 | 第104-105页 |